Лекарственная устойчивость ВИЧ-1 среди пациентов без опыта антиретровирусной терапии в Северо-Кавказском федеральном округе


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2025.15.3.28-34

Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Лаповок И.А., Колпаков Д.С., Суладзе А.Г., Бекмурзиева Л.К., Гандалоев И.И., Сулейманов И.З., Муртазалиев Х.Х., Дальцаева М.К., Ртищева Л.В., Шунгарова О.А., Бобков В.Г., Бобкова М.Р., Акимкин В.Г.

1) Центральный НИИ эпидемиологии, Москва, Россия; 2) Ростовский НИИ микробиологии и паразитологии, Ростов-на-Дону, Россия; 3) Республиканский центр по профилактике и борьбе со СПИДом и другими инфекционными заболеваниями, Назрань, Республика Ингушетия, Россия; 4) Республиканский клинический центр инфекционных болезней, профилактики и борьбы со СПИД, Грозный, Чеченская Республика, Россия; 5) Карачаево-Черкесская республиканская инфекционная клиническая больница и Центр по профилактике и борьбе со СПИДом, Черкесск, Карачаево-Черкесская Республика, Россия; 6) НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова, Москва, Россия
Цель исследования. Изучение структуры и уровня распространенности лекарственной устойчивости (ЛУ) ВИЧ-1 среди пациентов без опыта антиретровирусной терапии (АРТ), проживающих на территории Северо-Кавказского федерального округа (СКФО).
Материалы и методы. Проанализированы нуклеотидные последовательности ВИЧ-1 и сопутствующая клинико-эпидемиологическая информация от 122 ВИЧ-инфицированных пациентов без опыта АРТ, проживающих на территории СКФО, полученные в период с 2010 по 2024 г. Определены мутации резистентности и прогностическая ЛУ ВИЧ-1 с использованием базы данных Стэнфордского университета HIVdb (v. 9.6). Выявлены молекулярные кластеры ВИЧ-1 с порогом генетической дистанции менее 2,0% с помощью инструмента MicrobeTrace.
Результаты. ЛУ ВИЧ-1 была обнаружена у 27,9% пациентов, наиболее часто к препаратам класса ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы (ННИОТ) – невирапину (NVP) (23,0%) и эфавирензу (EFV) (21,3%). Распространенность мутаций, значимых для надзора, составила 22,1%. В результате анализа молекулярных кластеров было установлено, что высокая распространенность ЛУ ВИЧ-1 в исследуемой выборке обусловлена передачей вариантов ВИЧ-1, содержащих мутации K103N/S, что указывает на проблему передаваемой ЛУ ВИЧ-1 в округе. При этом в результате оценки ЛУ ВИЧ-1 у эпидемиологически несвязанных лиц было показано, что распространенность первичной ЛУ ВИЧ-1 и мутаций, значимых для надзора, составила 16,5 и 9,4% соответственно.
Заключение. Продемонстрирован высокий риск распространения первичной резистентности ВИЧ-1 к ННИОТ 1-го поколения в СКФО, что требует принятия мер по предупреждению возникновения и дальнейшего распространения ЛУ-вариантов ВИЧ-1.
Ключевые слова: Северо-Кавказский федеральный округ, кластеры передачи, молекулярные кластеры, мутации резистентности, ВИЧ-1, лекарственная устойчивость, антиретровирусная терапия
Полный текст статьи доступен
в "Библиотеке Врача"

Литература

1. Bertagnolio S., Hermans L., Jordan M.R., Avila-Rios S., Iwuji C., Derache A. et al. Clinical Impact of Pretreatment Human Immunodeficiency Virus Drug Resistance in People Initiating Nonnucleoside Reverse Transcriptase Inhibitor–Containing Antiretroviral Therapy: A Systematic Review and Meta-analysis. J. Infect. Dis. 2021; 224(3): 377–388. DOI: 10.1093/infdis/jiaa683


