Клональные комплексы Neisseria meningitidis, циркулирующие на территории России, и их роль в эпидемическом процессе менингококковой инфекции


Миронов К.О.

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва
Эпидемические подъемы заболеваемости генерализованными формами менингококковой инфекции, как и спорадический характер заболеваемости ими, ассоциированы с циркуляцией ограниченного количества клональных комплексов, обозначаемых с помощью мультилокусного секвенирования-типирования (МЛСТ). МЛСТ, наряду с серогруппированием, является основным методом внутривидовой классификации N. meningitidis. Результаты МЛСТ, полученные в разных лабораториях, регулярно публикуются в общедоступной базе данных http://pubmlst.org/neisseria/, что позволяет определять эпидемическую опасность (ее отсутствие) циркулирующих возбудителей. В обзоре представлены анализ результатов МЛСТ российских изолятов N. meningitidis, которые были опубликованы в базе данных http://pubmlst.org/neisseria/, и эпидемиологическая характеристика выявленных клональных комплексов, определены направления дальнейшего молекулярно-биологического мониторинга ведущих серогрупп N. meningitidis, вовлеченных в эпидемический процесс.

Литература


1. Покровский В.И., Фаворова Л.А., Костюкова Н.Н. Менингококковая инфекция. М.: Медицина, 1976. 275 с.

2. Cartwright K. (еd.). Meningococcal disease. John Wiley & Sons Ltd, 1995. 316 p.

3. Pollard A.J., Maiden M.C.J. (еds.). Meningococcal disease: methods and protocols. Humana Press Inc., 2001. 721 p.

4. Harrison O.B., Claus H., Jiang Y., Bennett J.S., Bratcher H.B., Jolley K.A., Corton C., Care R., Poolman J.T., Zollinger W.D., Frasch C.E., Stephens D.S., Feavers I., Frosch M., Parkhill J., Vogel U., Quail M.A., Bentley S.D., Maiden M.C. Description and nomenclature of Neisseria meningitidis capsule locus. Emerg. Infect. Dis. 2013; 19(4): 566–573.

5. Mustapha M.M., Marsh J.W., Harrison L.H. Global epidemiology of capsular group W meningococcal disease (1970–2015): Multifocal emergence and persistence of hypervirulent sequence type (ST)-11 clonal complex. Vaccine 2016; 34(Issue 13): 1515–1523.

6. Stephens D.S. Conquering the meningococcus. Microbiol. Rev. 2007; 31(1): 3–14.

7. Королева М.А. Покровский В.И., Миронов К.О., Платонов А.Е., Шипулин Г.А., Белошицкий Г.В., Закроева И.М., Мельникова А.А., Кошкина Н.А., Королева И.С. Эпидемиологический мониторинг за гнойными бактериальными менингитами в историческом и современном аспектах. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2014; (2): 52–56.

8. Костюкова Н.Н., Бехало В.А., Чернышева Т.Ф. Менингококковая инфекция в России: прошлое и ближайшие перспективы. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2014; (2): 73–79.

9. Костюкова Н.Н., Туманян А.А., Бабич Е.М., Татарников В.М., Сипачева Н.Б., Деркач С.А., Багирова Л.Ш. Роль и место серологических исследований в системе эпидемиологического надзора за менингококковой инфекцией. Журн. микробиол. 1988; (11): 36–41.

10. Девяткина Н.П., Демина А.А., Пичушков А.В. Эпидемиологические особенности менингококковой инфекции в СССР. Журн. микробиол. 1989; (12): 36–40.

11. Костюкова Н.Н. Миронова Т.К., Лещинская Е.В. Микробиологическая характеристика менингококковой инфекции в Москве в годы периодического подъема заболеваемости (1968–1971). Журн. микробиол. 1974; (5): 29–32.

12. Костюкова Н.Н., Туманян А.А., Миронова Т.К., Петрова З.С. Эпидемиологическая оценка серологического группирования менингококков. Журн. микробиол. 1978; (10): 93–97.

13. Покровский В.И., Демина А.А. Менингококковая инфекция серогруппы В. Журн. микробиол. 1987; (5): 36–40.

14. Королева И.С., Белошицкий Г.В., Закроева И.М., Королева М.А. Менингококковая инфекция в Российской Федерации. Медицинский алфавит. Эпидемиология и гигиена 2015; (6): 27–28.

15. Королева И.С., Королева М.А., Белошицкий Г.В. Современная эпидемическая ситуация по менингококковой инфекции в Российской Федерации и возможности вакцинопрофилактики. Медицинский алфавит. Эпидемиология и гигиена 2016; (6): 15–17.

16. Демина А.А. Эпидемиологический надзор за менингококковой инфекцией и гнойными бактериальными менингитами. Эпидемиол. и инфекц. бол. 1999; (2): 25–28.

17. Королева И.С., Демина А.А. Серосубтипирование менингококков серогруппы B. Журн. микробиол. 1995; (5): 41–44.

