Лекарственная устойчивость ВИЧ-1 у пациентов с вирусологической неэффективностью АРТ в России (2013–2021 гг.)


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2021.11.3.53-62

Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Шлыкова А.В., Лопатухин А.Э., Лаповок И.А., Салеева Д.В., Кравченко А.В., Покровский В.В.

Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия
Цель исследования. Оценка распространенности и структуры лекарственной устойчивости (ЛУ) ВИЧ-1 среди пациентов с вирусологической неэффективностью АРТ в России в период с 2013 по 2021 г.
Материалы и методы. Были использованы образцы плазмы крови от 831 ВИЧ-инфицированного пациента с вирусологической неэффективностью АРТ. Для всех пациентов были получены нуклеотидные последовательности фрагментов гена pol, кодирующих протеазу и часть обратной транскриптазы, для 273 из них дополнительно получены нуклеотидные последовательности фрагмента гена pol, кодирующего интегразу ВИЧ-1. Для субтипирования ВИЧ-1 использовали базу данных Стэнфордского университета HIVdb (v. 9.0) и REGA HIV-1 Subtyping Tool (v. 3.0), для уточнения результатов – HIV Blast международной базы данных института Лос-Аламос, для выявления мутаций резистентности и определения прогностической ЛУ ВИЧ-1 – HIVdb (v. 9.0).
Результаты. Выборка включала преимущественно генетические варианты вируса А6 (728; 87,6%),
CRF 02_AG (21; 2,5%), B (59; 7,1%) и CRF63_02A1 (15; 1,8%). У 82,4% пациентов с неуспехом терапии была обнаружена прогностическая ЛУ хотя бы к одному препарату: чаще – к НИОТ (74,2%) и ННИОТ (67,3%), реже – к ИИ (12,1%) и ИП (9,6%). В большинстве случаев была установлена резистентность одновременно к НИОТ + ННИОТ (45,8–57%). Мультирезистентность к ИП + НИОТ + ННИОТ + ИИ была обнаружена только в 1,1% случаев.
Заключение. Необходимо централизованное проведение теста на ЛУ ВИЧ-1 пациентам с вирусологической неэффективностью АРТ для подбора эффективных схем терапии, а также минимизации возникновения и дальнейшего распространения резистентных вариантов ВИЧ-1 на территории России.

Литература


1. Справка по ВИЧ-инфекции в Российской Федерации на 31.12.2020. М., 2018. http://www.hivrussia.info/wp-content/uploads/2021/03/VICH-infektsiya-v-Rossijskoj-Federatsii-na-31.12.2020-pdf

[Certificate of HIV infection in the Russian Federation as of 31.12.2020]. Moscow, 2018. (In Russ.). http://www.hivrussia.info/wp-content/uploads/2021/03/VICH-infektsiya-v-Rossijskoj-Federatsii-na-31.12.2020-pdf


2. Cohen M.S., Chen Y.Q., McCauley M., Gamble T., Hosseinipour M.C., Kumarasamy N. et al.; HPTN 052 Study Team. Antiretroviral Therapy for the Prevention of HIV-1 Transmission. N. Engl. J. Med. 2016; 375(9): 830–839. doi: 10.1056/NEJMoa1600693


3. Cohen M.S., Chen Y.Q., McCauley M., Gamble T., Hosseinipour M.C., Kumarasamy N. et al.; HPTN 052 Study Team. Prevention of HIV-1 infection with early antiretroviral therapy. N. Engl. J. Med. 2011; 365(6): 493–505. doi: 10.1056/NEJMoa1105243


4. Rodger A.J., Cambiano V., Bruun T., Vernazza P., Collins S., van Lunzen J. et al.; PARTNER Study Group. Sexual Activity Without Condoms and Risk of HIV Transmission in Serodifferent Couples When the HIV-Positive Partner Is Using Suppressive Antiretroviral Therapy. JAMA 2016; 316(2): 171–181. doi: 10.1001/jama.2016.5148.


5. Rodger A.J., Cambiano V., Bruun T., Vernazza P., Collins S., Degen O et al.; PARTNER Study Group. Risk of HIV transmission through condomless sex in serodifferent gay couples with the HIV-positive partner taking suppressive antiretroviral therapy (PARTNER): final results of a multicentre, prospective, observational study. Lancet 2019; 393(10189): 2428–2428. doi: 10.1016/S0140-6736(19)30418-0


6. Ладная Н.Н., Покровский В.В., Дементьева Л.А., Соколова Е.В. Эпидемическая ситуация по ВИЧ-инфекции в Российской Федерации в 2019 г. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2020; 10(3): 17–26. DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2020.10.3.17-26

Ladnaya N.N., Pokrovsky V.V., Dementyeva L.A., Sokolova E.V.


