Микробиологический мониторинг пациентов в инфекционном отделении реанимации


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2025.15.1.67-73

Орлова О.А., Гусаров В.Г., Камышова Д.А., Петрова Л.В., Семененко Т.А.

1) Национальный медико-хирургический Центр имени Н.И. Пирогова Минздрава России, Москва, Россия; 2) Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Минздрава России, Москва, Россия; 3) Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия
Цель исследования. Анализ данных микробной колонизации пациентов отделения анестезиологии-реанимации (ОАР) с оценкой динамики антибактериальной резистентности.
Материалы и методы. Выполнен анализ данных микробиологического мониторинга 88 пациентов с диагнозом «новая коронавирусная инфекция», поступивших в ОАР. Микробиологические исследования проводили по общепринятой методике.
Результаты. До поступления в ОАР 27,3% пациентов получали антимикробную терапию. Частота микробной колонизации различных биолокусов пациентов при поступлении в ОАР составила: содержимое нижних дыхательных путей – 93,8%, моча – 54,1%, кровь – 35,0%. В содержимом нижних дыхательных путей и моче в основном выделялись нормальные комменсалы ротовой полости и мочевыводящих путей. Отмечено значительное содержание грибов рода Candida – 24,0 и 13,6% соответственно. В крови пациентов при поступлении в ОАР в 71,4% случаев выделялись Staphylococcus spp., а в 19,0% – Аctinomyces spp. В динамике отмечено увеличение частоты выделения грибов из всех локусов пациентов. Уже при поступлении часть пациентов (7,6–38,1%) была контаминирована антибиотикорезистентными микроорганизмами, в динамике отмечалось снижение выделения антибиотикорезистентных микроорганизмов, выделенных из содержимого нижних дыхательных путей и крови.
Заключение. Микробиологический мониторинг необходим в ОАР, поскольку позволяет проводить раннюю диагностику инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, следить за динамикой эпидемического процесса и своевременно назначать рациональную антимикробную терапию.

Литература


1. Дворак C.И., Гусев Д.А., Суборова Т.Н., Захарова Н.Г., Сизова Н.В., Буланьков Ю.И. Оптимизация стартовой эмпирической антибактериальной терапии у больных ВИЧ-инфекцией – пациентов специализированного стационара. Журнал инфектологии 2019; 11(2): 97–106. DOI: 10.22625/2072-6732-2019-11-2-97-1061


Dvorak S.I., Gusev D.A., Suborova T.N., Zakharova N.G., Sizova N.V., Bulankov Yu.I.


2. Бурмистров Е.М., Краснослободцев К.Г., Аветисян Л.Р., Сиянова Е.А., Медведева О.С., Целикина Е.Г. и др. Смешанные бактериально-вирусные инфекции легких у пациентов с муковисцидозом. Пульмонология 2023; 33(4): 488–496. DOI: 10.18093/0869-0189-2023-33-4-488-496


Burmistrov E.M., Krasnoslobodtsev K.G., Avetisyan L.R., Siyanova E.A., Medvedeva O.S., Tselikina E.G. et al.


3. Тлюстангелова Р.К., Пшеничная Н.Ю., Лизинфельд И.А., Журавлев А.С. Выбор тактики лечения у больных с острыми кишечными инфекциями бактериальной этиологии, имеющих высокий риск развития синдрома раздраженного кишечника. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2024; 14(2): 79–86. DOI: 10.18565/epidem.2024.14.2.79-86


Tlyustangelova R.K., Pshenichnaya N.Yu., Lizinfeld I.A., Zhuravlev A.S.


4. Николаева И.В., Гайнатуллина Л.Р., Гусева С.Е., Юмагулова Е.Ф., Белова М.Н. Этиологическая структура и антибиотикорезистентность возбудителей сепсиса у больных COVID-19. Практическая медицина 2024; 22(2): 90–95. DOI: 10.32000/2072-1757-2024-2-90-95


Nikolaeva I.V., Gainatullina L.R., Guseva S.E., Yumagulova E.F., Belova M.N.


5. Жукова Э.В., Никитина Г.Ю., Ноздрачева А.В., Орлова О.А., Готвянская Т.П., Бурова А.А. и др. Мультидисциплинарный подход к оценке рисков возникновения инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, в контексте пандемии COVID-19. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2022; 12(1): 25–34. DOI: 10.18565/epidem.2022.12.1.25-34


Zhukova E.V., Nikitina G.Yu., Nozdracheva A.V., Orlova O.A., Gotvyanskaya T.P., Burova A.A., Maziy S.A.


6. Стрелкова Д.А., Рачина С.А., Кулешов В.Г., Бурмистрова Е.Н., Сычев И.Н., Ананичева Н.А. и др. Микробиологический мониторинг пациентов с COVID- 19 в ОРИТ: проспективное наблюдательное исследование. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия 2022; 24(3): 274–282. DOI: 10.36488/cmac.2022.3.274282


Strelkova D.A., Rachina S.A., Kuleshov V.G., Burmistrova E.N., Sychev I.N., Ananicheva N.A. et al.