18. Костюкова Н.Н., Коржуева Н.А., Деркач С.А., Багирова Л.Ш., Мерзенюк З.А., Гульман Л.А., Ниякая В.Н., Волкова М.О. Этиологическая структура острых бактериальных менингитов в различных регионах. Журн. микробиол. 1992; (7–8): 14–17.

19. Девяткина Н.П., Демина А.А. Эпидемиологический надзор за менингококковой инфекцией и прогнозирование развития эпидемического процесса. Журн. микробиол. 1986; (11): 13–16.

20. Aguilera J.F., Perrocheau A., Meffre C., Hahné S., W135 Working Group. Outbreak of serogroup W135 meningococcal disease after the hajj pilgrimage, Europe, 2000. Emerg. Infect. Dis. 2002; 8(8): 761–167.

21. Lucidarme J., Hill D.M., Bratcher H.B., Gray S.J., du Plessis M., Tsang R.S., Vazquez J.A., Taha M.K., Ceyhan M., Efron A.M., Gorla M.C., Findlow J., Jolley K.A., Maiden M.C., Borrow R. Genomic resolution of an aggressive, widespread, diverse and expanding meningococcal serogroup B, C and W lineage. J. Infect. 2015; 71(5): 544–552.

22. Mayer L.W., Mayer L.W., Reeves M.W., Al-Hamdan N., Sacchi C.T., Taha M.K., Ajello G.W., Schmink S.E., Noble C.A., Tondella M.L., Whitney A.M., Al-Mazrou Y., Al-Jefri M., Mishkhis A., Sabban S., Caugant D.A., Lingappa J., Rosenstein N.E., Popovic T. Outbreak of W135 meningococcal disease in 2000: not emergence of a new W135 strain but clonal expansion within the electrophoretic type-37 complex. J. Infect. Dis. 2002; 185(11): 1596–1605.

23. Королева И.С., Белошицкий Г.В., Спирихина Л.В., Грачева A.M., Закроева И.М., Тагаченкова Т.А., Королева М.А., Миронов К.О., Шипулин Г.А. Основные направления и результаты научных исследований по проблеме менингококковой инфекции и гнойных бактериальных менингитов. Эпидемиол. и инфекц. бол. 2009; (2): 40–44.

24. Шипулин Г.А. Вклад Центрального НИИ эпидемиологии в развитие отечественной молекулярной диагностики. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2014; (2): 21–27.

25. Fox A.J., Taha M.K., Vogel U. Standardized nonculture techniques recommended for European reference laboratories. FEMS Microbiol. Rev. 2007; 31(1): 84–88.

26. Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С., Тагаченкова Т.А., Закроева И.М., Заикин В.Л., Соловьева Л.Я., Браславская С.И., Шипулин Г.А. Мониторинг бактерий вида Neisseria meningitidis на основании последовательностей вариабельных фрагментов поверхностных белков FetA и PorA. Журн. микробиол. 2009; (3): 23–27.

27. Jolley K.A., Brehony C., Maiden M.C. Molecular typing of meningococci: recommendations for target choice and nomenclature. FEMS Microbiol. Rev. 2007; 31(1): 89–96.

28. Платонов А.Е., Шипулин Г.А., Платонова О.В. Мультилокусное секвенирование – новый метод генотипирования бактерий и первые результаты его применения. Генетика 2000; 36(5): 597–605.

29. Maiden M.C., Bygraves J.A., Feil E., Morelli G., Russell J.E., Urwin R., Zhang Q., Zhou J., Zurth K., Caugant D.A., Feavers I.M., Achtman M., Spratt B.G. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms. PNAS 1998; 95: 3140–3145.

30. Clonal complex designation. http://pubmlst.org/neisseria/info/complexes. shtml

31. Jolley К.А., Maiden M.C.J. BIGSdb: Scalable analysis of bacterial genome variation at the population level. BMC Bioinformatics 2010; (11): 595.

32. Brehony C., Jolley K.A., Maiden M.C. Multilocus sequence typing for global surveillance of meningococcal disease. FEMS Microbiol. Rev. 2007; 31(1): 15–26.

33. Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С., Шипулин Г.А. Анализ московской популяции штаммов Neisseria meningitidis методом мультилокусного секвенирования-типирования. Журн. микробиол. 2006; (2): 31–36.

34. Achtman M., van der Ende A., Zhu P., Koroleva I.S., Kusecek B., Morelli G., Schuurman I.G., Brieske N., Zurth K., Kostyukova N.N., Platonov A.E. Molecular epidemiology of serogroup a meningitis in Moscow, 1969 to 1997. Emerg. Infect. Dis. 2001; 7(3): 420–427.

35. Trotter C.L., Chandra M., Cano R., Larrauri A., Ramsay M.E., Brehony C., Jolley K.A., Maiden M.C., Heuberger S., Frosch M. A surveillance network for meningococcal disease in Europe. FEMS Microbiol. Rev. 2007; 31(1): 27–36.

