2. Cohen M.S., Chen Y.Q., McCauley M., Gamble T., Hosseinipour M.C., Kumarasamy N. et al.; HPTN 052 Study Team. Antiretroviral Therapy for the Prevention of HIV-1 Transmission. N. Engl. J. Med. 2016; 375(9): 830–839. doi: 10.1056/NEJMoa1600693

3. Cohen M.S., Chen Y.Q., McCauley M., Gamble T., Hosseinipour M.C., Kumarasamy N. et al.; HPTN 052 Study Team. Prevention of HIV-1 infection with early antiretroviral therapy. N. Engl. J. Med. 2011; 365(6): 493–505. doi: 10.1056/NEJMoa1105243

4. Rodger A.J., Cambiano V., Bruun T., Vernazza P., Collins S., van Lunzen J. et al.; PARTNER Study Group. Sexual Activity Without Condoms and Risk of HIV Transmission in Serodifferent Couples When the HIV-Positive Partner Is Using Suppressive Antiretroviral Therapy. JAMA 2016; 316(2): 171–181. doi: 10.1001/jama.2016.5148.

5. Rodger A.J., Cambiano V., Bruun T., Vernazza P., Collins S., Degen O et al.; PARTNER Study Group. Risk of HIV transmission through condomless sex in serodifferent gay couples with the HIV-positive partner taking suppressive antiretroviral therapy (PARTNER): final results of a multicentre, prospective, observational study. Lancet 2019; 393(10189): 2428–2428. doi: 10.1016/S0140-6736(19)30418-0

6. Ладная Н.Н., Покровский В.В., Дементьева Л.А., Соколова Е.В. Эпидемическая ситуация по ВИЧ-инфекции в Российской Федерации в 2019 г. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2020; 10(3): 17–26. DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2020.10.3.17-26

Ladnaya N.N., Pokrovsky V.V., Dementyeva L.A., Sokolova E.V. [The epidemic situation of HIV infection in the Russian Federation in 2019]. Epidemiology and infectious diseases. Current items 2020; 10(3): 17–26. (In Russ.). DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2020.10.3.17-26

7. Pokrovskaya A.V., Popova A.A., Suvorova Z.K., Dementieva L.A., Pokrovsky V.V. Progress in HIV Cascade in Russia from 2011 to 2019. Journal of the International AIDS Society 2020: 23(S7): e25616

8. Clutter D.S., Jordan M.R., Bertagnolio S., Shafer R.W. HIV-1 drug resistance and resistance testing. Infect. Genet. Evol. 2016; 46: 292–307. doi: 10.1016/j.meegid.2016.08.031

9. Surveillance of HIV drug resistance in adults receiving ART (‎acquired HIV drug resistance)‎: concept note. WHO, 2014. 46 p. https://apps.who.int/iris/ handle/10665/112801

10. Guidelines on the public health response to pretreatment HIV drug resistance. Geneva: WHO, 2017. 84 p. https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/255880/9789241550055-eng.pdf

11. WHO HIVResNet HIV drug resistance laboratory operational framework. Geneva: WHO, 2020. 82 p. https://www.who.int/publications/i/item/978-92-4-000987-5

12. Yang W.L., Kouyos R., Scherrer A.U., Böni J., Shah C., Yerly S. et al. Swiss HIV Cohort Study. Assessing the Paradox Between Transmitted and Acquired HIV Type 1 Drug Resistance Mutations in the Swiss HIV Cohort Study From 1998 to 2012. J. Infect. Dis. 2015; 212(1): 28–38. doi: 10.1093/infdis/jiv012.

13. Rocheleau G., Brumme C.J., Shoveller J., Lima V.D., Harrigan P.R. Longitudinal trends of HIV drug resistance in a large Canadian cohort, 1996–2016. Clin. Microbiol. Infect. 2018; 24(2): 185–191. doi: 10.1016/j.cmi.2017.06.014

14. Егорова Н., Михайлов А., Лисенков Д., Бабихина К., Головин С. Результаты исследования рынка диагностических тест-систем для выявления и мониторинга лечения ВИЧ-инфекции в России в 2018–2019 г. СПб.: Коалиция по готовности к лечению, 2020; 76 с.

Egorova N., Mikhailov A., Lisenkov D., Babikhina K., Golovin S. [Results of a study of the market of diagnostic test systems for detecting and monitoring HIV treatment in Russia in 2018–2019]. Saint Petersburg: Treatment Preparedness Coalition; 2020. 76 p. (In Russ.).

