English
Связанность эпидемий ВИЧ-инфекции в Республике Армения и Российской Федерации
DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2023.13.3.27-34
Киреев Д.Е., Кириченко А.А., Осадчая О.А., Салеева Д.В., Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Шлыкова А.В., Ладная Н.Н., Григорян Т.Р., Петросян А.Р., Саргатян Т.А., Овакимян Э.М., Мартоян С.В., Казарян О.К., Овсепян Т.В., Саркисянц Н.К., Покровский В.В., Акимкин В.Г.
1) Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; 2) ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней», Министерство здравоохранения Республики Армения, Ереван, Республика Армения
Материалы и методы. Исследованы 1009 нуклеотидных последовательностей ВИЧ региона pol и сопутствующая деперсонифицированная информация о пациентах, полученные в рамках распоряжений Правительства РФ, выполненных в 2016–2021 гг. Для оценки связанности эпидемии ВИЧ-инфекции анализировали также последовательности из базы данных Лос-Аламос и коллекции Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора. К полученному пулу последовательностей были применены инструмент BLAST, филогенетический и кластерный анализ.
Результаты. Среди проанализированных последовательностей ВИЧ граждан Армении 87,2% принадлежали к субсубтипу А6, 5,6% – к субтипу В, 2,7% – CRF63_02А6 и 1,9% – CRF02_AG. Другие генетические варианты встречались реже (1%). Наибольшее количество генетически родственных последовательностей ВИЧ имели российское происхождение (44,52%), затем следовали Республика Беларусь (10,59%) и США (8,04%). С помощью кластерного анализа было обнаружено, что достоверно чаще смешанные AM-RU кластеры состояли из мужчин, пациентов с гомосексуальным путем передачи, проживающих в пригороде Еревана, инфицирование которых предположительно произошло в России.
Заключение. Биоинформатический анализ нуклеотидных последовательностей ВИЧ, полученных от граждан Республики Армения, в сочетании с генетическими вариантами ВИЧ, доступными на сегодняшний день, показал высокую генетическую близость последовательностей ВИЧ Армении и Российской Федерации.
Литература
1. Покровский В.В., Улумбекова Г.Э., Петрачков И.В. Организация медицинской помощи при инфекции, вызываемой вирусом иммунодефицита человека. ОРГЗДРАВ: новости, мнения, обучение. Вестник ВШОУЗ 2022; 8(2): 108–30. DOI: https://doi.org/10.33029/2411-8621-2022-8-2-108-130. Pokrovsky V.V., Ulumbekova G.E., Petrachkov I.V. (Organization of medical care in case of infection caused by the human immunodeficiency virus). ORGZDRAV: news, opinions, training. Vestnik VSHOUZ. 2022; 8(2): 108–30. (In Russ.). DOI: https://doi.org/10.33029/2411-8621-2022-8-2-108-130. 2. Ладная Н.Н., Покровский В.В., Соколова Е.В., Чекрыжова Д.Г., Киржанова В.В. Распространение инфекции, вызываемой вирусом иммунного дефицита человека, на территориях Российской Федерации в 2021 г. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2022; 12(3): 12–8. DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2022.12.3.12-8 Ladnaia N.N., Pokrovsky V.V., Sokolova E.V., Chekryzhova D.G., Kirzhanova V.V. (Prevalence of human immune deficiency virus infection in the territories of the Russian Federation in 2021). Epidemiоlоgy and infectious diseases. Сurrent items 2022; 12(3): 12–8. (In Russ.). DOI: https: //dx.doi.org/10.18565/epidem.2022.12.3.12-8 3. HIV Epidemiological surveillance in the Republic of Armenia 2018 Annual Report. https://ecom.ngo/wp-content/uploads/2018/12/IBBS_ARMENIA_ 2018_eng_FINAL.pdf 4. International Organization for Migration. (2013). Report on Household Survey on Migration in Armenia. http://publications.iom.int/ bookstore/index. php?main_p.oduct_info&cPath=41_7&products_id=1400 5. Ministry of Health, National Center for AIDS Prevention. (2017) Biological and Behavioral Surveillance Survey on Armenian, Male, Seasonal Labor Migrants in Rural Communities in Armenia, 2016. http://www.armaids. am/images/pdf/Rural_migrant_survey_report_arm_eng.pdf 6. Nduva G.M., Otieno F., Kimani J., McKinnon L.R., Cholette F., Sandstrom P. et al. Phylogeographic Assessment Reveals Geographic Sources of HIV-1 Dissemination Among Men Who Have Sex With Men in Kenya. Frontiers in Microbiology, 2022; (13): 843330. https://doi.org/10.3389/fmicb.2022. 