Метод измерения размера клеточного резервуара ВИЧ и определение его у пациентов без опыта приема АРТ


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2021.11.4.66-72

Квасов Н.А., Полякова А.К., Лопатухин А.Э., Мурзакова А.В., Шемшура А.Б., Киреев Д.Е.

1) Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; 2) Клинический центр профилактики и борьбы со СПИД Министерства здравоохранения Краснодарского края, Краснодар, Россия
Цель исследования. Разработка метода определения размера резервуара, измерение его у ВИЧ-инфицированных лиц без опыта приема АРТ и анализ его связи с вирусной нагрузкой (ВН), длительностью инфекции и иммунным статусом.
Материалы и методы. Обследованы 268 ВИЧ-инфицированных пациентов без опыта АРТ с известными сроками заражения. На момент взятия крови у пациентов определяли ВН и показатель иммунного статуса. ДНК выделяли из мононуклеарных клеток периферической крови (МКПК) и количественно оценивали методом ПЦР в реальном времени. Размер резервуара рассчитывали как число копий провирусной ДНК к общему числу клеток. Результаты выражали в log10 копий/106 МКПК.
Результаты. Концентрация ДНК ВИЧ варьировала от 0,04 до 3,84 log10 копий ДНК ВИЧ/106 МКПК (медиана – 2,22, межквартильный диапазон – 1,74–2,72 log10 копий ДНК ВИЧ/106 МКПК). Размер резервуара коррелировал с ВН (r = 0,526; p < 0,01), иммунным статусом (r = -0,189; p < 0,05) и длительностью инфекции (r = -0,282; p < 0,01).
Заключение. Концентрация ДНК ВИЧ в качестве маркера размера вирусного резервуара позволяет получить дополнительную информацию о течении заболевания. Можно рекомендовать использовать этот показатель в совокупности с ВН и иммунным статусом для случаев инфекции на ранних стадиях.
Ключевые слова: латентность, резервуар, ДНК ВИЧ, ПЦР в реальном времени, ВИЧ, лечение
Полный текст статьи доступен
в "Библиотеке Врача"

Литература

1. Deeks S.G., Lewin S.R., Havlir D.V. The end of AIDS: HIV infection as a chronic disease. The Lancet 2013; 382(9903), 1525–33. https://doi.org/ 10.1016/S0140-6736(13)61809-7


2. Турсунов Р.А., Канестри В.Г., Симонова Е.Г., Раичич Р.Р. Антиретровирусная терапия-новая эпоха профилактики ВИЧ-инфекции. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии 2018; 10(1): 37–46. https://doi.org/10.22328/2077-9828-2018-10-1-37-46


Tursunov R.A., Kanestri V.G., Simonova E.G., Raichich R.R.


3. Barton K., Winckelmann A., Palmer S. HIV-1 reservoirs during suppressive therapy. Trends in Microbiology 2016; 24(5), 345–55. https://doi.org/10.1016/j.tim.2016.01.006


4. Abdel-Mohsen M., Richman D., Siliciano R.F., Nussenzweig M.C., Howell B.J., Martinez-Picado J., Montaner L.J. Recommendations for measuring HIV reservoir size in cure-directed clinical trials. Nature Medicine 2020; 26(9): 1339–50. https://doi.org/10.1038/s41591-020-1022-1


5. Kiselinova M., De Spiegelaere W., Buzon M.J., Malatinkova E., Lichterfeld M., Vandekerckhove L. Integrated and total HIV-1 DNA predict ex vivo viral outgrowth. PLoS Рathogens 2016; 12(3); e1005472. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1005472


6. Tsiara C.G., Nikolopoulos G.K., Bagos P. G., Goujard C., Katzenstein T.L., Minga A.K., Hatzakis A. Impact of HIV type 1 DNA levels on spontaneous disease progression: a meta-analysis. AIDS Research and Human Retroviruses 2012; 28(4): 366–73. https://doi.org/10.1089/aid. 2011.0032


7. Shiramizu B., Paul R., Williams A., Shikuma C., Watters M., Grove J., Valcour V. HIV proviral DNA associated with decreased neuropsychological function. J. Neuropsychiatry Clin. Neurosci. 2007; 19(2): 157–63. https://doi.org/10.1176/jnp.2007.19.2.157


8. Parisi S.G., Andreis S., Mengoli C., Scaggiante R., Ferretto R., Manfrin V., Sarmati L. Baseline cellular HIV DNA load predicts HIV DNA decline and residual HIV plasma levels during effective antiretroviral therapy. J. Clin. Microbiol. 2012; 50(2): 258–63. https://doi.org/10.1128/JCM. 06022-11


9. Rouzioux C., Hubert J.B., Burgard M., Deveau C., Goujard C., Bary M., Meyer L. Early levels of HIV-1 DNA in peripheral blood mononuclear cells are predictive of disease progression independently of HIV-1 RNA levels and CD4+ T cell counts. J. Infectious Diseases 2005; 192(1), 46–55. https://doi.org/10.1086/430610


10. Бобкова М.Р. Стратегии излечения ВИЧ-инфекции: основные методологические подходы и проблемы их реализации. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии 2020; 12(1): 22–31. https://doi.org/10.22328/2077-9828-2020-12-1-22-31


Bobkova M.R.


