Характеристика штаммов Brucella melitensis, изолированных в разных регионах Российской Федерации


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2024.14.4.70-6

Сердюк Н.С., Жилченко Е.Б., Кузнецова И.В., Жаринова Н.В., Ковалев Д.А., Шапаков Н.А., Хачатурова А.А., Белозерова О.Н., Карапетян М.Г.

Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, Ставрополь, Россия
Цель исследования. Изучение фенотипических и молекулярно-генетических свойств штаммов B. melitensis, выделенных на неблагополучных по бруцеллезу территориях Российской Федерации с 1949 по 2019 г.
Материалы и методы. Использовали 74 штамма возбудителя бруцеллеза из коллекции Ставропольского противочумного института Роспотребнадзора и 3 референсных штамма (63/9, 16М и 706) из базы данных MLVA http://microbesgenotyping.i2bc.paris-saclay.fr/databases.
Результаты. Изученные штаммы B. melitensis отличались значительным разнообразием по 14 VNTR-локусам. Выявлено, что штаммы B. melitensis разделились на два крупных кластера. Один кластер образован штаммами, циркулирующими в азиатской части России, а второй кластер представлен штаммами из Европейской части России – Северо-Кавказского и Южного федеральных округов.
Заключение. Полученные данные используются для постоянного молекулярно-генетического мониторинга возбудителя бруцеллеза на неблагополучных по бруцеллезу территориях России, в том числе в качестве эффективного инструмента ретроспективного эпидемиологического анализа, что позволит качественно улучшить эпидемиологический надзор за этой инфекцией. Использование комплексных данных как фенотипического, так и генетического характера позволяет расширять возможности дифференциации штаммов во время расследования вспышек бруцеллеза в будущем.

Литература


1. Пономаренко Д.Г., Скударева О.Н., Хачатурова А.А., Германова А.Н., Лукашевич Д.Е., Логвиненко О.В. и др. Об эпизоотолого-эпидемилогической ситуации по бруцеллезу в мире в 2011–2020 гг. и прогноз на 2021 г. в Российской Федерации. Проблемы особо опасных инфекций 2021; (2): 41–51. DOI: 10.21055/0370-1069-2021-2-41-51


Ponomarenko D.G., Skudareva O.N., Khachaturova A.A., Germanova A.N., Lukashevich D.E., Logvinenko O.V. et al.


2. Щипилева И.А., Марковская Е.И., Кретенчук О.Ф. Антибиотикотерапия бруцеллеза. Современное состояние и перспективы совершенствования. Антибиотики и химиотерапия 2022; 67(3–4): 77–84. DOI: 10.37489/0235-2990-2022-67-3-4-77-84


Shchipileva I.A., Markovskaya E.I., Kretenchuk O.F.


3. Пономаренко Д.Г., Русанова Д.В., Бердникова Т.В., Хачатурова А.А., Манин Е.А., Куличенко А.Н. Обзор эпизоотологической и эпидемиологической ситуации по бруцеллезу в Российской Федерации в 2017 г. и прогноз на 2018 г. Проблемы особо опасных инфекций 2018; (2): 23–9. DOI: 10.21055/0370-1069-2018-2-23-29


Ponomarenko D.G., Rusanova D.V., Berdnikova T.V., Khachaturova A.A., Manin E.A., Kulichenko A.N.


4. Johansen T.B., Lonneke S., Jensen V.K. Whole-genome sequencing and antimicrobial resistance in Brucella melitensis from a Norwegion perspective. Sci. Rep. 2018; (8): 8538. DOI: 10.1038/s41598-018-26906-3


5. Пономаренко Д.Г., Русанова Д.В., Хачатурова А.А., Скударева О.Н., Логвиненко О.В., Ракитина Е.Л. и др. Анализ эпидемической и эпизоотической ситуации по бруцеллезу в мире в 2019 г. и прогноз на 2020 г. в Российской Федерации. Проблемы особо опасных инфекций 2020; (2): 48–56. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-2-48-56


Ponomarenko D.G., Rusanova D.V., Khachaturova A.A., Skudareva O.N., Logvinenko O.V., Rakitina E.L. et al.


6. Зульпукарова Н.М., Мамаев И.А., Магомедалиева С.Г., Адилова М.А., Исаева Р.Х, Джаватханова М.И. Эпидемические и клинические особенности некоторых природно-очаговых инфекционных заболеваний в Республике Дагестан. Вестник новых медицинских технологий 2018; (4): 77–82. DOI: 10.24411/2075-4094-2018-16095


Zulpukarova N.M., Mamaev I.A., Magomedalieva S.G., Adilova M.A., Isaeva R.Kh., Dzhavatkhanova M.I.


7. Намруева Л.В., Иванов Н.П. Тренды, проблемы и перспективы развития животноводства на юге России. Вестник ВолгГУ. Региональная экономика. 2018; (1): 55–63. DOI: 10.15688/jvolsu3.2018.1.6


Namrueva L.V., Ivanov N.P.