843330 7. Pimentel V., Pingarilho M., Alves D., Diogo I., Fernandes S., Miranda M. et al. Molecular Epidemiology of HIV-1 Infected Migrants Followed up in Portugal: Trends between 2001–2017. Viruses 2020; 12(3), 268. https://doi.org/10.3390/v12030268 8. Ratmann O., Kagaayi J., Hall M., Golubchick T., Kigozi G., Xi X. et al. Rakai Health Sciences Progra пm and the Pangea HIV Consortium. Quantifying HIV transmission flow between high-prevalence hotspots and surrounding communities: a population-based study in Rakai, Uganda. The Lancet HIV The Lancet HIV 2020; 7(3): e173–e183. https://doi.org/ 10.1016/S2352-3018(19)30378-9. 9. Kirichenko A., Kireev D., Lopatukhin A., Murzakova A., Lapovok I., Saleeva D. et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance in Eastern European and Central Asian countries. PLoS ONE 2022; 17(1): e0257731. https://doi.org/ 10.1371/journal.pone.0257731 10. Kirichenko A., Kireev D., Lapovok I., Shlykova A., Lopatukhin A., Pokrovskaya A. et al. Prevalence of Pretreatment HIV-1 Drug Resistance in Armenia in 2017–2018 and 2020–2021 following a WHO Survey. Viruses 2022; 14(11): 2320. https://doi.org/10.3390/v14112320 11. HIV/AIDS surveillance in Europe: 2022– 2021 data. WHO Regional Office for Europe, European Centre for Disease Prevention and Control. Copenhagen: WHO Regional Office for Europe, 2022. 12. Migration Survey on the Relationship between Skills, Migration and Development in Armenia. European Training Foundation, 2011. http://www. crrc.am/hosting/file/_static_content/projects/Migration_and_skills_2011/Migration_and_skills_Armenia.pdf 13. Migration and Development. Armenian Country Study. International Labour Organization. Yerevan, 2010. http://www.smsmta.am/upload/Migration%20and%20Development_Study_in_English.pdf 14. Осадчая О.А., Ерошкин П.В., Кириченко А.А., Лаповок И.А., Салеева Д.В., Лопатухин А.Э. и др. Изучение передачи лекарственной устойчивости ВИЧ-1 в Республике Армения с помощью биоинформатических методов. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2021; 11(4): 53–60. DOI: 10.18565/epidem.2021.11.4.53–60. Osadchaya O.A., Eroshkin P.V., Kirichenko A.A., Lapovok I.A., Saleeva D.V., Lopatukhin A.E. et al. (Studying the transmission of HIV-1 drug resistance in the Republic of Armenia using bioinformatics methods). Epidemiоlоgy and infectious diseases. Сurrent items 2021; 11(4): 53–60. (In Russ.). DOI: 10.18565/epidem.2021.11.4.53–60 15. Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Казеннова Е.В., Лебедев А.В., Бобкова М.Р. и др. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. Терапевтический архив 2017; 89(11): 44–9. DOI: 10.17116/terarkh2017891144-49 Lapovok I.A., Lopatukhin A.E., Kireev D.E., Kazennova E.V., Lebedev A.V., Bobkova M.R. et al. (Molecular epidemiological analysis of HIV-1 variants circulating in Russia in 1987–2015). Therapeutic archive 2017; 89(11): 44–9. DOI: 10.17116/terarkh2017891144-49 16. Еремин В.Ф., Гасич Е.Л., Сосинович С.В., Суетнов О.Н., Грушко П.Н., Грушко Т.П. и др. Молекулярная эпидемиология ВИЧ/СПИД в Беларуси (2008–2011). Здравоохранение (Минск) 2012; (1): 25–34. Eremin V.F., Gasich E.L., Sosinovich S.V., Suetnov O.N., Grushko P.N., Grushko T.P. et al. (Molecular epidemiology of HIV/AIDS in Belarus (2008–2011)). Healthcare (Minsk). 2012; (1): 25–34. (In Russ.).
