Генетические маркеры прогрессирования ВИЧ-инфекции и развития вторичных заболеваний


Кулабухова Е.И., Кравченко А.В., Зимина В.Н, Покровская А.В.

1 Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва; 2 Российский университет дружбы народов, Москва
На риск инфицирования и скорость прогрессирования ВИЧ-инфекции влияет ряд факторов, в том числе разнообразие генома человека, обусловливающее особенности иммунного ответа на внедрение и развитие вируса в организме. Представлен обзор исследований генетических полиморфизмов, оказывающих влияние на возможность инфицирования и скорость прогрессирования ВИЧ-инфекции, а также их роль в развитии оппортунистических инфекций, в том числе туберкулеза (ТБ). В результате исследований роли генетических маркеров у пациентов с коинфекцией ВИЧ/ТБ было доказано влияние ряда генетических полиморфизмов на риск развития активного ТБ у пациентов с ВИЧ, независимо от других факторов риска. Однако полученные результаты на данный момент не могут быть использованы в клинической практике для совершенствования диагностики и профилактики ТБ у пациентов с ВИЧ-инфекцией, так как требуют уточнения и дополнительных исследований на больших выборках пациентов и среди представителей разных этнических групп.

Литература


1. Grabar S., Selinger-Leneman H., Abgrall S., Pialoux G., Weiss L., Costagliola D. Prevalence and comparative characteristics of long-term nonprogressors and HIV controller patients in the French Hospital Database on HIV. AIDS 2009; 23(9): 1163–1169.

2. Hendrickson S.L., Jacobson L.P., Nelson G.W., Phair J.P., Lautenberger J., Johnson R.C., Kingsley L., Margolick J.B., Detels R., Goedert J.J., O’Brien S.J. Host genetic influences on highly active antiretroviral therapy efficacy and AIDS-free survival. J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 2008; 48(3): 263–271.

3. Хоффман К., Рокштро Ю.К. (ред.). ВИЧ 2014/2015. Гамбург, Бонн: Medizin Fokus, 2014. 924 с.

4. Langford S.E., Ananworanich J., Cooper D.A. Predictors of disease progression in HIV infection: a review. AIDS Res. Ther. 2007; 4: 11–25.

5. Покровский В.В., ред. ВИЧ-инфекция и СПИД. Национальное руководство. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2013. 608 с.

6. The International HapMap 3 Consortium, Altshuler D.M., Gibbs R.A., Peltonen L., Dermitzakis E., Schaffner S.F., Yu F., de Bakker P.I.W., Deloukas P., Gabriel S.B., Gwilliam R., Hunt S., Inouye M., Jia X., Palotie A., Parkin M., Whittaker P., Chang K., Hawes A., Lewis L.R., Ren Y., Wheeler D., Gibbs R.A., Muzny D.M., Barnes Ch., Darvishi K., Hurles M., Korn J.M., Kristiansson K., Lee Ch., McCarrol S.A., Nemesh J., Keinan A., Montgomery S.B., Pollack S., Price A.L., Soranzo N., Bonnen P.E., Gibbs R.A., Gonzaga-Jauregui C., Keinan A., Price A.L., Anttila V., Brodeur W., Daly M.J., Leslie S., McVean G., Moutsianas L., Nguyen H., Schaffner S.F., Zhang Q., Ghori M.J.R., McGinnis R., McLaren W., Takeuchi F., Grossman S.R., Shlyakhter I., Hostetter E.B., Sabeti P.C., Adebamowo C.A., Foster M.W., Gordon D.R., Licinio J., Manca M., Marshall A., Matsuda I., Ngare D., Wang V.O., Reddy D., Rotimi Ch.N., Royal Ch.D., Sharp R.R., Zeng Ch., Brooks L.D., McEwen J.E. Integrating common and rare genetic variation in diverse human populations. Nature 2010; 467(7311): 52–58.

7. Мутовин Г.Р. Клиническая генетика. Геномика и протеомика наследственной патологии. Учебное пособие. 3-е изд., перераб. и доп. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2010. 832 с.

8. Бородина Т. Методы детекции SNP. Практическая молекулярная биология, 2001. http://molbiol.edu.ru/review/04_03.html

9. Гинтер Е.К. Медицинская генетика. Учебник. М: Медицина, 2003. 339 с.

10. Sobieszczyk M.E., Lingappa J.R., McElrath M.J. Host genetic polymorphisms associated with innate immune factors and HIV-1. Curr. Opin. HIV AIDS 2011; 6(5): 427–434.

11. Миронов К.О., Дунаева Е.А., Дрибноходова О.П., Шипулин Г.А. Определение нуклеотидных полиморфизмов с помощью систем генетического анализа, основанных на пиросеквенировании. Лабораторная медицина 2013; 12: 75–79.

12. Pinney J.W., Dickerson J.E., Fu W., Sanders-Beer B.E., Ptak R.G., Robertson D.L. HIV-host interactions: a map of viral perturbation of the host system. AIDS 2009; 23(5): 549–554.

13. Бобкова М.Р. ВИЧ-инфекция и генетика человека. Тер.архив 2009; 81(12): 78–84.