11. Wong J. K., Hezareh M., Günthard H. F., Havlir D.V., Ignacio C.C., Spina C.A., Richman D.D. Recovery of replication-competent HIV despite prolonged suppression of plasma viremia. Science 1997; 278(5341): 1291–5. https://doi.org/10.1126/science.278.5341.1291


12. Butler S.L., Hansen M.S., Bushman F.D. A quantitative assay for HIV DNA integration in vivo. Nature Medicine 2001; 7(5): 631–4. https://doi.org/10.1038/87979


13. Bruner K.M., Wang Z., Simonetti F.R., Bender A.M., Kwon K.J., Sengupta S., Siliciano R.F. A quantitative approach for measuring the reservoir of latent HIV-1 proviruses. Nature 2019: 566(7742): 120–5. https://doi.org/10.1038/s41586-019-0898-8


14. Gaebler C., Lorenzi J.C., Oliveira T.Y., Nogueira L., Ramos V., Lu C. L., Nussenzweig M.C. Quadruplex qPCR for qualitative and quantitative analysis of the HIV-1 latent reservoir. bioRxiv 2019; 641951. https://doi.org/10.1101/641951


15. Веселова Е.И., Каминский Г.Д., Самойлова А.Г., Васильева И.А. (2019). Резервуар ВИЧ у больных ВИЧ-инфекцией. Туберкулез и болезни легких 2019; 97(5): 50–7. https://doi.org/10.21292/2075-1230-2019-97-5-50-57


Veselova E.I., Kaminsky G.D., Samoylova A.G., Vasilyeva I.A. HIV reservoir in HIV patients. Tuberculosis and Lung Diseases 2019; 97(5): 50–7. (In Russ.). https://doi.org/10.21292/2075-1230-2019-97-5-50-57


16. Rouzioux C., Avettand-Fenoël V. Total HIV DNA: a global marker of HIV persistence. Retrovirology 2018; 15(1): 1–7. https://doi.org/ 10.1186/s12977-018-0412-7


17. Wang Z., Simonetti F.R., Siliciano R.F., Laird G.M. Measuring replication competent HIV-1: advances and challenges in defining the latent reservoir. Retrovirology 2018; 15(1): 1–9. https://doi.org/10.1186/s12977-018-0404-7


18. Imamichi H., Dewar R.L., Adelsberger J.W., Rehm C.A., O’Doherty U., Paxinos E., Lane H.C. Defective HIV-1 proviruses produce novel protein-coding RNA species in HIV-infected patients on combination antiretroviral therapy. Proceedings of the National Academy of Sciences 2016; 113(31): 8783–8. https://doi.org/10.1073/pnas.1609057113


19. Pham H.T., Mesplède T. The latest evidence for possible HIV-1 curative strategies. Drugs in Context 2018; (7). DOI: 10.7573/dic.212522


20. Sengupta S., Siliciano R.F. Targeting the latent reservoir for HIV-1. Immunity 2018; 48(5): 872–95. https://doi.org/10.1016/j.immuni. 2018.04.030


21. Saitoh A., Hsia K., Fenton T., Powell C.A., Christopherson C., Fletcher C.V., Spector S.A. Persistence of human immunodeficiency virus (HIV) type 1 DNA in peripheral blood despite prolonged suppression of plasma HIV-1 RNA in children. J. Infect. Dis. 2002; 185(10): 1409–16. https://doi.org/10.1086/340614


22. Hoen B., Cooper D.A., Lampe F.C., Perrin L., Clumeck N., Phillips A. N., QUEST Study Group. Predictors of virological outcome and safety in primary HIV type 1–infected patients initiating quadruple antiretroviral therapy: QUEST GW PROB3005. Clin. Infect. Dis. 2007; 45(3): 381–90. https://doi.org/10.1086/519428


23. Ngo-Giang-Huong N., Deveau C., Da Silva I., Pellegrin I., Venet A., Harzic M., French PRIMO Cohort Study Group. Proviral HIV-1 DNA in subjects followed since primary HIV-1 infection who suppress plasma viral load after one year of highly active antiretroviral therapy. AIDS 2001; 15(6): 665–73.


24. Tsiara C.G., Nikolopoulos G.K., Bagos P. G., Goujard C., Katzenstein T.L., Minga A.K., Hatzakis A. Impact of HIV type 1 DNA levels on spontaneous disease progression: a meta-analysis. AIDS Research and Human Retroviruses 2012; 28(4): 366–73. https://doi.org/10.1089/aid. 2011.0032


25. Goujard C., Bonarek M., Meyer L., Bonnet F., Chaix M.L., Deveau C., Agence Nationale de Recherche sur le Sida PRIMO Study Group. CD4+ cell count and HIV DNA level are independent predictors of disease progression after primary HIV type 1 infection in untreated patients. Clin. Infect. Dis. 2006; 42(5): 709–15. https://doi.org/10.1086/500213


Об авторах / Для корреспонденции

Квасов Никита Алексеевич – младший научный сотрудник, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; kvasov.bio@gmail.com; https://orcid.org/0000-0001-7153-8615
Полякова Ангелина Константиновна – младший научный сотрудник, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; angelina.polya@gmail.com https://orcid. org/0000-0001-8763-2331
Лопатухин Алексей Эдуардович – научный сотрудник, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; a.lopatukhin@gmail.com https://orcid.org/0000-0002-2826-699X
Мурзакова Анастасия Вениаминовна – научный сотрудник, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; Москва, Россия; murzakova_a.v@mail.ru https://orcid.org/0000-0002-1390-8021
Шемшура Андрей Борисович — к.м.н., врач клинической лабораторной диагностики, Клинический центр профилактики и борьбы со СПИД Минздрава Краснодарского края, Краснодар, Россия; shemsh@mail.ru
Киреев Дмитрий Евгеньевич – к.б.н., руководитель научной группы, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; dmitkireev@yandex.ru https://orcid.org/0000-0002-7896-2379


Похожие статьи

К содержанию номера

Бионика Медиа