Об авторах / Для корреспонденции
Киреев Дмитрий Евгеньевич – к.б.н., заведующий лабораторией диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; dmitkireev@yandex.ru; https://orcid.org/0000-0002-7896-2379
Кириченко Алина Алексеевна – научный сотрудник лаборатории диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; kotova-kirichenko@mail.ru; https://orcid.org/0000-0002-7116-0138
Осадчая Ольга Алексеевна – младший научный сотрудник лаборатории диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; osadchaya96@yandex.ru; https://orcid.org/0000-0003-1543-5579
Салеева Дарья Владиславовна – научный сотрудник лаборатории диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; dasha_saleeva@inbox.ru; https://orcid.org/0000-0002-5870-5594
Лаповок Илья Андреевич – к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; i_lapovok@mail.ru; https://orcid.org/0000-0002-6328-1415
Лопатухин Алексей Эдуардович – научный сотрудник лаборатории диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; a.lopatukhin@gmail.com; https://orcid.org/0000-0002-2826-699X
Шлыкова Анастасия Вениаминовна – научный сотрудник лаборатории диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; murzakova_a.v@mail.ru; https://orcid.org/0000-0002-1390-8021
Ладная Наталья Николаевна – к.б.н., старший научный сотрудник, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; nladnaia@hotmail.com; https://orcid.org/0000-0003-2994-151X
Григорян Трдат Рафаелович – специалист по мониторингу и оценке, ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней», Министерство здравоохранения Республики Армения, Ереван, Республика Армения; gtrdat@yahoo.com; http://orcid.org/0000-0002-7319-7444
Петросян Аршак Размикович – врач-лаборант лаборатории ПЦР, микробиологии, вирусологии и генетики, ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней», Министерство здравоохранения Республики Армения, Ереван, Республика Армения; a_petrosyan@list.ru
Саргатян Татевик Амировна – врач-лаборант лаборатории ПЦР, микробиологии, вирусологии и генетики, ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней», Министерство здравоохранения Республики Армения, Ереван, Республика Армения; sarhatyantatev@mail.ru
Овакимян Эрмис Мисаковна – заведующая клиническим отделением, ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней», Министерство здравоохранения Республики Армения, Ереван, Республика Армения; hovakimyan80@mail.ru
Мартоян Сирануш Вачиковна – врач-эпидемиолог, ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней», Министерство здравоохранения Республики Армения, Ереван, Республика Армения; smartoyan@gmail.com; https://orcid.org/0000-0002-2067-9503
Казарян Овсеп Карапетович – к.б.н., научный сотрудник, ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней», Министерство здравоохранения Республики Армения Ереван, Республика Армения; hovser.ghazaryan@ gmail.com; https://orcid.org/0000-0001-5612-8933
Овсепян Тамара Врежовна – заведующая лабораторией, ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней», Министерство здравоохранения Республики Армения, Ереван, Республика Армения; thovsep@gmail.com
Саркисянц Нарина Константиновна – к.м.н., заместитель директора, ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней», Министерство здравоохранения Республики Армения, Ереван, Республика Армения; sknarina70@mail.ru
Покровский Вадим Валентинович – академик РАН, д.м.н., профессор, заведующий специализированным отделом эпидемиологии и профилактики СПИДа, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; pokrovsky.vad@yandex.ru; https//orcid.org/0000-0002-9514-7288; Scopus Author ID:7202457043; pokrovsky.vad@yandex.ru; https://orcid.org/0000-0002-9514
Акимкин Василий Геннадьевич – академик РАН, д.м.н., профессор, директор, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; vgakimkin@yandex.ru; ORCID: https://orcid.org/0000-0003-4228-9044
Похожие статьи
