Significance of quantitative determination of human cytomegalovirus DNA in cerebrospinal fluid and blood for the diagnosis of cytomegalovirus encephalitis in patients with HIV infection


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2023.13.3.75-80

Shakhgildyan V.I., Domonova E.A., Yadrikhinskaya M.S., Orlovsky A.A., Tishkevich O.A., Yarovaya E.B.

1) Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being, Moscow, Russia; 2) Moscow City Center for the Prevention and Control of AIDS, Moscow, Russia; 3) M.V. Lomonosov Moscow State University, Moscow, Russia; 4) Infectious Clinical Hospital № 2 of the Moscow Healthcare Department, Moscow, Russia
Objective. Determination of diagnostic sensitivity and specificity of human cytomegalovirus (CMV) DNA concentrations in cerebrospinal fluid (CSF), blood leukocytes and blood plasma for verification of CMV-etiology encephalitis in patients with HIV infection.
Materials and methods. 5485 patients with HIV infection hospitalized in Infectious Clinical Hospital № 2 of the Moscow Healthcare Department were followed-up. CNS lesions were diagnosed in 1310 patients. 1667 CSF samples were studied by PCR-RT (RT-PCR-RT) with quantitative determination of CMV DNA, HIV RNA, DNA of pathogens of other neuroinfections; 743 blood serum samples and 3623 plasma samples with quantitative determination of CMV DNA. Reagent kits produced by the Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being (Russia) were used. Statistical analysis was performed using Statistica v. 10.0 and SPSSv. 20 statistical software packages, programming language R. The study of relationships was carried out by the analysis of contingency tables using Pearson’s χ2 test. The search for associations between the number of CMV DNA copies in the patient’s biomaterial and the presence of CMV encephalitis was performed using ROC analysis.
Results. Manifest CMVI occurred in 448 (13.4%) patients at the stage of AIDS (3333). CMV encephalitis was diagnosed in 28 patients: 6.3% among patients with CMVI, 0.8% among patients at the stage of AIDS, 4.8% in 584 patients with an established etiology of CNS lesions. The frequency of detection and quantitative indicators of CMV DNA in blood leukocytes, blood plasma and CSF were presented. The absence of CMV DNA or the detection of low virus DNA concentrations in these biomaterials ruled out the CMV nature of the CNS lesion. The presence of CMV DNA in the blood and CSF did not confirm the presence of CMV encephalitis. The concentration of CMV DNA in the CSF, equal to or more than 16,600 copies/ml, blood leukocytes – 4.65 lg copies/105 cells, blood plasma – 62,700 copies/ml, confirmed the CMV etiology of encephalitis with a 95% probability and served as the basis for starting etiotropic therapy.
Conclusion. Quantitative determination of CMV DNA in the CSF and blood samples by PCR does not have an important diagnostic value for the verification of encephalitis of cytomegalovirus etiology in patients with HIV infection.

Установление природы поражения ЦНС у больных ВИЧ-инфекцией по-прежнему является сложной задачей. В реальной клинической практике у значительного количества пациентов диагноз формулируется как «энцефалит неясной этиологии» [1]. Манифестная цитомегаловирусная инфекция (ЦМВИ), нередко протекающая с поражением головного и спинного мозга – одно из наиболее частых и тяжелых вторичных заболеваний у больных ВИЧ-инфекций [2]. У ВИЧ-инфицированных лиц с глубокой иммуносупрессией ЦМВ-энцефалит – ведущая причина выраженных нейрокогнитивных расстройств, достигающих степени деменции [3].

Клиническая расшифровка этиологии неврологической патологии вызывает большие трудности. Дифференциальная диагностика между ВИЧ-энцефалитом, прогрессирующей мультифокальной лейкоэнцефалопатией и ЦМВ-энцефалитом – состояниями, протекающими с интеллектуально-мнестическим синдромом, без проведения исследований спинномозговой жидкости (СМЖ) и крови на наличие ДНК возбудителей нейроинфекций и РНК ВИЧ, крайне затруднителен [4]. Вместе с тем, клиническое значение качественного и количественного содержания ДНК ЦМВ в СМЖ, лейкоцитах крови и плазме крови для подтверждения ЦМВ-природы энцефалита у больных ВИЧ-инфекцией остается не установленным.