36. Матосова С.В., Миронов К.О., Платонов А.Е., Шипулина О.Ю., Нагибина М.В., Венгеров Ю.Я., Ченцов В.Б., Смирнова Т.Ю., Солдатова И.А., Шипулин Г.А. Молекулярно-биологический мониторинг Neisseria meningitidis на территории Москвы в период с 2011 по 2015 г. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2016; (2): 4–9.

37. Миронов К.О., Королева М.А., Платонов А.Е., Королева И.С., Шипулин Г.А. Генетическое типирование Neisseria meningitidis, циркулирующих в регионах России. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2013; (2): 36–40.

38. Миронов К.О., Платонов А.Е., Дрибноходова О.П., Кусева В.И., Шипулин Г.А. Методика для определения серогрупп A, B, C и W Neisseria meningitidis методом ПЦР в режиме реального времени. Журн. микробиол. 2014; (6): 35–42.

39. Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С., Закроева И.М., Заикин В.Л., Соловьева Л.Я., Браславская С.И., Шипулин Г.А. Генетические субгруппы бактерий вида Neisseria meningitidis серогруппы А, выделенных от больных генерализованными формами менингококковой инфекции на территории Москвы в 1969–2006 гг. Журн. микробиол. 2008; (1): 7–12.

40. Миронов К.О., Тагаченкова Т.А., Королева И.С., Платонов А.Е., Шипулин Г.А. Генетическая характеристика штаммов Neisseria meningitidis, выделенных от здоровых носителей в очагах менингококковой инфекции. Журн. микробиол. 2011; (2): 22–29.

41. Максина Т.А. Эпидемиологическая значимость носителей менингококка в очагах менингококковой инфекции. Автореф. дис. … канд. мед. наук. М., 2011.

42. Тагаченкова Т.А., Королева И.С., Миронов К.О., Лыткина И.Н., Пяева А.П., Закроева И.М., Заикин В.Л., Соловьева Л.Я. Менингококковое носительство в очагах менингококковой инфекции. Эпидемиол. и инфекц. бол. 2009; (4): 6–10.

43. Jolley K., Hill D.M., Bratcher H.B., Harrison O.B., Feavers I.M., Parkhill J., Maiden M.C. Resolution of a meningococcal disease outbreak from whole-genome sequence data with rapid Web-based analysis methods. J. Clin. Microbiol. 2012; 50(9): 3046–3053.

44. Zhu P., van der Ende A., Falush D., Brieske N., Morelli G., Linz B., Popovic T., Schuurman I.G., Adegbola R.A., Zurth K., Gagneux S., Platonov A.E., Riou J.Y., Caugant D.A., Nicolas P., Achtman M. Fit genotypes and escape variants of subgroup III Neisseria meningitidis during three pandemics of epidemic meningitis. PNAS 2001; 98(9): 5234–5239.

45. Bratcher H.B., Corton C., Jolley K.A., Parkhill J., Maiden M.C. A gene-by-gene population genomics platform: de novo assembly, annotation and genealogical analysis of 108 representative Neisseria meningitidis genomes. BMC Genomics 2014; 15(1): 1138.

46. Lamelas A., Harris S.R., Röltgen K., Dangy J.P., Hauser J., Kingsley R.A., Connor T.R., Sie A., Hodgson A., Dougan G., Parkhill J., Bentley S.D., Pluschke G.. Emergence of a new epidemic Neisseria meningitidis serogroup A Clone in the African meningitis belt: high-resolution picture of genomic changes that mediate immune evasion. MBio 2014; 5(5): e01974-14.

47. Костюкова Н.Н., Бехало В.А. От безвредного носительства к гнойному менингиту. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2013; (2): 46–52.

48. Koroleva I.S., Platonov A.E., van der Ende A., Kuijper E., Dankert J. Characteristics of pathogenic Neisseria meningitidis in Moscow: prevalence of ‘non-European’ strains. Clin. Microbiol. Infect. 1998; 4(3): 123–128.

49. Titov L.P., Siniuk K.V., Wollenberg K.K., Unemo M., Hedberg S.T., Glazkova S.E., Lebedzeu F.A., Nosava A.S., Yanovich V.O., Xirasagar S., Hurt D., Huyen Y. Evolutionary epidemiology of Neisseria meningitidis strains in Belarus compared to other European countries. Acta Microbiol. Immunol. Hung. 2013; 60(4): 397–410.

50. Kupferschmidt K. Infectious diseases. Bacterial meningitis finds new niche in gay communities. Science 2013; 341: 328.

51. Королева И.С., Белошицкий Г.В., Спирихина Л.В., Закроева И.М., Тагаченкова Т.А., Королева М.А. Использование некоторых параметрических характеристик для изучения эпидемиологических особенностей менингококковой инфекции и гнойных бактериальных менингитов. Журн. микробиол. 2010; (2): 20–23.


Об авторах / Для корреспонденции


Для корреспонденции:
Миронов Константин Олегович – канд. мед. наук, руководитель науч. группы разработки новых методов выявления генетических полиморфизмов Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Адрес: 111123, Москва, ул. Новогиреевская, д. 3а
Телефон: +7(495) 305-54-24
E-mail: mironov@pcr.ru


Похожие статьи


Бионика Медиа