14. Coloccini R.S., Dilernia D., Ghiglione Y., Turk G., Laufer N., Rubio A., Socías M.E., Figueroa M.I., Sued O., Cahn P., Salomón H., Mangano A., Pando M.A. Host genetic factors associated with symptomatic primary acute HIV-infection and disease progression among Argentinean seroconverters. PLoS One 2014; 9(11): e113146.

15. Reiche E.M., Bonametti A.M., Voltarelli J.C., Morimoto H.K., Watanabe M.A. Genetic Polymorphisms in the Chemokine and Chemokine Receptors: Impact on Clinical Course and Therapy of the Human Immunodeficiency Virus Type 1 Infection (HIV-1). Curr. Med. Chem. 2007; 14(12): 1325–1334.

16. Liu S., Zhu H. Association between polymorphism of SDF1 (CXCL12) gene and HIV-1 susceptibility: a meta-analysis. Curr. HIV Res. 2011; 9(2): 112–119.

17. Mahajan S.D., Agosto-Mojica A., Aalinkeel R., Reynolds J.L., Nair B.B., Sykes D.E., Martinez J., Adams J., Singh N., Bernstein Z., Hsiao C.B., Schwartz S.A. Role of chemokine and cytokine polymorphisms in the progression of HIV-1 disease. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2010; 396(2): 348–352.

18. Compaore T.R., Soubeiga S.T., Ouattara A.K., Obiri-Yeboah D., Tchelougou D., Maiga M., Assih M., Bisseye C., Bakouan D., Compaore I.P., Dembele A., Martinson J., Simpore J. APOBEC3G Variants and Protection against HIV-1 Infection in Burkina Faso. PLoS One 2016; 11(1): e0146386.

19. Хаитов P.M. Иммунология. Учебник. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2015. 528 с.

20. Киреев Д.Е., Куевда Д.А. Разработка и внедрение в лабораторную практику набора реагентов для обнаружения аллели HLA B*5701 главного комплекса гистосовместимости с целью исключения случаев возникновения реакции гиперчувствительности при использовании абакавирсодержащей терапии. В кн: Покровский В.И., ред. Молекулярная диагностика – 2010. М.: ООО «Рекламное Агентство «ЭйВиДжи», 2010; V: 8–11.

21. Nolan D., Gaudieri S., John M., Mallal S. Impact of Host Genetics on HIV Disease Progression and Treatment: New Conflicts on an Ancient Battleground. AIDS 2004; 18(9): 1231–1240.

22. Bashirova A.A., Thomas R., Carrington M. HLA/KIR Restraint of HIV: Surviving the Fittest. Annu. Rev. Immunol. 2011; 29: 295–317.

23. Boulet S., Kleyman M., Kim J.Y., Kamya P., Sharafi S., Simic N., Bruneau J., Routy J.P., Tsoukas C.M., Bernard N.F. A combined genotype of KIR3DL1 high expressing alleles and HLA-B*57 is associated with a reduced risk of HIV infection. AIDS 2008; 22(12): 1487–1491.

24. Pérez-Núñez By D., Martínez-Quiles N. Genetic Factors that Influence HIV Infection: The Role of the Major Histocompatibility Complex System. In: Chang T.L., ed. HIV-Host Interactions. INTECH 2011; 9: 205–238.

25. Friedrich T.C., Dodds E.J., Yant L.J., Vojnov L., Rudersdorf R., Cullen C., Evans D.T., Desrosiers R.C., Mothé B.R., Sidney J., Sette A., Kunstman K., Wolinsky S., Piatak M., Lifson J., Hughes A.L., Wilson N., O’Connor D.H., Watkins D.I. Reversion of CTL escape-variant immunodeficiency viruses in vivo. Nat. Med. 2004; 10(3): 275–281.

26. Leslie A.J., Pfafferott K.J., Chetty P., Draenert R., Addo M.M., Feeney M., Tang Y., Holmes E.C., Allen T., Prado J.G., Altfeld M., Brander C., Dixon C., Ramduth D., Jeena P., Thomas S.A., St. John A., Roach T.A., Kupfer B., Luzzi G., Edwards A., Taylor G., Lyall H., Tudor-Williams G., Novelli V., Martinez-Picado J., Kiepiela P., Walker B.D., Goulder P.J. HIV evolution: CTL escape mutation and reversion after transmission. Nat. Med. 2004; 10(3): 282–289.

27. Saikia B., Wanchu A., Mahakur S., Bind M., Sarkar K., Minz R.W. Analysis of HLA association among North Indian HIV-positive individuals co-infected with Mycobacterium tuberculosis. Lung India 2015; 32(5): 449–452.

28. Rosentul D.C., Plantinga T.S., Papadopoulos A., Joosten L.A., Antoniadou A., Venselaar H. Kullberg B.J., van der Meer J.W., Giamarellos-Bourboulis E.J., Netea M.G. Variation in genes of β-glucan recognition pathway and susceptibility to opportunistic infections in HIV-positive patients. Immunol. Invest. 2011; 40(7–8): 735–750.

