English
Опыт применения импульсного УФ-излучения сплошного спектра плазменных ксеноновых ламп для деконтаминации продуктов ПЦР
DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2025.15.1.51-55
Тутельян А.В., Черкаши Е.А., Замотаева Т.Л., Абросимова О.А., Потапенко А.О., Шашковский С.Г., Гольдштейн Я.А., Акимкин В.Г.
1) Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; 2) ООО «НПП «Мелитта», Москва, Россия
Материалы и методы. С помощью источника импульсного УФ-излучения проведены эксперименты на ампликонах ДНК длиной 117 п. н. Эффективность деконтаминации оценивали по остаточному количеству ампликонов в смывах с рабочих поверхностей, таких как пластик, стекло и металл.
Результаты. Была показана высокая эффективность импульсного УФ-излучения в борьбе с контаминацией ДНК, определено оптимальное время облучения (10–12 мин), достаточное для полного разрушения ампликонов на различных типах поверхности (пластик, стекло, металл). Полученные данные позволяют сократить время обработки помещений и снизить негативное воздействие от УФ-излучения на лабораторное оборудование и помещения.
Заключение. Продемонстрирована целесообразность использования импульсных установок, генерирующих высокоинтенсивные потоки УФ-излучения сплошного спектра, для разрушения ампликонов на различных поверхностях.
Литература
1. Kleppe K., Ohtsuka E., Kleppe R., Molineux I., Khorana H.G. Studies on polynucleotides. XCVI. Repair replications of short synthetic DNA’s as catalyzed by DNA polymerases. J. Mol. Biol. 1971; 56: 341–361. DOI: 10.1016/0022-2836(71)90469-4
2. Saiki R., Scharf S., Faloona F., Mullis K., Horn G., Erlich H. Enzymatic amplification of beta-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia. Science 1985; 230: 1350–1354. DOI: 10.1126/science.2999980
3. Краснов Я.М., Гусева Н.П., Шарапова Н.А., Черкасов А.В. Современные методы секвенирования ДНК. Проблемы особо опасных инфекций 2014; (2): 73–79. DOI: 10.21055/0370-1069-2014-2
Krasnov Ya.M., Guseva N.P., Sharapova N.A., Cherkasov A.V.
4. Wong Y., Othman S., Lau Y., Radu S., Chee H. Loop-mediated isothermal amplifcation (LAMP): a versatile technique for detection of micro-organisms. J. Appl. Microbiol. 2018; 124(3): 626–643. DOI: 10.1111/jam.13647
5. Zhou L., Chandrasekaran A.R., Punnoose J.A., Bonenfant G., Charles S., Levchenko O. et al. Programmable low-cost DNA-based platform for viral RNA detection. Sci. Adv. 2020; 6(39): eabc6246. DOI: 10.1126/sciadv.abc6246
6. Волков А.Н., Начева Л.В., Захарова Ю.В. Молекулярно-генетические методы в практике современных медико-биологических исследований. Часть II: использование ПЦР в диагностике инфекционных заболеваний человека. Фундаментальная и клиническая медицина 2021; 6(1): 77–85. DOI: 10.23946/2500-0764-2021-6-1-77-85
Volkov A.N., Nacheva L.V., Zakharova Y.V.
7. Кузин В.В., Колупаева Н.В., Щербакова О.А., Дятлов И.А. Деконтаминация поверхностей от нуклеиновых кислот аэрозолями дезинфицирующих средств. Microbiology Independent Research Journal 2023; 10(1): 1–12. DOI: 10.18527/2500-2236-2023-10-1-1-12
Kuzin V.V., Kolupaeva N.V., Shcherbakova O.A., Dyatlov I.A.
8. Jinno Y., Yoshiuraand K., Niikawa N. Use of psoralen as extinguisher of contaminated DNA in PCR. Nucleic Acids Res. 1990; 18(22): 6739 DOI: 10.1093/nar/18.22.6739
9. Алиев А.А., Шапиев Б.И., Алиев Н.А. Коррозионная активность дезинфицирующего средства для обработки помещений и объектов на основе нейтрального анолита. Известия Дагестанского государственного педагогического университета. Серия: Естественные и точные науки 2018; 12(4): 5–10. DOI:10.31161/1995-0675-2018-12-4-5-10
Aliev A.A., Shapiev B.I., Aliev N.A.
