English
Использование интегративных показателей на основе сведений о результатах лабораторных исследований для оценки эффективности действующей системы эпидемиологического надзора
DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2025.15.1.35-42
Дубоделов Д.В., Акимкин В.Г., Семененко Т.А., Есьман А.С., Кузин С.Н., Углева С.В., Воронин Е.М., Герасимов А.Н., Черкашина А.С., Хафизов К.Ф., Сычева Н.В., Корабельникова М.И., Монахова А.А., Береговых Р.М.
1) Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; 2) Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Минздрава России, Москва, Россия
Материалы и методы. Проведен расчет и анализ интегративных показателей на основе результатов ПЦР-исследований на наличие РНК SARS-CoV-2 по данным платформы SOLAR (System of Laboratory Aggregation Result) и сведений об уровне заболеваемости COVID-19 в субъектах Российской Федерации за период 2022–2023 гг.
Результаты. Показано, что результаты ПЦР-исследований могут быть использованы для оценки динамики эпидемического процесса. Предложены методы оценки полноты и объективности данных о заболеваемости в субъектах Российской Федерации с использованием интегративных показателей. Обосновано применение интегративных показателей для выявления региональных особенностей в диагностике и учете случаев заболевания COVID-19.
Заключение. Интегративные показатели, основанные на данных о заболеваемости и результатах лабораторных исследований, могут быть успешно использованы в качестве критериев оценки полноты и объективности информации в эпидемиологическом анализе. Они также могут служить основой для сравнительной и оперативной оценки эффективности системы эпидемиологического надзора.
Литература
1. Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Смоленский В.Ю., Брагина И.В., Орлов М.Ю., Демина Ю.В. и др. COVID-19: научно-практические аспекты борьбы с пандемией в Российской Федерации. Саратов: ООО «Амирит», 2021. 608 с.
Popova A.Yu., Ezhlova E.B., Smolenskij V.Yu., Bragina I.V., Orlov M.Yu., Demina Yu.V. et al.
2. Акимкин В.Г., Семененко Т.А., Хафизов К.Ф., Углева С.В., Дубоделов Д.В., Колосовская Е.Н. Стратегия геномного эпидемиологического надзора. Проблемы и перспективы. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2024; 101(2): 163–172. DOI: 10.36233/0372-9311-507
Akimkin V.G., Semenenko T.A., Khafizov K.F., Ugleva S.V., Dubodelov D.V., Kolosovskaia E.N.
3. Акимкин В.Г., Семененко Т.А., Углева С.В., Дубоделов Д.В., Кузин С.Н., Яцышина С.Б. и др. COVID-19 в России: эпидемиология и молекулярно-генетический мониторинг. Вестник РАМН 2022; 77(4): 254–260. DOI: 10.15690/vramn2121
Akimkin V.G., Semenenko T.A., Ugleva S.V., Dubodelov D.V., Kuzin S.N., Iatsyshina S.B. et al.
4. Черкасский Б.Л. Теоретическое обоснование структуры эпидемиологического надзора. В кн.: Сб. науч. тр. «Эпидемиологический надзор за инфекционными болезнями». М. 1987: 16–22.
Cherkasskу B.L.
5. Акимкин В.Г., Попова А.Ю., Плоскирева А.А., Углева С.В., Семененко Т.А., Пшеничная Н.Ю. и др. COVID-19: эволюция пандемии в России. Сообщение I: проявления эпидемического процесса COVID-19. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2022; 99(3): 269–286. DOI: 10.36233/0372-9311-276
Akimkin V.G., Popova A.Y., Ploskireva A.A., Ugleva S.V., Semenenko T.A., Pshenichnaia N.Yu. et al.
6. Болотовский В.Н., Зарицкий А.М., Зуев В.А., Кашкин К.П., Кондрусев А.И., Ковалева Е.П. и др. Эпидемиологический анализ. В кн.: Покровский В.И., ред. Руководство по эпидемиологии инфекционных болезней
Bolotovskii V.N., Zaritskii A.M., Zuev V.A., Kashkin K.P., Kondrusev A.I., Kovaleva E.P. et al.
7. Акимкин В.Г., Хафизов К.Ф., Дубоделов Д.В., Воронин Е.М., Черкашина А.С., Углева С.В. и др. Молекулярно-генетический мониторинг и технологии цифровой трансформации в современной эпидемиологии. Вестник РАМН 2023; 78(4): 363–369. DOI: 10.15690/vramn13672
Akimkin V.G., Khafizov K.F., Dubodelov D.V., Voronin E.M., Cherkashina A.S., Ugleva S.V. et. al.