7. Малкова О.Г., Машаева О.Г., Собетова Г.В., Орлов А.В., Рахимов Р.Т., Втюрина Г.В. и др. Оценка изменений структуры возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, в отделениях реанимации и интенсивной терапии в период пандемии новой коронавирусной инфекции (COVID-19). Уральский медицинский журнал 2023; 22(6): 31–42. DOI: 10.52420/2071-5943-2023-22-6-31-42


Malkova O.G., Mashaeva O.G., Sobetova G.V., Orlov A.V., Rakhimov R.T., Vtyurina G.V. et al.


8. Langford B.J., So M., Raybardhan S., Leung V., Soucy J.-P. R., Westwood D. et al. Antibiotic prescribing in patients with COVID-19: rapid review and meta-analysis. Clin. Microbiol. Infect. 2021; 24(4): 520–531. DOI: 10.1016/j.cmi.2020.12.018


9. Du Y., Tu L., Zhu P., Mi M., Wang R., Yang P. et al. Clinical features of 85 fatal cases of COVID-19 from Wuhan: a retrospective observational study. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2020; 201(11): 1372–1379. DOI: 10.1164/rccm.202003-0543OC


10. Rothe K., Feihl S., Schneider J., Wallnöfer F., Wurst M., Lukas M. et al. Rates of bacterial co-infections and antimicrobial use in COVID-19 patients: a retrospective cohort study in light of antibiotic stewardship. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2021; 40(4): 859–869. DOI: 10.1007/s10096-020-04063-8


11. WHO. Clinical Management of COVID-19. 2021. https:// www.who.int/publications/i/item/WHO-2019-nCoV-clinical-2021-1


12. Calderón-Parra J., Muiño-Miguez A., Bendala-Estrada A.D. Inappropriate antibiotic use in the COVID-19 era: Factors associated with inappropriate prescribing and secondary complications. Analysis of the registry SEMI-COVID. PLoS One 2021; 16(5): e0251340. DOI: 10.1371/journal.pone.0251340


13. Lansbury L., Lim B., Baskaran V., Lim W.S. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J. Infect. 2020; 81(2): 266–275. DOI: 10.1016/j.jinf.2020.05.046


14. Langford B.J., So M., Raybardhan S., Leung V., Westwood D., MacFadden D.R. et al. Bacterial co-infection and secondary infection in patients with COVID-19: a living rapid review and meta-analysis. Clin. Microbiol. Infect. 2020; 26(12): 1622–1629. DOI: 10.1016/j.cmi.2020.07.016


15. Garcia-Vidal С., Sanjuan G., Moreno-García E., Puerta-Alcalde P., Garcia-Pouton N., Chumbitaet M. et al. Incidence of co-infections and superinfections in hospitalized patients with COVID-19: a retrospective cohort study. Clin. Microbiol. Infect. 2021; 27(1): 83–88. DOI: 10.1016/j.cmi.2020.07.041


16. WHO. Global action plan on antimicrobial resistance. 2015. https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/193736/9789241509763_eng.pdf?sequence=1


17. Dudoignon E., Caméléna F., Deniau B., Habay A., Coutrot M., Ressaire Q. et al. Bacterial pneumonia in COVID-19 critically ill patients: a case series. Clin. Infect. Dis. 2020; 72(5): 905–906. DOI: 10.1093/cid/ciaa762


18. Manohar P., Loh B., Nachimuthu R., Hua X., Welburn S.C., Leptihn S. Secondary bacterial infections in patients with viral pneumonia. Front. Med. (Lausanne). 2020; (7): 420. DOI: 10.3389/fmed.2020.00420


19. Hughes S., Troise O., Donaldson H., Mughal N., Moore L.S.P. Bacterial and fungal coinfection among hospitalized patients with COVID-19: a retrospective cohort study in a UK secondary-care setting. Clin. Microbiol. Infect. 2020; 26(10): 1395–1399. DOI: 10.1016/j.cmi.2020.06.025


20. Søvik S., BarrattDue A., Kåsine T., Olasveengen T., Strand M.W., Tveita A.A. et al. Corticosteroids and superinfections in COVID-19 patients on invasive mechanical ventilation. J. Infect. 2022; 85(1): 57–63. DOI: 10.1016/j.jinf.2022.05.015


21. Blonz G., Kouatchet A., Chudeau N., Pontis E., Lorber J., Lemeur A. Epidemiology and microbiology of ventilatorassociated pneumonia in COVID-19 patients: a multicenter retrospective study in 188 patients in an un inundated French region. Crit. Care 2021; 25(1): 72. DOI: 10.1186/S1305402103493-W


