English
Генетическая характеристика ВИЧ-1 у пациентов с опытом вирусологической неудачи терапии в Киргизской Республике в 2017–2018 гг.
DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2020.10.3.105-11
Лаповок И.А., Салеева Д.В., Лопатухин А.Э., Кириченко А.А., Мурзакова А.В., Бекболотов А.А., Исканова Б.М., Нарматова Э.Б., Акматова Ж.К., Асыбалиева Н.А., Киреев Д.Е.
1) ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; 2) Республиканский Центр СПИД Министерства здравоохранения Киргизской Республики, Бишкек, Киргизия; 3) Ошский областной Центр профилактики и борьбы со СПИДом Министерства здравоохранения Киргизской Республики, Ош, Киргизия
Материалы и методы. Была собрана коллекция образцов плазмы крови (n =100), исследованы нуклеотидные последовательности гена pol ВИЧ-1, определены субтиповая принадлежность вируса в образцах, структура и уровень лекарственной устойчивости ВИЧ-1.
Результаты. Установлено доминирование в Киргизии рекомбинантного варианта ВИЧ-1 CRF63_02A1 (в 56% образцов), и суб-субтипа A6 (в 41% образцов). В то же время выявлены случаи инфицирования редкой генетической формой ВИЧ-1, близкой к CRF94_cpx и CRF95_02B, и высокая частота мутаций устойчивости к препаратам, входящим в основные применяемые в стране схемы терапии: к EFV и NVP (в 48 и 50% образцов соответственно) и к FTC и 3TC (в 39% образцов).
Заключение. Выявленная высокая частота лекарственной устойчивости к препаратам, составляющим основные схемы АРТ, у пациентов с высокой приверженностью лечению говорит о необходимости дальнейшего мониторинга лекарственной устойчивости в стране, в том числе среди пациентов без опыта терапии и только приступающих к ней.
Литература
1. UNAIDS. Country factsheets. Kyrgyzstan. 2018. https://www.unaids.org/ru/regionscountries/countries/kyrgyzstan 2. Laga V., Lapovok I., Kazennova E., Ismailova A., Beisheeva N., Asybalieva N. et al. The Genetic Variability of HIV-1 in Kyrgyzstan: The Spread of CRF02_AG and Subtype A1 Recombinants. J. HIV AIDS 2015; 1(2): http://dx.doi.org/10.16966/jha.106 3. Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR. AIDS Rev. 2013; 15(4): 204–12. PMID: 24192601. 4. Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeters M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature: Review. Infect. Genet. Evol. 2016; 46: 150–8. DOI: 10.1016/j.meegid.2016.10.018 5. Baryshev P., Bogachev V., Gashnikova N. HIV-1 genetic diversity in Russia: CRF63_02A1, a new HIV type 1 genetic variant spreading in Siberia. AIDS Res. Hum. Retroviruses 2014; 30(6): 592–7. DOI: 10.1089/AID.2013.0196 6. Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Казеннова Е.В., Лебедев А.В., Бобкова М.Р., Коломеец А.Н., Турбина Г.И., Шипулин Г.А., Ладная Н.Н., Покровский В.В. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. Тер. архив 2017; 89(11): 44–9. DOI: 10.17116/terarkh2017891144-49. Lapovok I.A., Lopatukhin A.E., Kireev D.E., Kazennova E.V., Lebedev A.V., Bobkova M.R., Kolomeets A.N., Turbina G.I., Shipulin G.A., Ladnaia N.N., Pokrovsky V.V. 7. Kostaki E.G., Karamitros T., Bobkova M., Oikonomopoulou M., Magiorkinis G., Garcia F. et al. Spatiotemporal Characteristics of the HIV-1 CRF02_AG/CRF63_02A1 Epidemic in Russia and Central Asia. AIDS Res. Hum. Retroviruses 2018; 34(5): 415–20. DOI: 10.1089/AID.2017.0233 8. Орузбаева Б.О., ред. Киргизская Советская Социалистическая Республика. Киргизская Советская Энциклопедия, 1982; 29–30. Oruzbaeva B.O., ed. 9. Lapovok I., Kazennova E., Laga V., Vasilyev A., Utegenova A., Abishev A. et al. Short Communication: Molecular Epidemiology of HIV Type 1 Infection in Kazakhstan: CRF02_AG Prevalence Is Increasing in the Southeastern Provinces. AIDS Res. Hum. Retroviruses 2014; 30(8): 769–74. DOI: 10.1089/AID.2013.0291 10. Хомколова В.В., Тотменин А.В., Астахова Е.М., Бекболотов А.А., Кадырбеков У.К., Гашникова Н.М. Исследование генетических вариантов ВИЧ-1, распространяющихся среди жителей Джалал- Абадской и Чуйской областей Республики Кыргызстан. Материалы Международной научно-практической конференции «Актуальные вопросы ВИЧ-инфекции». СПБ., 2019; 388–9. Homkolova V.V., Totmenin A.V., Astahova E.M., Bekbolotov A.A., Kadyrbekov U.K., Gashnikova N.M. 11. 