7. Pokrovskaya A.V., Popova A.A., Suvorova Z.K., Dementieva L.A., Pokrovsky V.V. Progress in HIV Cascade in Russia from 2011 to 2019. Journal of the International AIDS Society 2020: 23(S7): e25616


8. Clutter D.S., Jordan M.R., Bertagnolio S., Shafer R.W. HIV-1 drug resistance and resistance testing. Infect. Genet. Evol. 2016; 46: 292–307. doi: 10.1016/j.meegid.2016.08.031


9. Surveillance of HIV drug resistance in adults receiving ART (‎acquired HIV drug resistance)‎: concept note. WHO, 2014. 46 p. https://apps.who.int/iris/ handle/10665/112801


10. Guidelines on the public health response to pretreatment HIV drug resistance. Geneva: WHO, 2017. 84 p. https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/255880/9789241550055-eng.pdf


11. WHO HIVResNet HIV drug resistance laboratory operational framework. Geneva: WHO, 2020. 82 p. https://www.who.int/publications/i/item/978-92-4-000987-5


12. Yang W.L., Kouyos R., Scherrer A.U., Böni J., Shah C., Yerly S. et al. Swiss HIV Cohort Study. Assessing the Paradox Between Transmitted and Acquired HIV Type 1 Drug Resistance Mutations in the Swiss HIV Cohort Study From 1998 to 2012. J. Infect. Dis. 2015; 212(1): 28–38. doi: 10.1093/infdis/jiv012.


13. Rocheleau G., Brumme C.J., Shoveller J., Lima V.D., Harrigan P.R. Longitudinal trends of HIV drug resistance in a large Canadian cohort, 1996–2016. Clin. Microbiol. Infect. 2018; 24(2): 185–191. doi: 10.1016/j.cmi.2017.06.014


14. Егорова Н., Михайлов А., Лисенков Д., Бабихина К., Головин С. Результаты исследования рынка диагностических тест-систем для выявления и мониторинга лечения ВИЧ-инфекции в России в 2018–2019 г. СПб.: Коалиция по готовности к лечению, 2020; 76 с.

Egorova N., Mikhailov A., Lisenkov D., Babikhina K., Golovin S.


15. Кириченко А.А., Мурзакова А.В., Киреев Д.Е. Структура и уровень мутаций лекарственной устойчивости ВИЧ-1 у пациентов с вирусологической неудачей лечения. Материалы IX Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика 2017». М.: ООО «Юлис», 2017; 462–463.

Kirichenko A.A., Murzakova A.V., Kireev D.E.


16. Коломеец А.Н., Довгополюк Е.С., Сергеева И.В., Ястребов В.К., Тюменцев А.Т. Показатели лекарственной устойчивости вируса иммунодефицита человека к антиретровирусным препаратам у ВИЧ-инфицированных лиц в Сибирском федеральном округе в 2010–2012 гг. Вопросы вирусологии 2015; 60(1): 20–23.

Kolomeets A.N., Dovgopolyuk E.S., Sergeeva I.V., Yastrebov V.K., Tyumentsev A.T.


17. Плотникова Ю.К., Ревизор А.О., Пономарева О.А., Круглова Е.А. Генетическое разнообразие ВИЧ-1 на территории Иркутской области. Материалы IX Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика 2017». М.: ООО «Юлис», 2017; 479–480.

Plotnikova Yu.K., Inspector A.O., Ponomareva O.A., Kruglova E.A.


18. Останкова Ю.В., Щемелев А.Н., Зуева Е.Б., Чурина М.А., Валутите Д.Э., Семенов А.В. Молекулярная эпидемиология и фармакорезистентность ВИЧ у пациентов с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии в Архангельской области. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии 2019; 11(4): 79–90. https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90

Ostankova Yu.V., Schemelev A.N., Zueva E.V., Churina M.A., Valutite D.E., Semenov A.V.


19. Phillips A.N., Stover J., Cambiano V., Nakagawa F., Jordan M.R., Pillay D. et al. Impact of HIV Drug Resistance on HIV/AIDS-Associated Mortality, New Infections, and Antiretroviral Therapy Program Costs in Sub-Saharan Africa. J. Infect. Dis. 2017; 215(9): 1362–1365. doi: 10.1093/infdis/jix089.


20. Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Кравченко А.В., Покровская А.В., Куимова У.А., Сизова Н.В. и др. Оценка лекарственной устойчивости ВИЧ-1 к элсульфавирину и эффективность его применения среди российских пациентов, ранее не получавших антиретровирусные препараты. Журнал инфектологии 2020; 12(5): 29–39. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2020-12-5-29-39

Kirichenko A.A., Kireev D.E., Kravchenko A.V., Pokrovskaya A.V., Kuimova U.A., Sizova N.V. et al.


21. Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Казеннова Е.В., Лебедев А.В., Бобкова М.Р. и др. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. Тер. архив 2017; 89(11): 44–49. DOI: 10.17116/terarkh2017891144-49

Lapovok I.A., Lopatukhin A.E., Kireev D.E., Kazennova E.V., Lebedev A.V., Bobkova M.R. et al.


22. Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Лопатухин А.Э., Мурзакова А.В., Лаповок И.А., Ладная Н.Н., Покровский В.В. Уровень и структура лекарственной устойчивости ВИЧ-1 среди пациентов без опыта приема антиретровирусных препаратов с момента начала применения антиретровирусной терапии в Российской Федерации. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии 2019; 11(2): 75–83. DOI: http://dx.doi.org/10.22328/ 2077-9828-2019-11-2-75-83

Kirichenko A.A., Kireev D.E., Lopatukhin A.E., Murzakova A.V., Lapovok I.A., Ladnaya N.N., Pokrovsky V.V.


23. Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Васильев А.В., Бобкова М.Р. Естественные полиморфизмы гена pol варианта ВИЧ-1 IDU-A. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии 2012; 4(4): 44–51.

Kazennova E.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Vasilyev A.V., Bobkova  M.R.


24. Устойчивость, репликативные свойства и фитнес ВИЧ. В кн: Лекарственная устойчивость ВИЧ. М.: Человек, 2014. 288 с.

[Resistance, replication and fitness of HIV. In: Drug resistance of HIV.] Moscow: Chelovek, 2014. 288 р. (In Russ.).


25. Kolomeets A.N., Varghese V., Lemey P., Bobkova M.R., Shafer R.W. A uniquely prevalent nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor resistance mutation in Russian subtype A HIV-1 viruses. AIDS 2014; 28(17): F1–8. doi: 10.1097/QAD.0000000000000485


26. Chimukangara B., Lessells R.J., Rhee S.Y., Giandhari J., Kharsany A.B.M., Naidoo K. et al. Trends in Pretreatment HIV-1 Drug Resistance in Antiretroviral Therapy-naive Adults in South Africa, 2000–2016: A Pooled Sequence Analysis. EClinicalMedi­cine 2019; (9): 26–34. doi: 10.1016/j.eclinm.2019.03.006


27. Matías-Florentino M., Chaillon A., Ávila-Ríos S., Mehta S.R., Paz-Juárez H.E., Becerril-Rodríguez M.A. et al. Pretreatment HIV drug resistance spread within transmission clusters in Mexico City. J. Antimicrob. Chemother. 2020; 75(3): 656–667. DOI: 10.1093/jac/dkz502


28. Little S.J., Frost S.D.W., Wong J.K., Smith D.M., Pond S.L., Ignacio C.C. et al. Persistence of transmitted drug resistance among subjects with primary human immunodeficiency virus infection. J. Virol. 2008; 82(11): 5510–5518. DOI:10.1128/JVI.02579-07


29. Покровский В.В., Юрин О.Г., Кравченко А.В., Беляева В.В., Буравцова В.В., Деулина М.О. и др. Рекомендации по лечению ВИЧ-инфекции и связанных с ней заболеваний, химиопрофилактике заражения ВИЧ. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2019; (4, приложение). 88 с. https://epidemiology-journal.ru/ru/archive/edition/10017

Pokrovsky V.V., Yurin O.G., Kravchenko A.V., Belyaeva V.V., Buravtsova E.E., Deulina M.O. et al.


30. Castagna A., Maggiolo F., Penco G., Wright D., Mills A., Grossberg R. et al.; VIKING-3 Study Group. Dolutegravir in antiretroviral-experienced patients with raltegravir- and/or elvitegravir-resistant HIV-1: 24-week results of the phase III VIKING-3 study. J. Infect. Dis. 2014; 210(3): 354–362. DOI: 10.1093/infdis/jiu051


Об авторах / Для корреспонденции


Кириченко Алина Алексеевна – научный сотрудник, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; kotova-kirichenko@mail.ru; https://orcid.org/0000-0002-7116-0138
Киреев Дмитрий Евгеньевич – к.б.н., заведующий лабораторией диагностики и молекулярной эпидемиологии ВИЧ-инфекции, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; dmitkireev@yandex.ru; https://orcid.org/0000-0002-7896-2379
Шлыкова Анастасия Вениаминовна – научный сотрудник, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; murzakova_a.v@mail.ru; https://orcid.org/0000-0002-1390-8021
Лопатухин Алексей Эдуардович – научный сотрудник, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; a.lopatukhin@gmail.com; https://orcid.org/0000-0002-2826-699X
Лаповок Илья Андреевич – к.б.н., старший научный сотрудник,  Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; i_lapovok@mail.ru; https://orcid.org/0000-0002-6328-1415
Салеева Дарья Владиславовна – младший научный сотрудник, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; dasha_saleeva@inbox.ru; https://orcid.org/0000-0002-5870-5594
Кравченко Алексей Викторович – д.м.н., профессор, ведущий научный сотрудник, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; alexey-kravtchenko@ yandex.ru; http://orcid.org/0000-0001-7857-3763
Покровский Вадим Валентинович – академик РАН, д.м.н., профессор, руководитель отдела, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; pokrovsky.vad @yandex.ru; https://orcid.org/0000-0002-9514-7288; Scopus Author ID: 7202457043


Похожие статьи


Бионика Медиа