22. Shappell C.N., Klompas M., Kanjilal S., Chan Ch., Rhee Ch. Prevalence, clinical characteristics, and outcomes of sepsis caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 versus other pathogens in hospitalized patients with COVID- 19. Crit. Care Explor. 2022; 4(5): e0703. DOI: 10.1097/CCE.0000000000000703


23. Полищук И.С., Алешукина А.В., Донцов Д.В., Маркова К.Г., Березинская И.С., Твердохлебова Т.И. Анализ микробного профиля мокроты и содержания в ней цитокинов ИЛ-4, ИЛ-6, ИЛ-10, ИФН-γ у больных внебольничной пневмонией в период пандемии COVID-19. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2024; 14(1): 43–48. DOI: 10.18565/epidem.2024.14.1.43-8


Polishchuk I.S., Aleshukina A.V., Dontsov D.V., Markova K.G., Berezinskaya I.S., Tverdokhlebova T.I.


24. Gangneux J.P., Dannaoui E., Fekkar A., Luyt C.E., Botterel F., De Prost N. et al. Fungal infections in mechanically ventilated patients with COVID19 during the first wave: the French multicentre MYCOVID study. Lancet Respir. Med. 2022; 10(2): 180–190. DOI: 10.1016/S22132600(21)00442-2


25. Катаева Л.В., Вакарина А.А., Степанова Т.Ф., Степанова К.Б. Микробиота нижних дыхательных путей при внебольничных пневмониях, в том числе ассоциированных c SARS-CoV-2. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2021; 98(5): 528–537. DOI: 10.36233/0372-9311-10739


Kataeva L.V., Vakarina A.A., Stepanova T.F., Stepanova K.B.


26. Матиевская Н.В., Волосач О.С., Кузьмич И.А. Синегнойная инфекция у пациентов стационаров различного профиля: клинические и микробиологические аспекты. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2022; 12(1): 87–92. DOI: 10.18565/epidem.2022.12.1.87-92


Matievskaya N.V., Volosach O.S., Kuzmich I.A.


27. Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Носков А.К., Ковалев Е.В., Чемисова О.С. и др. Особенности этиологии внебольничных пневмоний, ассоциированных с COVID-19. Проблемы особо опасных инфекций 2020; (4): 99–105. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-4-99-10541


Popova A.Yu., Ezhlova E.B., Demina Yu.V., Noskov A.K., Kovalev E.V., Chemisova O.S. et al.


28. Moreno-García E., Puerta-Alcalde P., Letona L., Meira F., Dueñas G., Chumbita M. et al. COVID-19-researcher group. Bacterial co-infection at hospital admission in patients with COVID-19. Int. J. Infect. Dis. 2022; 118: 197–202. DOI: 10.1016/j.ijid.2022.03.003


Об авторах / Для корреспонденции


Орлова Оксана Анатольевна – д.м.н., врач-эпидемиолог, начальник отдела эпидемиологии, Национальный медико-хирургический Центр имени Н.И. Пирогова Минздрава России; старший научный сотрудник лаборатории оппортунистических инфекций, Научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени Н.Ф. Гамалеи Минздрава России; ведущий научный сотрудник лаборатории инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; оksana_orlova@bk.ru; https://orcid.org/0000-0002-6701-1252
Гусаров Виталий Геннадьевич – д.м.н., доцент, главный врач стационара, Национальный медико-хирургический Центр имени Н.И. Пирогова Минздрава России; заведующий кафедрой анестезиологии и реаниматологии, Институт усовершенствования врачей, Национальный медико-хирургический Центр имени Н.И. Пирогова Минздрава России, Москва, Россия; gusarovvg@pirogov-center.ru; https://orcid.org/0000-0002-2900-1459
Камышова Дарья Андреевна – врач-клинический фармаколог, заведующая отделением клинической фармакологии, Национальный медико-хирургический Центр имени Н.И. Пирогова Минздрава России; ассистент кафедры внутренних болезней, Институт усовершенствования врачей, Национальный медико-хирургический Центр имени Н.И. Пирогова Минздрава России, Москва, Россия; kamyshovada@pirogov-center.ru; https://orcid.org/0000-0003-3084-9294
Петрова Людмила Викторовна – врач-бактериолог, заведующая микробиологической лабораторией, Национальный медико-хирургический Центр имени Н.И. Пирогова Минздрава России, Москва, Россия; petrovalv@pirogov-center.ru; https://orcid.org/0000-0001-6221-9743
Семененко Татьяна Анатольевна – академик РАЕН, д.м.н., профессор, руководитель отдела эпидемиологии, Научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени Н.Ф. Гамалеи Минздрава России. Москва, Россия; info@gamaleya.org; http://orcid.org/0000-0002-6686-9011


Похожие статьи


Бионика Медиа