10. Mwangi P., Mogotsi M., Ogunbayo A., Mooko T., Maringa W. A decontamination strategy for resolving SARS-CoV-2 amplicon contamination in a next-generation sequencing laboratory. Arch. Virol. 2022; 167(4): 1175–1179. DOI:10.1007/s00705-022-05411-z
11. Champlot S., Berthelot C., Pruvost M. An Efficient Multistrategy DNA Decontamination Procedure of PCR Reagents for Hypersensitive PCR Applications. PLoS One 2010; 5(9):e13042. DOI: 10.1371/journal.pone.0013042
12. Волынкина А.С., Рязанова А.Г., Русанова Д.В., Куличенко А.Н. Проблема ДНК (РНК)-контаминации в лаборатории при проведении диагностики COVID-19 методом ПЦР. Здоровье населения и среда обитания 2021; (7): 76–81. DOI: 10.35627/2219-5238/2021-29-7-76-81
Volynkina A.S., Ryazanova A.G., Rusanova D.V., Kulichenko A.N.
13. Karlen Y., McNair A., Perseguers S., Mazza C., Mermod N. Statistical significance of quantitative PCR. BMC Bioinformatics 2007; 20(8): 131. DOI: 10.1186/1471-2105-8-131
14. Sicairos-Ruelas E.E., Gerba C.P., Bright K.R. Efficacy of copper and silver as residual disinfectants in drinking water. J. Environ. Sci. Health A Tox. Hazard Subst. Environ. Eng. 2019; 54(2): 146–155. DOI: 10.1080/10934529.2018.1535160
15. Farrer A.G., Wright S., Skelly E., Eisenhofer R., Dobney K., Weyrich L. Effectiveness of decontamination protocols when analyzing ancient DNA preserved in dental calculus. Sci. Rep. 2021; 11(1): 7456. DOI: 10.1038/s41598-021-86100-w
16. Soro A., Ekhlas D., Shokri S., Yem M., Li R., Barroug S. The efficiency of UV light-emitting diodes (UV-LED) in decontaminating Campylobacter and Salmonella and natural microbiota in chicken breast, compared to a UV pilot-plant scale device. Food Microbiology 2023; 116: 104365. DOI: 10.1016/j.fm.2023.104365
Об авторах / Для корреспонденции
Тутельян Алексей Викторович – чл.-корр. РАН, д.м.н., профессор, заведующий лабораторией инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; bio-tav@yandex.ru; http://orcid.org/0000-0002-2706-6689
Черкашин Евгений Александрович – к.х.н. руководитель. Центр разработки, развития продукции и инноваций, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; e.cherkashin@ pcr.ms; http://orcid.org/0000-0002-3627-6047
Замотаева Татьяна Львовна – научный сотрудник, Центр разработки, развития продукции и инноваций, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; zamotaevatat@gmail.com; http://orcid.org/0009-0003-9799-3749
Абросимова Ольга Андреевна – врач-эпидемиолог, руководитель эпидемиологической службы, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; kvasova@cmd.su; http://orcid.org/0000-0002-4545-1804
Потапенко Алексей Олегович – научный сотрудник, ООО «НПП «Мелитта», Москва, Россия; alexeu1999pt@gmail.com
Шашковский Сергей Геннадьевич – к.т.н., главный конструктор, ООО «НПП «Мелитта», Москва, Россия; melitta916@gmail.com
Гольдштейн Яков Абраммерович – генеральный директор, ООО «НПП «Мелитта», Москва, Россия; yagmed@gmail.com
Акимкин Василий Геннадьевич – академик РАН, д.м.н., профессор, директор, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; vgakimkin@yandex.ru; http://orcid.org/0000-0003-4228-9044
Похожие статьи