15. Кириченко А.А., Мурзакова А.В., Киреев Д.Е. Структура и уровень мутаций лекарственной устойчивости ВИЧ-1 у пациентов с вирусологической неудачей лечения. Материалы IX Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика 2017». М.: ООО «Юлис», 2017; 462–463.

Kirichenko A.A., Murzakova A.V., Kireev D.E. [The structure and level of HIV-1 drug resistance mutations in patients with virological treatment failure. Abstracts of the IX All-Russian Scientific and Practical Conference with International Participation «Molecular Diagnostics 2017»], Moscow: Yulis, 2017, 2017; 462–463. (In Russ.)

16. Коломеец А.Н., Довгополюк Е.С., Сергеева И.В., Ястребов В.К., Тюменцев А.Т. Показатели лекарственной устойчивости вируса иммунодефицита человека к антиретровирусным препаратам у ВИЧ-инфицированных лиц в Сибирском федеральном округе в 2010–2012 гг. Вопросы вирусологии 2015; 60(1): 20–23.

Kolomeets A.N., Dovgopolyuk E.S., Sergeeva I.V., Yastrebov V.K., Tyumentsev A.T. [Indicators of the human immunodeficiency virus drug resistance to antiretroviral drugs in HIV-infected individuals in the Siberian federal district in 2010–2012]. Problems of Virology 2015; 60(1): 20–23. (In Russ.)

17. Плотникова Ю.К., Ревизор А.О., Пономарева О.А., Круглова Е.А. Генетическое разнообразие ВИЧ-1 на территории Иркутской области. Материалы IX Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика 2017». М.: ООО «Юлис», 2017; 479–480.

Plotnikova Yu.K., Inspector A.O., Ponomareva O.A., Kruglova E.A. [Genetic diversity of HIV-1 in the Irkutsk region. Abstracts of the IX All-Russian Scientific and Practical Conference with International Participation «Molecular Diagnostics 2017»], Moscow: Yulis, 2017, 2017; 479–480. (In Russ.)

18. Останкова Ю.В., Щемелев А.Н., Зуева Е.Б., Чурина М.А., Валутите Д.Э., Семенов А.В. Молекулярная эпидемиология и фармакорезистентность ВИЧ у пациентов с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии в Архангельской области. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии 2019; 11(4): 79–90. https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90

Ostankova Yu.V., Schemelev A.N., Zueva E.V., Churina M.A., Valutite D.E., Semenov A.V. [HIV molecular epidemiology and pharmaco-resistance in patients with antiretroviral therapy failure in Arkhangelsk district]. HIV infection and Immunosuppression 2019; 11(4): 79–90. (In Russ.). https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90

19. Phillips A.N., Stover J., Cambiano V., Nakagawa F., Jordan M.R., Pillay D. et al. Impact of HIV Drug Resistance on HIV/AIDS-Associated Mortality, New Infections, and Antiretroviral Therapy Program Costs in Sub-Saharan Africa. J. Infect. Dis. 2017; 215(9): 1362–1365. doi: 10.1093/infdis/jix089.

20. Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Кравченко А.В., Покровская А.В., Куимова У.А., Сизова Н.В. и др. Оценка лекарственной устойчивости ВИЧ-1 к элсульфавирину и эффективность его применения среди российских пациентов, ранее не получавших антиретровирусные препараты. Журнал инфектологии 2020; 12(5): 29–39. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2020-12-5-29-39

Kirichenko A.A., Kireev D.E., Kravchenko A.V., Pokrovskaya A.V., Kuimova U.A., Sizova N.V. et al. [Evaluation of the HIV-1 drug resistance to elsulfavirine and the effectiveness of it among Russian treatment-naïve patients]. Journal Infectology 2020; 12(5): 29–39. (In Russ.). https://doi.org/10.22625/2072-6732-2020-12-5-29-39

21. Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Казеннова Е.В., Лебедев А.В., Бобкова М.Р. и др. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. Тер. архив 2017; 89(11): 44–49. DOI: 10.17116/terarkh2017891144-49

Lapovok I.A., Lopatukhin A.E., Kireev D.E., Kazennova E.V., Lebedev A.V., Bobkova M.R. et al. [Molecular epidemiological analysis of HIV-1 variants circulating in Russia in 1987–2015]. Therapeutic archive 2017; 89(11): 44–49. (In Russ.). DOI: 10.17116/terarkh2017891144-49

22. Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Лопатухин А.Э., Мурзакова А.В., Лаповок И.А., Ладная Н.Н., Покровский В.В. Уровень и структура лекарственной устойчивости ВИЧ-1 среди пациентов без опыта приема антиретровирусных препаратов с момента начала применения антиретровирусной терапии в Российской Федерации. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии 2019; 11(2): 75–83. DOI: http://dx.doi.org/10.22328/ 2077-9828-2019-11-2-75-83

Kirichenko A.A., Kireev D.E., Lopatukhin A.E., Murzakova A.V., Lapovok I.A., Ladnaya N.N., Pokrovsky V.V. [Prevalence and structure of HIV-1 drug resistance among treatment naïve patients since the introduction of antiretroviral therapy in the Russian Federation]. HIV infection and Immunosuppression 2019; 11(2): 75–83. (In Russ.). DOI: https://doi.org/ 10.22328/2077-9828-2019-11-2-75-83

23. Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Васильев А.В., Бобкова М.Р. Естественные полиморфизмы гена pol варианта ВИЧ-1 IDU-A. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии 2012; 4(4): 44–51.

Kazennova E.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Vasilyev A.V., Bobkova  M.R. [Natural polymorphisms of HIV-1 IDU-A variant pol gene]. HIV infection and Immunosuppression 2012; 4(4): 44–51. (In Russ.).

24. Устойчивость, репликативные свойства и фитнес ВИЧ. В кн: Лекарственная устойчивость ВИЧ. М.: Человек, 2014. 288 с.

[Resistance, replication and fitness of HIV. In: Drug resistance of HIV.] Moscow: Chelovek, 2014. 288 р. (In Russ.).

25. Kolomeets A.N., Varghese V., Lemey P., Bobkova M.R., Shafer R.W. A uniquely prevalent nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor resistance mutation in Russian subtype A HIV-1 viruses. AIDS 2014; 28(17): F1–8. doi: 10.1097/QAD.0000000000000485

26. Chimukangara B., Lessells R.J., Rhee S.Y., Giandhari J., Kharsany A.B.M., Naidoo K. et al. Trends in Pretreatment HIV-1 Drug Resistance in Antiretroviral Therapy-naive Adults in South Africa, 2000–2016: A Pooled Sequence Analysis. EClinicalMedi­cine 2019; (9): 26–34. doi: 10.1016/j.eclinm.2019.03.006

27. Matías-Florentino M., Chaillon A., Ávila-Ríos S., Mehta S.R., Paz-Juárez H.E., Becerril-Rodríguez M.A. et al. Pretreatment HIV drug resistance spread within transmission clusters in Mexico City. J. Antimicrob. Chemother. 2020; 75(3): 656–667. DOI: 10.1093/jac/dkz502

28. Little S.J., Frost S.D.W., Wong J.K., Smith D.M., Pond S.L., Ignacio C.C. et al. Persistence of transmitted drug resistance among subjects with primary human immunodeficiency virus infection. J. Virol. 2008; 82(11): 5510–5518. DOI:10.1128/JVI.02579-07

29. Покровский В.В., Юрин О.Г., Кравченко А.В., Беляева В.В., Буравцова В.В., Деулина М.О. и др. Рекомендации по лечению ВИЧ-инфекции и связанных с ней заболеваний, химиопрофилактике заражения ВИЧ. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2019; (4, приложение). 88 с. https://epidemiology-journal.ru/ru/archive/edition/10017

Pokrovsky V.V., Yurin O.G., Kravchenko A.V., Belyaeva V.V., Buravtsova E.E., Deulina M.O. et al. [Recommendations for the treatment of HIV infection and related diseases, chemoprophylaxis of HIV infection]. Epidemiology and infectious diseases. Current items 2019; (4, Suppl.). 88 р. (In Russ.). https://epidemiology-journal.ru/ru/archive/edition/10017

30. Castagna A., Maggiolo F., Penco G., Wright D., Mills A., Grossberg R. et al.; VIKING-3 Study Group. Dolutegravir in antiretroviral-experienced patients with raltegravir- and/or elvitegravir-resistant HIV-1: 24-week results of the phase III VIKING-3 study. J. Infect. Dis. 2014; 210(3): 354–362. DOI: 10.1093/infdis/jiu051