8. Хачатурова А.А., Пономаренко Д.Г., Ковалев Д.А., Германова А.Н., Лукашевич Д.Е., Русанова Д.В. и др. Анализ заболеваемости людей бруцеллезом и молекулярно-биологическая характеристика изолятов Brucella melitensis на длительно неблагополучных по бруцеллезу территориях юга европейской части России. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии 2022; 99(1): 63–74. DOI: 10.36233/0372-9311-185


Khachaturova A.A., Ponomarenko D.G., Kovalev D.A., Germanova A.N., Lukashevich D.E., Rusanova D.V. et al.


9. Suarez-Esquivel M., Chaves-Olarte E., Moreno E., Guzman-Verri C. Brucella Genomics: Macro and Micro Evolution. Int. J. Mol. Sci. 2020; 21(20): 7749–57. DOI: 10.3390/ijms21207749


10. Prakash J., Jacob J., Rachel T., Vasudevan K. Genomic analysis of Brucella melitensis reveals new insights into phylogeny and evolutionary divergence. Indian J Med Microbiol. 2023; 44: 100360. DOI: 10.1016/j.ijmmb.2023.02.003


11. Кузнецова И.В., Ковалев Д.А., Евченко Ю.М., Шакирова Л.И., Швецова Н.М., Пономаренко Д.Г. и др. Изучение генетического разнообразия штаммов бруцелл, выделенных в Северо-Кавказском Федеральном округе. Проблемы особо опасных инфекций 2017; (3): 58–62. DOI: 10.21055/0370-1069-2017-3-58-62


Kuznetsova I.V., Kovalev D.A., Evchenko Yu.M., Shakirova L.I., Shvetsova N.M., Ponomarenko D.G. et al. [Study of genetic diversity of Brucella strains isolated in the North Caucasian Federal District. Problems of Especially Dangerous Infections 2017; (3): 58–62. (In Russ.). DOI:10.21055/0370-1069-2017-3-58-62


12. Le Flèche P., Jacques I., Grayon M., Al Dahouk S., Bouchon P., Denoeud F. et al. Evaluation and selection of tandem repeat loci for a Brucella MLVA typing assay. BMC Microbiol. 2006; 6: 9. DOI: 10.1186/1471-2180-6-9


13. Ma J.Y., Wang H., Zhang X.F., Xu L.Q., Hu G.Y., Jiang H. et al. MLVA and MLST typing of Brucella from Qinghai, China. Infect. Dis. Poverty 2016; (5): 26–37. DOI: 10.1186/s40249-016-0123-z


14. Pisarenko S.V., Kovalev D.A., Volynkina A.S., Ponomarenko D.G., Rusanova D.V., Zharinova N.V. et al. Global evolution and phylogeography of Brucella melitensis strains. BMC Genomics 2018; (19): 353–62. DOI: 10.1186/s12864-018-4762-2


Об авторах / Для корреспонденции


Сердюк Наталия Сергеевна – к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории «Коллекция патогенных микроорганизмов», Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, Ставрополь, Россия; nata.serdyuk.83@mail.ru; http://orcid.org/0000-0001-5350-0111
Жилченко Елена Борисовна – к.б.н., заведующая лабораторией «Коллекция патогенных микроорганизмов», Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, Ставрополь, Россия; stavnipchi@mail.ru; https://orcid.org/0000-0001-7180-1292
Кузнецова Ирина Владимировна – к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории биохимии, Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, Ставрополь, Россия; stavnipchi@mail.ru; https://orcid.org/0000-0001-9513-0761
Жаринова Нина Вадимовна – к.б.н, старший научный сотрудник лаборатории «Коллекция патогенных микроорганизмов», Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, Ставрополь, Россия; stavnipchi@mail.ru; https://orcid.org/0000-0001-6718-4877
Ковалев Дмитрий Анатольевич – к.х.н, заведующий лабораторией. Биохимии, Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, Ставрополь, Россия; stavnipchi@mail.ru; https://orcid.org/0000-0002-9366-5647
Шапаков Николай Андреевич – младший научный сотрудник лаборатории биохимии, Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, Ставрополь, Россия; stavnipchi@mail.ru; https://orcid.org/0000-0001-9152-4026
Хачатурова Анна Андреевна – научный сотрудник лаборатории бруцеллеза, Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, Ставрополь, Россия; stavnipchi@mail.ru; https://orcid.org/0000-0002-7459-7204
Белозерова Ольга Николаевна – младший научный сотрудник лаборатории «Коллекция патогенных микроорганизмов», Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, Ставрополь, Россия; stavnipchi@mail.ru; https://orcid.org/0009-0002-5570-557X
Карапетян Маня Григоревна – младший научный сотрудник лаборатории «Коллекция патогенных микроорганизмов», Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, Ставрополь, Россия; stavnipchi@mail.ru; https://orcid.org/0009-0005-3006-5504


Похожие статьи


Бионика Медиа