2. Cambiano V., Bertagnolio S., Jordan M.R., Lundgren J.D., Phillips A. Transmission of drug resistant HIV and its potential impact on mortality and treatment outcomes in resource-limited settings. J. Infect. Dis. 2013; 207(Suppl 2): 557–562. DOI: 10.1093/infdis/jit111


3. Kireev D., Kirichenko A., Lebedev A., Bobkova M. Alarming Rise of Primary HIV Drug Resistance in Major Regions of Russia. Curr. HIV Res. 2023; 21(6): 347–353. DOI: 10.2174/011570162X271430231201075335


4. Kirichenko A., Kireev D., Lapovok I., Shlykova A., Lopatukhin A., Pokrovskaya A. et al. HIV-1 Drug Resistance among Treatment-Naïve Patients in Russia: Analysis of the National Database, 2006-2022. Viruses 2023; 15(4): 991. DOI: 10.3390/v15040991


5. Wertheim J.O., Kosakovsky Pond S.L., Forgione L.A., Mehta S.R., Murrell B., Shah S. et al. Social and Genetic Networks of HIV-1 Transmission in New York City. PLoS Pathog. 2017; 13(1): e1006000. DOI: 10.1371/journal.ppat.1006000


6. Melikian G.L., Rhee S.Y., Varghese V., Porter D., White K., Taylor J. et al. Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor (NNRTI) cross-resistance: implications for preclinical evaluation of novel NNRTIs and clinical genotypic resistance testing. J. Antimicrob. Chemother. 2014; 69(1): 12–20. DOI: 10.1093/jac/dkt316


7. Xu H.-T., Colby-Germinario S.P., Asahchop E.L., Oliveira M., McCallum M., Schader S.M. et al. Effect of Mutations at Position E138 in HIV-1 Reverse Transcriptase and Their Interactions with the M184I Mutation on Defining Patterns of Resistance to Nonnucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors Rilpivirine and Etravirine. Antimicrob. Agents Chemother. 2013; 57(7): 3100–3109. DOI: 10.1128/AAC.00344-13/


8. Porter D.P., Toma J., Tan Y., Solberg O., Cai S., Kulkarni R. et al. Clinical Outcomes of Virologically-Suppressed Patients with Pre-existing HIV-1 Drug Resistance Mutations Switching to Rilpivirine/Emtricitabine/Tenofovir Disoproxil Fumarate in the SPIRIT Study. HIV Clin. Trials. 2016; 17(1): 29–37. DOI: 10.1080/15284336.2015.1115585


9. Kuznetsova A., Lebedev A., Gromov K., Kazennova E., Zazzi M., Incardona F. et al. Pre‐existing singleton E138A mutations in the reverse transcriptase gene do not affect the efficacy of first‐line antiretroviral therapy regimens using rilpivirine in human immunodeficiency virus‐infected patients. Clin. Case Rep. 2022; 10(2): e05373. DOI: 10.1002/ccr3.5373


10. Reuman E.C., Rhee S.Y., Holmes S.P., Shafer R.W. Constrained patterns of covariation and clustering of HIV-1 non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor resistance mutations. J. Antimicrob. Chemother. 2010; 65(7): 1477–1485. DOI: 10.1093/jac/dkq140


11. Hance A.J, Lemiale V., Izopet J., Lecossier D., Joly V., Massip P. et al. Changes in human immunodeficiency virus type 1 populations after treatment interruption in patients failing antiretroviral therapy. J. Virol. 2001; 75: 6410–6417. DOI: 10.1128/jvi.75.14.6410-6417.2001


12. Rhee S.Y., Tzou P.L., Shafer R.W. Temporal Trends in HIV-1 Mutations Used for the Surveillance of Transmitted Drug Resistance. Viruses 2021; 13(5): 879. DOI: 10.3390/v13050879


13. Kühnert D., Kouyos R., Shirreff G., Pečerska J., Scherrer A.U., Böni J. et al. Quantifying the fitness cost of HIV-1 drug resistance mutations through phylodynamics. PLoS Pathog. 2018; 14(2): e1006895. DOI: 10.1371/journal.ppat.1006895