Цель исследования – определение диагностических чувствительности и специфичности концентраций ДНК ЦМВ в СМЖ, лейкоцитах крови и плазме крови для верификации энцефалита ЦМВ-этиологии у больных ВИЧ-инфекцией.

Материалы и методы

Проведено клиническое наблюдение и анализ историй болезни 5485 больных ВИЧ-инфекцией (3333 – на стадиях 4Б (СПИД), 4В (СПИД)), находившихся на лечении в Инфекционной клинической больнице № 2 (ИКБ № 2) Департамента здравоохранения города Москвы, за четырехлетний период. Медиана (Ме) возраста пациентов составила 33 года (19–72 года). Мужчин было 3998 (72,9%), женщин – 1487 (27,1%). АРТ получали лишь 17% пациентов. Умерли 593 (10,8%) чел. Поражение ЦНС было диагностировано у 1310 госпитализированных больных ВИЧ-инфекцией, из них умерли 372. Секционные исследования осуществляли в патологоанатомическом отделении ИКБ № 2.

Проводили МР-томографию головного мозга c контрастированием, диагностическую люмбальную пункцию с микроскопическим и биохимическим анализами СМЖ. С целью этиологической расшифровки поражений ЦНС исследовано 1667 образцов СМЖ методом ПЦР-РВ (ОТ-ПЦР-РВ) с качественным или количественным определением РНК ВИЧ, ДНК ЦМВ, ВЭБ, ВГЧ-6 А/В, ВПГ-1,-2, ВВЗ, B.secuhominis, грибов рода Candida, T. gondii, C. neoformans, а также 743 образца сыворотки крови и 3623 образца плазмы крови с количественным определением ДНК ЦМВ. Молекулярно-биологические исследования проводили с использованием наборов реагентов производства ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора.

Критериями постановки диагноза ЦМВ-энцефалита (энцефаловентрикулита), помимо данных молекулярно-биологических методов, служили: патоморфологическое подтверждение ЦМВ-поражения головного мозга и/или комплекс относительно характерной клинической картины болезни (быстро прогрессирующие нейрокогнитивные нарушения вплоть до развития деменции у большинства больных, скудные и поздно проявляющиеся неврологические симптомы в форме горизонтального нистагма, в ряде случаев – пареза глазодвигательного нерва и невропатии лицевого нерва, головокружения, непостоянных головных болей без повышенной судорожной активности в сочетании с лихорадкой ремиттирующего типа, быстрым существенным снижением веса, выраженной слабостью, анорексией, наличием у части больных ретинита), данные МРТ головного мозга (расширение желудочков головного мозга, утолщение их стенок, наличие мелких очагов в перивентрикулярных областях), данные анализа СМЖ (существенное повышение содержания белка при отсутствии плеоцитоза или мононуклеарном плеоцитозе, нормальное содержание глюкозы), отсутствие или незначительное количество ДНК других возбудителей нейроинфекций и РНК ВИЧ в образцах СМЖ, неэффективность лечения бисептолом возможного церебрального токсоплазмоза.

Для статистической обработки результатов использовали пакеты статистических программ Statistica v. 10.0 и SPSS v. 20, а также язык программирования R. Проверку исследуемых признаков на нормальность проводили с помощью критерия Колмогорова–Смирнова в связи с большим объемом выборки. При отсутствии нормальной распределенности признака вычисляли Ме, интерквартильный размах (25–75 процентили), а также приводили минимальное и максимальное значения. Для проверки гипотезы об однородности распределений признака в двух независимых группах использовали непараметрический критерий Манна–Уитни. Распределение пациентов на группы в зависимости от количества копий ДНК ЦМВ в плазме крови и СМЖ проводили в соответствии с установленными пороговыми значениями: 0, 1000, 10 000, 100 000 копий. Таким образом, непрерывные переменные, соответствующие исходным показателям, были преобразованы в дискретные, где каждому значению новой переменной соответствовал определенный интервал значений исходной непрерывной переменной. После этого проведено исследование взаимосвязей между признаками с помощью анализа таблиц сопряженности с применением критерия χ2 Пирсона. У значительной части больных ДНК ЦМВ в пробах не была обнаружена, в этом случае признаку присваивали значение «0». Интерес представляли не только наличие статистически значимых связей между сгруппированными показателями, но и особенности распределения пациентов по ячейкам таблиц сопряженности. Количество измерений каждого лабораторного маркера было различным в связи с ретроспективным характером исследования и тем, что назначения исследований определялись клинической ситуацией и состоянием больного. Поэтому при описании результатов применения статистических критериев дополнительно указывали объем выборки, на которой результат был получен. Поиск ассоциаций концентрации ДНК ЦМВ в биоматериалах и наличия ЦМВ-энцефалита проводили с применением ROC-анализа. Для каждого из биоматериалов были найдены отрезные точки концентраций ДНК ЦМВ, для которых значения чувствительности и специфичности совпадали. Проанализировано изменение чувствительности и специфичности в зависимости от концентрации ДНК ЦМВ в биоматериале, что позволило выявить ряд дополнительных клинически значимых отрезных точек. Уровень значимости для проверяемых статистических гипотез принимали равным 0,05.