90-90-90 An ambitious treatment target to help end the AIDS epidemiс. UNAIDS/JC2684 (English original, October 2014). https://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/90-90-90_en_0.pdf 12. HIV drug resistance report 2019. World Health Organization. https://apps.who.int/iris/handle/10665/325891 13. REGA HIV-1 Subtyping Tool. Version 3.0. http: //dbpartners.stanford.edu:8080/RegaSubtyping/stanford-hiv/typingtool/ 14. COMET HIV-1 v2.2 Subtyping Tool. https://comet.lih.lu. 15. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. Mol. Biol. Evol. 2013; 30(12): 2725–9. DOI: 10.1093/molbev/mst197. 16. Los Alamos HIV database. https://www.hiv.lanl.gov. 17. Stanford University HIV Drug Resistance Database. http://hivdb. stanford. edu 18 Кулаичев А.П. ред. Методы и средства комплексного статистического анализа данных. Учебное пособие. 5-е изд., перераб. и доп. М.: Инфра-М; 2017: 141–45. Kulaichev A.P., ed. 19. Billings E., Kijak G.H., Sanders-Buell E., Ndembi N., OʼSullivan A.M., Adebajo S. New Subtype B Containing HIV-1 Circulating Recombinant of sub-Saharan Africa Origin in Nigerian Men Who Have Sex with Men. J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 2019; 81(5): 578–84. DOI: 10.1097/ QAI.0000000000002076. 20. Wirden M., De Oliveira F., Bouvier-Alias M., Lambert-Niclot S., Chaix M-L., Raymond S. et al. New HIV-1 Circulating Recombinant Form 94: From Phylogenetic Detection of a Large Transmission Cluster to Prevention in the Age of Geosocial-Networking Apps in France, 2013 to 2017. Euro Surveill. 2019; 24(39): 1800658. DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2019.24.39.1800658.
Об авторах / Для корреспонденции
Лаповок Илья Андреевич – к.б.н., старший научный сотрудник ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; e-mail: i_lapovok@mail.ru; ORCID: https://orcid.org/0000-0002-6328-1415
Салеева Дарья Владиславовна – лаборант-исследователь ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; e-mail: dasha_saleeva@inbox.ru; ORCID: https://orcid.org/0000-0002-5870-5594
Лопатухин Алексей Эдуардович – научный сотрудник ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; e-mail: a.lopatukhin@gmail.com; ORCID: https://orcid.org/0000-0002-2826-699X
Кириченко Алина Алексеевна – научный сотрудник ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; e-mail: kotova-kirichenko@mail.ru; ORCID: https://orcid.org/0000-0002-7116-0138
Мурзакова Анастасия Вениаминовна – научный сотрудник ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; e-mail: murzakova_a.v@mail.ru; ORCID: https://orcid.org/0000-0002-1390-8021
Бекболотов Айбек Абдылдаевич – заместитель директора Республиканского Центра СПИД Министерства здравоохранения Киргизской Республики, Бишкек, Киргизия; e-mail: aibek_0001@mail.ru; ORCID: https://orcid.org/0000-0001-9931-3311
Исканова Баариниса Мусуратиллаевна – врач-лаборант Республиканского Центра СПИД Министерства здравоохранения Киргизской Республики, Бишкек, Киргизия; e-mail: i.barnisa@hotmail.com; ORCID: https://orcid.org/0000-0002-2493-1788
Нарматова Эльмира Балтабаевна – главный врач Ошского областного Центра профилактики и борьбы со СПИДом Министерства здравоохранения Киргизской Республики, Ош, Киргизия; e-mail: elmira.narmatova@yandex.ru; ORCID: https://orcid.org/0000-0001-9263-0525
Акматова Жылдыз Кыдыргычевна – врач-эпидемиолог Республиканского Центра СПИД Министерства здравоохранения Киргизской Республики, Бишкек, Киргизия; e-mail: zhyldyz_akmatova@mail.ru; ORCID:https://orcid.org/0000-0003-4890-3690
Асыбалиева Назгуль Асыбалиевна – врач-эпидемиолог Республиканского Центра СПИД Министерства здравоохранения Киргизской Республики, Бишкек, Киргизия; e-mail: nazgul-asybaliev@mail.ru; ORCID: https://orcid.org/0000-0002-6715-3592
Киреев Дмитрий Евгеньевич – к.б.н., научный сотрудник ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; e-mail: dmitkireev@yandex.ru; ORCID: https://orcid.org/0000-0002-7896-2379
Похожие статьи
