English
Роль современных методов типирования в изучении генетического разнообразия и чувствительности к антибиотикам штаммов сальмонелл, выделенных из разных источников
Рожнова С.Ш., Гусева А.Н., Христюхина О.А., Виткова О.Н., Крутова Н.Е.
1ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора», Москва, Россия; 2ФГБУ «Центр ветеринарии», Москва, Россия
Матералы и методы. Представлены данные Референс-центра по мониторингу за сальмонеллезами о биологических характеристиках 4240 штаммов сальмонелл, выделенных на различных территориях страны в 2011–2016 гг. от людей и животных, из пищевых продуктов и объектов окружающей среды. Серотипирование осуществляли с применением моноклональных реагентов Enteroclons («SIFIN», Германия). Фаготипирование S. Enteritidis проводили, используя коллекцию типовых фагов, разработанную Национальным институтом гигиены (Венгрия). Чувствительность к антибиотикам определяли на пластинах ATBTM G-5 («bioMerieux», Франция), структуру штаммов – путем анализа набора продуктов рестрикции тотальной ДНК в пульсирующем электрическом поле (Pulsed Field Gel Electrophoresis – PFGE).
Результаты. Ведущими в этиологической структуре сальмонеллёзов являлись S. Enteritidis (от 39,5 до 71,3%), затем следовали S. Infantis (от 4,8 до 9,0%) и S. Typhimurium (от 2,0 до 6,7%). Показано, что 85% S. Enteritidis, выделенных из разных источников, относились к фаготипу 1. 37,44% штаммов данного серовара были чувствительны ко всем испытанным антибиотикам. Среди S. Typhimurium чувствительность ко всем антибиотикам выявлена у 19%, среди S. Infantis – у 32%. Штаммы, устойчивые к действию нескольких антибиотиков, преобладали среди S. Infantis. Молекулярно-генетическое типирование показало, что на разных территориях страны циркулируют сальмонеллы, относящиеся к одним и тем же PFGE pattern, ведущими из которых были JEGX 01.0001–JEGA 26.0001 (S. Enteritidis), JPXX 01.0013–JPXA 26.0009 (S. Typhimurium) и JFXX 01.0015–JFXA 26.0011 (S. Infantis).
Заключение. Предпринята попытка использовать PFGE-анализ для идентификации трудно диагностируемых сальмонелл.
Литература
1. Directive 2003/99/EC of the Europian parlament and of the Conneil of 17 Nov 2003. Official Journal of the Europian Union. 12.12.2003. L 325/31. 2. Seallan E., Hoekstra R.M., Angulo F.J., Tauxe R.V., Widdowson M.A., Roy S.L., Jones J.L., Griffin P.M. Foodborne illness aquired in the United States major pathogens. Emerg. Infect. Dis. 2011; 17: 7–15. 3. Jackson B.R., Griffin P.M., Cole D., Walsh K.A., Chai S.J.. Outbreak – associated Salmonella Еnterica Serotypes and Food Commodities United States, 1990–2008. Emer. Infect. Dis. 2013; 19(8): 1239–44. 4. Herikstad M., Motarjemi V., Tauxe R.V. Salmonella Surveilance: a global survey of public health serotyping. Epid. Infect. 2002; 129(1): 1–8. 5. Информационный бюллетень Референс-центра по мониторингу за сальмонеллезами 2016; (28): 1–70. 6. Куликовский А. Сальмонеллез: мониторинг необходим. Животноводство России 2015; (6): 17–8. 7. Deng X., Ran L., Wu S., Ke B., He D., Yang X., Zhang Y., Ke C., Klena J.D., Yan M., Feng Z., Kan B., Liu X., Mikoleit M., Varma J.K. Laboratory-based surveillance of non-typhoidal Salmonella infections in Guangdong Guangdong Province, China – 2009. In: International Conference on Emerging Infections Diseases. 11–14 July 2010, Atlanta, USA. Atlanta, 2010: 141. 8. The European Union Summery report on antimicrobial resistance in zoonotic and indicator bacteria from humans, animals and food in 2014. EFSA Journal 2016; 14: 4380. DOI: 10.2903/j.efsa.2016.4380. (https://www.efsa.europa. eu/en/efsajournal/pub/4380 9. Fakhr M.K., Nolan L.K., Loque C.V. Multilocus Sequence Typing Lacks the Discriminatory Ability of Pulsed-Field Gel Electrophoresis for Typing Salmonella enterica serovar Typhimurium. J. Clin. Microbiol. 2005; 43: 2215–19. 10. Харитонова Н.Б., Кулешов К.В., Рожнова С.Ш., Христюхина О.А., Подколзин А.Т. Изучение генетической гетерогенности изолятов Salmonella spp., Shigella spp., выделенных в очагах групповой и спорадической заболеваемости в Российской Федерации. Сборник трудов VIII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика – 2014». М.: Издательство МБА, 2014; (1): 372–3. http://www.epid-oki.ru/images/ documents/MD_2014_Kuleshov1.pdf 11. Kuleshov K.V., Fadina O.A., Rozhnova S. Sh., Podkolzin A.T., Shipulin G.A. Investigation of clonal structure of Salmonella Enteritidis isolated from outbreaks by Pulsed-Field Gel Electrophoresis in the Russian Federation during 2010–2011. In: International Conference on Emerging Infections Diseases. 11–14 March, Atlanta, USA. Atlanta, 2012: 175.
Об авторах / Для корреспонденции
Для корреспонденции:
Рожнова Софья Шаевна – д.б.н., ведущий научный сотрудник ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора»; руководитель Референс-центра по мониторингу за сальмонеллезами
Адрес: 111123, Москва, Новогиреевская ул., д. 3а
E-mail: SALM@pcr.ru
Сведения об авторах:
Гусева Анна Николаевна – младший научный сотрудник лаборатории молекулярной диагностики и эпидемиологии кишечных инфекций ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора»; e-mail: anna302bis@mail.ru
Христюхина Ольга Анатольевна – научный сотрудник лаборатории молекулярной диагностики и эпидемиологии кишечных инфекций ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора»; e-mail: SALM@pcr.ru
Виткова Ольга Николаевна – к.в.н., начальник отдела экспертизы нормативно-технической документации ФГБУ «Центр ветеринарии»; е-mail: olgavitkova@mail.ru
Крутова Наталья Евгеньевна – младший научный сотрудник лаборатории молекулярной диагностики и эпидемиологии кишечных инфекций ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора»; e-mail: SALM@pcr.ru
Похожие статьи