Результаты

Поражение ЦНС было диагностировано у 23,8% госпитализированных больных ВИЧ-инфекцией, 39,3% из числа пациентов на стадиях вторичных заболеваний, 4Б (СПИД) 4В (СПИД). Умерли 28,4% из числа больных с поражением ЦНС. 62,7% умерших больных имели поражение головного мозга той или иной природы. Спектр и частота заболеваний, протекающих с поражением ЦНС, у стационарных пациентов с ВИЧ-инфекцией, а также частота выявления ДНК возбудителей нейроинфекций и РНК ВИЧ в СМЖ описаны нами ранее [5].

Манифестная ЦМВИ имела место у 448 (13,4%) больных на стадии СПИДа. ЦМВ-энцефалит диагностирован у 28 больных ВИЧ-инфекцией: 0,5% среди госпитализированных лиц на разных стадиях ВИЧ-инфекции, 0,8% среди больных ВИЧ-инфекцией на стадии СПИДа. ЦМВ-энцефалит был причиной тяжелой неврологической патологии у 2,1% из 1310 больных с поражением ЦНС, 4,8% из 584 пациентов с установленной этиологией поражения ЦНС, 6,3% среди лиц с клинически выраженной ЦМВИ.

Из 743 исследуемых образцов крови ДНК ЦМВ в лейкоцитах крови была обнаружена в 393 (52,8%) случаях. ЦМВ-энцефалит имел место лишь у 5 (1,3%) пациентов с наличием ДНК ЦМВ в лейкоцитах крови и ни у одного из 738 больных при отсутствии вируса (табл. 1).

77-1.jpg (64 KB)

Содержание ДНК ЦМВ в лейкоцитах крови составило от 0,5 до 5,6 lg копий/105 клеток (Ме – 1,8, интерквартильный размах [1,2–2,5] lg копий/105 клеток). Из 743 пациентов ДНК вируса в лейкоцитах крови отсутствовала у 350 (47,2%), была выявлена в концентрации < 1,0 lg копий/105 клеток у 19 (2,6%), 1,0–2,0 lg копий/105 клеток – у 212 (28,5%), 2,1–2,9 lg копий/105 клеток – у 94 (12,6%), ≥ 3,0 lg копий/105 клеток – у 68 (9,2%). Наличие ЦМВ-энцефалита у больного характеризовалось более высокой концентрацией ДНК ЦМВ в лейкоцитах крови (критерий Манна–Уитни; p < 0,0001).

Для определения диагностического значения количественного содержания ДНК ЦМВ в лейкоцитах крови при ЦМВ-поражении головного мозга был использован ROC-анализ, в ходе которого выделяли отрезные точки количества копий ДНК вируса и определяли их чувствительность и специфичность (табл. 2). Для отрезного значения количества ДНК ЦМВ в лейкоцитах крови, равного 4,95 lg копий/105 клеток, специфичность составила 99,2% при чувствительности 20%, для значения 4,65 lg копий/105 клеток – 98,5 и 40% соответственно. Для низкой отрезной точки количества ДНК ЦМВ, равной 1,85 lg копий/105 клеток, чувствительность составила 100% при специфичности 55,7%.