8. Virtanen P., Gommers R., Oliphant T.E., Haberland M., Reddy T., Cournapeau D. et. al. SciPy 1.0: Fundamental Algorithms for Scientific Computing in Python. Nat. Methods 2020; (17): 261–272. DOI: 10.1038/s41592-019-0686-2
9. The pandas development team. 2024. pandas-dev/pandas: Pandas (v2.2.2). Zenodo. DOI: 10.5281/zenodo.10957263
10. Seabold S., Perktold J. Statsmodels: Econometric and statistical modeling with python. 2010. Conference: Python in Science Conference. DOI: 10.25080/Majora-92bf1922-011
11. Профилактика инфекционных болезней. Эпидемиология и профилактика COVID-19: Методические рекомендации МР 3.1.0170-20. М.: Роспотребнадзор, 2020.
[Prevention of infectious diseases. Epidemiology and prevention of COVID-19. Methodological recommendations of MP 3.1.0170-20]. Moscow, 2020. (In Russ.).
12. Mei Q., Li J., Du R., Yuan X., Li M., Li J. Assessment of patients who tested positive for COVID-19 after recovery. Lancet Infect. Dis. 2020; 20(9): 1004–1005. DOI: 10.1016/S1473-3099(20)30433-3
13. Calba C., Goutard F.L., Hoinville L., Hendrikx P., Lindberg A., Saegerman C. et al. Surveillance systems evaluation: a systematic review of the existing approaches. BMC Public Health 2015; 15(448): 1–13. DOI: 10.1186/s12889-015-1791-5
14. Hendrikx P., Gay E., Chazel M., Moutou F., Danan C., Richomme C. et al. OASIS: an assessment tool of epidemiological surveillance systems in animal health and food safety. Epidemiol. Infect. 2011; 139(10): 1486–1496. DOI: 10.1017/S0950268811000161
15. Добролюбова Е.И., Южаков В.Н. Комплексная оценка результативности и эффективности санитарно-эпидемиологического надзора. Социум и власть 2020; 6(86): 40–54. DOI: 10.22394/1996-0522-2020-6-40-54
Dobrolyubova E.I., Yuzhakov V.N.
16. Declich S., Carter A.O. Public health surveillance: historical origins, methods and evaluation. Bull. World Health Organ 1994; 72(2): 285–304.
Об авторах / Для корреспонденции
Дубоделов Дмитрий Васильевич, к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории вирусных гепатитов, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; dubodelov@cmd.su; https://orcid.org/0000-0003-3093-5731
Акимкин Василий Геннадьевич – академик РАН, д.м.н., профессор, директор, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; crie@pcr.su; https://orcid.org/0000-0003-4228-9044
Семененко Татьяна Анатольевна – д.м.н., профессор, руководитель отдела эпидемиологии, Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Минздрава России; профессор кафедры инфектологии и вирусологии, Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский университет), Москва, Россия; semenenko@gamaleya.org; https://orcid.org/0000-0002-6686-9011
Есьман Анна Сергеевна – научный сотрудник лаборатории молекулярных методов изучения генетических полиморфизмов, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; esman@cmd.su; https://orcid.org/0000-0002-5456-7649
Кузин Станислав Николаевич – д.м.н., профессор, заведующий лабораторией вирусных гепатитов, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; kuzin@cmd.su, https://orcid.org/0000-0002-0616-9777
Углева Светлана Викторовна – д.м.н., доцент, руководитель научно-аналитического отдела, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; ugleva@cmd.su; https://orcid.org/ц0000-0002-1322-0155
Воронин Евгений Михайлович – к.м.н., руководитель научной группы математических методов и эпидемиологического прогнозирования, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; voronin@cmd.su; https://orcid.org/0000-0001-5925-7757
Герасимов Андрей Николаевич – д.ф.-м.н., профессор, ведущий научный сотрудник научной группы математических методов и эпидемиологического прогнозирования, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; gerasimov.a@cmd.su; https://orcid.org/0000-0003-4549-7172
Черкашина Анна Сергеевна – к.х.н., руководитель научной группы генной инженерии и биотехнологии, Центральный НИИ .эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Российская Федерация; cherkashina@pcr.ms; https://orcid.org/0000-0001-7970-7495
Хафизов Камиль Фаридович – к.б.н., заведующий лабораторией геномных исследований, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; khafizov@cmd.su; https://orcid.org/0000-0001-5524-0296
Сычева Наталья Владимировна – младший научный сотрудник лаборатории инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; sycheva.n@cmd. su; https://orcid.org/0000-0001-8557-6540
Корабельникова Марина Игоревна – научный сотрудник лаборатории вирусных гепатитов, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; korabelnikova@cmd.su; https://orcid.org/0000-0002-2575-8569
Монахова Ангелина Андреевна – аспирант, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; monaxova.angelina@mail.ru; https://orcid.org/0009-0000-9950-2649
Береговых Роман Михайлович – специалист по анализу и обработке данных, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; beregovykh@cmd.su, https://orcid.org/0009-0000-3956-21480
Похожие статьи