29. An P., Li R., Wang J.M., Yoshimura T., Takahashi M., Samudralal R., O’Brien S.J., Phair J., Goedert J.J., Kirk G.D., Troyer J.L., Sezgin E., Buchbinder S.P., Donfield S., Nelson G.W., Winkler C.A. Role of Exonic Variation in Chemokine Receptor Genes on AIDS: CCRL2 F167Y Association with Pneumocystis Pneumonia. PLoS Genet. 2011; 7(10): e1002328.

30. Alagarasu K., Selvaraj P., Swaminathan S., Raghavan S., Narendran G., Narayanan P.R. Mannose binding lectin gene variants and susceptibility to tuberculosis in HIV-1 infected patients of South India. Tuberculosis (Edinb.) 2007; 87(6): 535–543.

31. Sezgin E., van Natta M.L., Ahuja A., Lyon A., Srivastava S., Troyer J.L., O’Brien S.J., Jabs D.A.; Studies of the Ocular Complications of AIDS Research Group. Association of Host Genetic Risk Factors with the Course of Cytomegalovirus Retinitis in Patients Infected with HIV. Am. J. Ophthalmol. 2011; 151(6): 999–1006.

32. Приоритетные аспекты изучения проблемы ТБ/ВИЧ в условиях высокой распространенности ВИЧ-инфекции и ограниченных ресурсов. Женева: ВОЗ, 2011. http://www.stoptb.org/wg/tb_hiv/assets/documents/priorityresearch_russian.pdf

33. Рудко А.А., Фрейдина М.Б., Пузырева В.П. Наследственная предрасположенность туберкулёзу. Молекулярная медицина 2011; 3: 3–10.

34. Романов А.О, Беляева Т.В., Красильщикова И.В. Частота встречаемости полиморфизма +230G/A гена MBL у жителей Санкт-Петербурга. Medline.ru. 2006; 7(1): 372–377.

35. Catano G., Agan B.K., Kulkarni H., Telles V., Marconi V.C., Dolan M.J., Ahuja S.K.. Independent Effects of Genetic Variationsin Mannose-Binding Lectin Influence the Course of HIV Disease: The Advantage of Heterozygosity for Coding Mutations. J. Infect. Dis. 2008; 198(1): 72–80.

36. Zhang Y., Jiang T., Yang X., Xue Y., Wang C., Liu J., Zhang X., Chen Z., Zhao M., Li J.C. Toll-Like Receptor -1, -2, and -6 Polymorphisms and Pulmonary Tuberculosis Susceptibility: A Systematic Review and Meta-Analysis. PLoS One 2013; 8(5): e63357.

37. Pulido I., Leal M., Genebat M., Pacheco Y.M., Sáez M.E., Soriano-Sarabia N. The TLR4 ASP299GLY polymorphism is a risk factor for active tuberculosis in Caucasian HIV-infected patients. Curr. HIV Res. 2010; 8(3): 253–258.

38. Davila S., Hibberd M.L., Hari Dass R., Wong H.E., Sahiratmadja E., Bonnard C., Alisjahbana B., Szeszko J.S., Balabanova Y., Drobniewski F., van Crevel R., van de Vosse E., Nejentsev S., Ottenhoff T.H., Seielstad M. Genetic Association and Expression Studies Indicate a Role of Toll-Like Receptor 8 in Pulmonary Tuberculosis. PLoS Genet. 2008; 4(10): e1000218.

39. Oh D.Y., Taube S., Hamouda O., Kücherer C., Poggensee G., Jessen H., Eckert J.K., Neumann K., Storek A., Pouliot M., Borgeat P., Oh N., Schreier E., Pruss A., Hattermann K., Schumann R.R. A functional toll-like receptor 8 variant is associated with HIV disease restriction. J. Infect. Dis. 2008; 198(5): 701–709.

40. Pontillo A., Carvalho M.S., Kamada A.J., Moura R., Schindler H.C., Duarte A.J., Crovella S. Susceptibility to Mycobacterium tuberculosis infection in HIV-positive patients is associated with CARD8 genetic variant. J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 2013; 63(2): 147–151.

41. Affandia J.S., Kumarb M., Agarwalc U., Singhb S., Pricea P.. The search for a genetic factor associating with immune restoration disease in HIV patients co-infected with Mycobacterium tuberculosis. Dis Markers. 2013; 34(6): 445–449.


Об авторах / Для корреспонденции


Для корреспонденции:
Кулабухова Екатерина Игоревна – аспирант Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Адрес: 105275, Москва, 8-я ул. Соколиной горы, д. 15, корп. 2
Телефон: +7(495) 366-05-18
E-mail: ekulabukhova@mail.ru

Сведения об авторах:
Кравченко Алексей Викторович – д-р мед. наук, проф., вед. науч. сотр. Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; kravtchenko@hivrussia.net
Зимина Вера Николаевна – д-р мед. наук, доц. каф. инфекционных болезней с курсами эпидемиологии и фтизиатрии Российского университета дружбы народов; vera-zim@yandex.ru
Покровская Анастасия Вадимовна – канд. мед. наук, науч. сотр. Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора; pokrovskaya_av@mail.ru


Похожие статьи


Бионика Медиа