78-1.jpg (140 KB)

Из 3623 образцов плазмы крови ДНК ЦМВ обнаружена в 623 (17,2%) случаях. ЦМВ-энцефалит диагностирован у 28 (2,9%) из 623 пациентов с наличием ДНК ЦМВ в плазме крови и у 3 (0,2%) больных при отсутствии вируса в плазме крови (1522 образцов) (см. табл. 1).

Концентрация ДНК ЦМВ в плазме находилась в пределах от 100 до 10 000 000 копий/мл (Ме – 910, интерквартильный размах [165–4350] копий/мл). Из 3623 пациентов ДНК вируса в плазме крови отсутствовала у 3000 (82,8%), была выявлена в концентрации < 1000 копий/мл у 322 (8,9%), 1000–10 000 копий/мл – у 202 (5,6%), 10 000–100 000 копий/мл – у 82 (2,2%), > 100 000 копий/мл – у 27 (0,5%) случаев. Наличие ЦМВ-энцефалита у больного характеризовалось более высокой концентрацией ДНК ЦМВ в плазме крови (критерий Манна–Уитни; p < 0,0001).

Применение ROC-анализа концентраций ДНК ЦМВ в плазме крови для установления диагностических чувствительности и специфичности при ЦМВ-энцефалите позволило выделить: отрезное значение концентрации ДНК ЦМВ, равное 352 170 копий/мл, специфичность которого составила 99%, чувствительность 5,6%; отрезное значение концентрации ДНК ЦМВ, равное 62 700 копий/мл, со специфичностью 95,9% и чувствительностью 16,7%. Для отрезной точки концентрации ДНК ЦМВ в плазме, равной 520 копий/ мл, чувствительность составила 100% при специфичности 42,6%, а для отрезной точки, равной 1250 копий/мл, – 94,4 и 56,5% соответственно.

При исследовании 1667 образцов СМЖ больных с патологией ЦНС ДНК ЦМВ была выявлена в 145 (8,7%) случаях. ЦМВ-энцефалит имел место у 25 (17,2%) из 145 пациентов с наличием ДНК ЦМВ в СМЖ и лишь у 3 (0,2%) их 1522 больных при отсутствии вируса. Диагностическая чувствительность выявления ДНК ЦМВ в СМЖ у больных ВИЧ-инфекцией с поражением ЦНС составила 99,8%. Соответственно отсутствие ДНК ЦМВ в СМЖ почти со 100% вероятностью исключает наличие ЦМВ-энцефалита у таких больных. Диагностическая специфичность обнаружения в СМЖ ДНК ЦМВ составила лишь 17,2%. Соответственно, факт присутствия ДНК ЦМВ в СМЖ не подтверждает ЦМВ-природу поражения ЦНС.

Низкая диагностическая специфичность качественного определения ДНК ЦМВ в СМЖ свидетельствует о необходимости количественного определения ДНК вируса для верификации диагноза ЦМВ-энцефалита и обоснования назначения специфической противовирусной терапии. Содержание ДНК ЦМВ в СМЖ составило от 47 до 4 373 385 копий/мл (в 8,7% случаев (Ме – 400, интерквартильный размах [200–1440] копий/мл).

Из 1667 пациентов ДНК вируса в СМЖ отсутствовала у 1522 (91,3%) больных, была выявлена в концентрации < 1000 копий/мл у 100 (6%), 1001–10 000 копий/ мл – у 27 (1,6%), 10 001–100 000 копий/мл – у 13 (0,8%), > 100 000 копий/мл – у 5 (0,3%). Наличие ЦМВ-энцефалита у больного характеризовалось более высокой концентрацией ДНК ЦМВ в плазме крови (критерий Манна–Уитни; p < 0,0001) (табл. 3).

79-1.jpg (58 KB)

Для определения диагностического значения количественного содержания ДНК ЦМВ в СМЖ при ЦМВ-поражении головного мозга был использован ROC-анализ, в ходе которого выделяли отрезные точки количества копий ДНК вируса в СМЖ и определяли их чувствительность и специфичность. Для отрезного значения количества ДНК ЦМВ в образцах СМЖ, равного 28 500 копий/мл, специфичность составила 100% при чувствительности 50%; для количества ДНК ЦМВ, равного 16 600 копий/мл, 98,8 и 75% соответственно. Для низкой отрезной точки, равной 70 копий/ мл, чувствительность составила 100% при специфичности 1,2%, для значения количества ДНК ЦМВ 150 копий/ мл – 93,8 и 9,6%, соответственно.