14. Wertheim J.O., Oster A.M., Johnson J.A., Switzer W.M., Saduvala N., Hernandez A.L. et al. Transmission fitness of drug-resistant HIV revealed in a surveillance system transmission network. Virus Evol. 2017; 3(1): vex008. DOI: 10.1093/ve/vex008


Об авторах / Для корреспонденции

Кириченко Алина Алексеевна – к.м.н., старший научный сотрудник, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; kirichenko@cmd.su; https://orcid.org/0000-0002-7116-0138
Киреев Дмитрий Евгеньевич – к.б.н., заведующий лабораторией, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; dmitry.kireev@pcr.ms; https://orcid.org/0000-0002-7896-2379
Лаповок Илья Андреевич – к.б.н., старший научный сотрудник, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; lapovok@cmd.su; https://orcid.org/0000-0002-6328-1415
Колпаков Дмитрий Сергеевич – заведующий лабораторией, Ростовский НИИ микробиологии и паразитологии, Ростов-на-Дону, Россия; dimakolpakov@mail.ru; https://orcid.org/0009-0007-7604-4631
Суладзе Александр Георгиевич – к.м.н., врио директора, Ростовский НИИ микробиологии и паразитологии, Ростов-на-Дону, Россия; sualrostov@mail.ru; https://orcid.org/0000-0002-9051-1220
Бекмурзиева Луиза Курейшевна – главный врач, Республиканский центр по профилактике и борьбе со СПИДом и другими инфекционными заболеваниями, Назрань, Республика Ингушетия, Россия; luizabays@mail.ru; https://orcid.org/0009-0000-0163-7933
Гандалоев Ибрагим Исаевич – заведующий лабораторией, Республиканский центр по профилактике и борьбе со СПИДом и другими инфекционными заболеваниями, Назрань, Республика Ингушетия, Россия; gandaloev93@bk.ru; https://orcid.org/0009-0007-8566-5763
Сулейманов Ихсан Зелбухарович – заместитель главного врача, Республиканский клинический центр инфекционных болезней, профилактики и борьбы со СПИД, Грозный, Чеченская Республика, Россия; ihsansuleymanov@gmail.com; https://orcid.org/0009-0007-3595-3329
Муртазалиев Хамзат Хусейнович – главный внештатный специалист, главный врач, Республиканский клинический центр инфекционных болезней, профилактики и борьбы со СПИД, Грозный, Чеченская Республика, Россия; hiv-chr@mail.ru; https://orcid.org/0009-0003-4524-5730
Дальцаева Марха Казбековна – заместитель главного врача, Республиканский клинический центр инфекционных болезней, профилактики и борьбы со СПИД, Грозный, Чеченская Республика, Россия; marha-epid@yandex.ru; https://orcid.org/0009-0007-3595-3329
Ртищева Людмила Викторовна – главный врач, Карачаево-Черкесская республиканская инфекционная клиническая больница и Центр по профилактике и борьбе со СПИДом, Черкесск, Карачаево-Черкесская Республика, Россия; infekcia73@mail.ru; https://orcid.org/0009-0001-7399-3977
Шунгарова Оксана Александровна – инфекционист, Карачаево-Черкесская республиканская инфекционная клиническая больница и Центр по профилактике и борьбе со СПИДом, Черкесск, Карачаево-Черкесская Республика, Россия; aminova@mail.ru; https://orcid.org/0009-0007-6094-6091
Бобков Вячеслав Геннадьевич – инженер IT, НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова, Москва, Россия; vbobkov@gmail.com; https://orcid.org/0000-0003-0869-6594
Бобкова Марина Ридовна – главный специалист, НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова, Москва, Россия; mrbobkova@mail.ru; https://orcid.org/0000-0001-5481-8957
Акимкин Василий Геннадьевич – академик РАН, д.м.н., профессор, директор, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; crie@pcr.ru; https://orcid.org/0000-0003-4228-9044


Похожие статьи

К содержанию номера

Бионика Медиа