Опыт использования молекулярно-биологического мониторинга в эпидемиологическом надзоре за менингококковой инфекцией в России


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2019.1.93-99

Миронов К.О.

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия
Генерализованные формы менингококковой инфекции (ГФМИ) – тяжелые инфекционные заболевания, вызываемые бактериями вида Neisseria meningitidis. Циклические подъемы заболеваемости ГФМИ, различный уровень заболеваемости на отдельных территориях и в разные периоды времени могут в некоторых случаях объясняться антигенными и генетическими особенностями циркулирующих возбудителей. В настоящее время в России и за рубежом активно используются молекулярно-биологические подходы для мониторинга возбудителей ГФМИ, направленного на идентификацию сиквенс-типов и клональных комплексов внутри представителей известных серогрупп с целью определения их роли в эпидемическом процессе. В обзоре представлены основные результаты, полученные отечественными исследователями, и скорректированы намеченные ранее направления дальнейшего молекулярно-биологического мониторинга возбудителей ГФМИ.
Ключевые слова: Neisseria meningitidis, генерализованные формы менингококковой инфекции, серогруппы А, В, С, W, мультилокусное секвенирование-типирование, клональный комплекс, массовое параллельное секвенирование

Литература


1. Покровский В.И., Фаворова Л.А., Костюкова Н.Н. Менингококковая инфекция. М.: Медицина, 1976. 275 с.

2. Королева И.С., Белошицкий Г.В. Менингококковая инфекция и гнойные бактериальные менингиты. М.: Медицинское информационное агентство, 2007. 112 с.

3. Fox A.J., Taha M.K., Vogel U. Standardized nonculture techniques recommended for European reference laboratories. FEMS Microbiol. Rev. 2007; 31(1): 84–8. DOI: 10.1111/j.1574-6976.2006.00048.x.

4. Менингококковая инфекция и гнойные бактериальные менингиты в Российской Федерации, 2017. Информационно-аналитический обзор. М., 2018. 40 с.

5. Костюкова Н.Н., Миронова Т.К., Лещинская Е.В. Микробиологическая характеристика менингококковой инфекции в Москве в годы периодического подъема заболеваемости (1968–1971). Журн. микробиол. 1974; (5): 29–32.

6. Платонов А.Е., Шипулин Г.А., Королева И.С., Шипулина О.Ю. Перспективы диагностики бактериальных менингитов. Журн. микробиол. 1999; (2): 71–6.

7. Шипулин Г.А., Манзенюк И.Н. Вклад Центрального НИИ эпидемиологии в развитие отечественной молекулярной диагностики. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2014; (2): 21–7.

8. Покровский В.И. Пути оптимизации эпидемиологического надзора за инфекционными болезнями в стране. Журн. микробиол. 1986; (11): 3–7.

9. Костюкова Н.Н., Бехало В.А. Менингококковая инфекция и носительство. Эпидемиология и вакцинопрофилактика 2010; 6(55): 67–72.

10. Костюкова Н.Н., Бехало В.А. От безвредного носительства к гнойному менингиту. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2013; (2): 46–52.

11. Тагаченкова Т.А., Королева И.С., Миронов К.О., Лыткина И.Н., Пяева А.П., Закроева И.М., Заикин В.Л., Соловьева Л.Я. Менингококковое носительство в очагах менингококковой инфекции. Эпидемиол. и инфекц. бол. 2009; (4): 6–10.

12. Покровский В.И., Черкасский Б.Л. Актуальные проблемы эпидемиологии инфекционных болезней. Эпидемиол. и инфекц. бол. 1999; (2): 12–6.

13. Черкасский Б.Л. Система эпидемиологического надзора как отражение структуры эпидемического процесса. Журн. микробиол. 1986; (11): 74–8.

14. Ковалева Е.П. О социально-экологической концепции эпидемического процесса Б.Л. Черкасского. Журн. микробиол. 1989; (1): 83–6.

15. Симонова Е.Г. Современный этап развития эпидемиологического надзора и перспективы его совершенствования. Эпидемиология и вакцинопрофилактика 2016; 4(95): 4–7.

16. Костюкова Н.Н., Туманян А.А., Бабич Е.М., Татарников В.М., Сипачева Н.Б., Деркач С.А., Багирова Л.Ш. Роль и место серологических исследований в системе эпидемиологического надзора за менингококковой инфекцией. Журн. микробиол. 1988; (11): 36–41.

17. Платонов А.Е., Харит С.М., Платонова О.В. Вакцинопрофилактики менингококковой инфекции в мире и в России. Эпидемиология и вакцинопрофилактика 2009; (5): 32–46.

18. Acevedo R., Bai X., Borrow R., Caugant D.A., Carlos J., Ceyhan M., Christensen H., Climent Y., De Wals P., Dinleyici E.C., Echaniz-Aviles G., Hakawi A., Kamiya H., Karachaliou A., Lucidarme J., Meiring S., Mironov K., Sáfadi M.A.P., Shao Z., Smith V., Steffen R., Stenmark B., Taha M.K., Trotter C., Vázquez J.A., Zhu B. The Global Meningococcal Initiative meeting on prevention of meningococcal disease worldwide: epidemiology, surveillance, hypervirulent strains, antibiotic resistance and high-risk populations. Expert Rev. Vaccines 2018. DOI: 10.1080/14760584.2019.1557520.