Обсуждение

У больных ВИЧ-инфекцией манифестная ЦМВИ – одно из наиболее частых вторичных заболеваний (13,4% случаев среди госпитализированных больных на стадии СПИДа), в 6,3% случаев протекающее с поражением головного мозга в виде энцефалита или энцефаловентрикулита, диагностика которого крайне затруднена, о чем свидетельствует ряд последних публикаций [1, 4].

Учитывая высокую чувствительность используемого в исследовании молекулярно-биологического метода, отсутствие ДНК ЦМВ в лейкоцитах крови, плазме крови, СМЖ исключает ЦМВ-природу поражения головного мозга у больных ВИЧ-инфекцией, но в связи с низкой специфичностью качественного обнаружения ДНК ЦМВ в указанных биологических средах, факт присутствия ДНК вируса в лейкоцитах и плазме крови, а также в СМЖ не подтверждает наличия ЦМВ-энцефалита. Тем не менее, в практическом здравоохранении используют именно качественный анализ при определении ДНК ЦМВ в СМЖ и других биологических материалах, что не позволяет своевременно и точно диагностировать ЦМВ-поражение ЦНС, а публикации о диагностическом значении различных концентраций ДНК ЦМВ в СМЖ отсутствуют.

Концентрация ДНК ЦМВ в лейкоцитах и плазме крови, СМЖ имеет широкие пределы от десятков до нескольких миллионов копий в образце. В результате применения ROC-анализа были получены отрезные точки по концентрации ДНК ЦМВ в лейкоцитах крови, плазме крови и СМЖ, позволяющие с высокой долей достоверности подтвердить или исключить наличие ЦМВ-энцефалита у больного ВИЧ-инфекцией. При проведении исследований для лейкоцитов крови и плазмы крови были найдены пороговые значения, обладающие 100% чувствительностью при относительно высокой специфичности, в то время как для СМЖ были найдены точки, обладающие 100% специфичностью при относительно высокой чувствительности. Таким образом, для проверки отсутствия ЦМВ-энцефалита лучше использовать исследование крови (лейкоциты или плазму), а для проверки наличия этого заболевания целесообразно проводить анализ на количественное содержание ДНК ЦМВ в СМЖ. При лабораторной верификации энцефалита ЦМВ-этиологии оптимальным является исследование методом ПЦР двух видов биологического материала: СМЖ и лейкоцитов или плазмы крови. При этом следует учитывать тот факт, что СМЖ является основным биологическим материалом для исследования, а лейкоциты и плазма крови – дополнительными.

Наличие энцефалита ЦМВ-этиологии характеризуется более высокой концентрацией ДНК ЦМВ в лейкоцитах крови, плазме крови и СМЖ. Диагностическим значением обладает определенная концентрация ДНК вируса в биологических средах пациента. Выявление ДНК ЦМВ в СМЖ в концентрации ≥ 16 600 копий/ мл, лейкоцитах крови – 4,65 lg копий/105 клеток, плазме крови – 62 700 копий/мл, с 95% вероятностью подтверждает ЦМВ-природу поражения головного мозга, служит основанием для постановки диагноза ЦМВ-энцефалита и проведения курса этиотропной терапии. Отсутствие ДНК ЦМВ или выявление ДНК вируса в лейкоцитах крови в концентрации < 1,85 lg копий/105 клеток, плазме крови – < 1250 копий/мл, СМЖ – < 150 копий/мл с 90% вероятностью исключает наличие ЦМВ-энцефалита и требует продолжения диагностического поиска для установления природы патологии ЦНС.

Заключение

Количественное определение ДНК ЦМВ при исследовании образцов СМЖ и крови методом ПЦР на имеет важного диагностического значения для верификации энцефалита ЦМВ-этиологии у больных ВИЧ-инфекцией.