19. Королева М.А. Покровский В.И., Миронов К.О., Платонов А.Е., Шипулин Г.А., Белошицкий Г.В., Закроева И.М., Мельникова А.А., Кошкина Н.А., Королева И.С. Эпидемиологический мониторинг за гнойными бактериальными менингитами в историческом и современном аспектах. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2014; (2): 52–6.

20. Демина А.А. Эпидемиологический надзор за менингококковой инфекцией и гнойными бактериальными менингитами. Эпидемиол. и инфекц. бол. 1999; (2): 25–8.

21. Королева М.А., Миронов К.О., Королева И.С. Эпидемиологические особенности генерализованной формы менингококковой инфекции, обусловленной Neisseria meningitidis серогруппы W, в мире и в Российской Федерации. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2018; (3): 16–23. DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2018.3.16–23.

22. Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С., Закроева И.М., Заикин В.Л., Соловьева Л.Я., Браславская С.И., Шипулин Г.А. Генетические субгруппы бактерий вида Neisseria meningitidis серогруппы А, выделенных от больных генерализованными формами менингококковой инфекции на территории Москвы в 1969–2006 гг. Журн. микробиол. 2008; (1): 7–12.

23. Jolley K.A., Bray J.E., Maiden M.C.J. Open-access bacterial population genomics: BIGSdb software, the PubMLST.org website and their applications. Wellcome Open Res. 2018; (3): 124. DOI: 10.12688/ wellcomeopenres.14826.1.

24. Миронов К.О. Клональные комплексы Neisseria meningitidis, циркулирующие на территории России, и их роль в эпидемическом процессе менингококковой инфекции. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2016; (6): 52–61.

25. Clonal complex designation. http://pubmlst.org/neisseria/info/complexes.и shtml.

26. Миронов К.О., Платонов А.Е., Дрибноходова О.П., Кусева В.И., Шипулин Г.А. Методика для определения серогрупп A, B, C и W Neisseria meningitidis методом ПЦР в режиме реального времени. Журн. микробиол. 2014; (6): 35–42.

27. Миронов К.О., Тагаченкова Т.А., Королева И.С., Платонов А.Е., Шипулин Г.А. Генетическая характеристика штаммов Neisseria meningitidis, выделенных от здоровых носителей в очагах менингококковой инфекции. Журн. микробиол. 2011; (2): 22–9.

28. Матосова С.В., Миронов К.О., Платонов А.Е., Шипулина О.Ю., Шипулин Г.А., Нагибина М.В., Венгеров Ю.Я. Молекулярно-биологический мониторинг возбудителей гнойного бактериального менингита на современном этапе. Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение 2018; 7(1): 93–9. DOI: 10.24411/2305-3496-2018-00012.

29. Матосова С.В., Миронов К.О., Платонов А.Е., Шипулина О.Ю., Нагибина М.В., Венгеров Ю.Я., Ченцов В.Б., Смирнова Т.Ю., Солдатова И.А., Шипулин Г.А. Молекулярно-биологический мониторинг Neisseria meningitidis на территории Москвы в период с 2011 по 2015 г. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2016; (2): 4–9.

30. Миронов К.О., Королева М.А., Платонов А.Е., Королева И.С., Шипулин Г.А. Генетическое типирование Neisseria meningitidis, циркулирующих в регионах России. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2013; (2): 36–40.

31. Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С., Шипулин Г.А. Анализ московской популяции штаммов Neisseria meningitidis методом мультилокусного секвенирования-типирования. Журн. микробиол. 2006; (2): 31–36.

32. Нагибина М.В., Венгеров Ю.Я., Матосова С.В., Миронов К.О., Платонов А.Е., Свистунова Т.С., Чернышов Д.В., Смирнова Т.Ю., Кадышев В.А., Рыжов Г.Э. Генерализованная форма менингококковой инфекции, вызванная N. meningitidis серогруппы W, на территории г. Москвы в 2011-2016 гг. Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение 2018; 7(1): 100–5. DOI: 10.24411/2305-3496-2018-00013.

33. Миронов К.О., Животова В.А., Матосова С.В., Кулешов К.В., Шипулина О.Ю., Гоптарь И.А., Валдохина А.В., Пимкина Е.В., Королева М.А., Королева И.С., Платонов А.Е., Шипулин Г.А. Характеристика Neisseria meningitidis серогруппы W, циркулирующих на территории Москвы, c помощью массового параллельного секвенирования. Эпидемиология и вакцинопрофилактика 2017; 4(95): 33–8.


Об авторах / Для корреспонденции


Миронов Константин Олегович – д.м.н., руководитель научной группы разработки новых методов выявления генетических полиморфизмов ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; е-mail: mironov@pcr.ru; ORCID: https://orcid.org/0000-0001-8207-9215


Бионика Медиа