Literature


1. Вознесенский С.Л., Шахгильдян В.И., Петрова Е.В., Кожевникова Г.М., Ермак Т.Н., Тишкевич О.А. и др. Энцефалиты неясной этиологии у больных ВИЧ-инфекцией: клиническая и патологоанатомическая расшифровка. Терапевтический архив 2021; 93(11): 1278–82. https://doi.org/10.2644/00403660.2021.11.201197


Voznesenskiy S.L., Shakhgildyan V.I., Petrova E.V., Kozhevnikova G.M., Ermak T.N., Tishkevich O.A. et al. (Unspecified Encephalitis in HIV-Infected Patients: Clinical and Post Mortem Evaluation). Therapeutic archive 2021; 93(11): 1278–82. (In Russ.). https://doi.org/10.2644/00403660.2021.11. 201197.


2. Покровский В.В., ред. ВИЧ-инфекция и СПИД: национальное руководство. Краткое издание. 2-е изд., перераб. и доп. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2021. 512 с.


Pokrovsky V.V., ed. (HIV infection and AIDS: national guidelines. Short edition). 2nd ed., reprint. and add. Moscow: GEOTAR-Media, 2021. 512 p. (In Russ.).


3. Goplen A.K., Liestol K., Dunlop O., Bruun J.N., Maehlen J. Dementia in AIDS patients in Oslo; the role of HIV encephalitis and CMV encephalitis Scand. J. Infect. Dis. 2001; 33(10): 755- 8. DOI: 10.1080/ 003655401317074572


4. Costa B.K., Sato D.K. Viral encephalitis: a practical review on diagnostic approach and treatment. J. Pediatr. 2020; 96(Suppl 1): 12–9. DOI: 10.1016/j.jped.2019.07.006


5. Шахгильдян В.И., Ядрихинская М.С., Домонова Э.А., Орловский А.А., Тишкевич О.А., Яровая Е.Б. Новые подходы к этиологической диагностике поражений центральной нервной системы у больных ВИЧ-инфекцией. Эпидемиол. и инф. болезни. Актуал. вопр. 2023; 13(1): 46–54. DOI: 10.18565/epidem.23.13.1.46-54


Shakhgildyan V.I., Yandrinskaya M.S., Domonova E.A., Orlovsky А.А., Tishkevich О.А., Yarovaya Е.В. (Novel approaches to etiological diagnosis of central nervous system lesions in patients with HIV). Epidemiоlоgy and infectious diseases. Сurrent items 2023; 13(1): 46–54. (In Russ.). DOI: 10.18565/epidem.23.13.1.46-54.


About the Autors


Vasily I. Shakhgildyan, Cand. Med. Sci., Senior Researcher, Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Surveillance of Consumer Rights Protection and Human Well-Being, Moscow, Russia; vishakh@yandex.ru; http://orcid.org/0000-0002-8686-0487
Elvira A. Domonova, Cand. Boil. Sci., Head, Research Group for the Development of New Methods for Diagnosing Opportunistic аnd Papillomavirus Infections, Department of Molecular Diagnostics and Epidemiology, Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Surveillance of Consumer Rights Protection and Human Well-Being, Moscow, Russia; еlvira.domonova@pcr.ms; http://orcid.org/0000-0001-8262-3938
Marina S. Yadrikhinskaya, Resident Physician, Moscow City Center for the Prevention and Control of AIDS, Moscow, Russia; rusalo4ka_88@mail.ru; http://orcid.org/0000-0002-9649-8522
Aleksey A. Orlovsky, Laboratory Researcher, Laboratory for Monitoring Programs to Reduce Mortality from Cardiovascular Diseases, National Medical Research Center for Cardiology, Moscow, Russia; leha-orl@yandex.by; http://orcid.org/0000-0002-0794-4683
Oleg A. Tishkevich, Pathologist, Infectious Clinical Hospital № 2 of the Moscow Healthcare Department, Moscow, Russia; tishol@mail.ru; https://orcid.org/0000-0002-0789-7709
Elena B. Yarovaya, Dr. Phys.-Math. Sci., Professor, Department of Probability Theory, Faculty of Mechanics and Mathematics, M.V. Lomonosov Moscow State University, Moscow, Russia; yarovaya@mech.math.msu.su; http://orcid.org/0000-0002-6615-43157129


Similar Articles


Бионика Медиа