Лекарственная устойчивость ВИЧ-1 среди АРТ-наивных недавно инфицированных пациентов в Иркутской области


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2025.15.3.35-40

Ревизор А.О., Плотникова Ю.К., Пономарева О.А., Шулунов А.А., Черкасов Н.Н., Вершинин П.Е, Наумова Е.С., Кузнецова Е.А., Танхаева А.И., Полякова П.А.

1) Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями, Иркутск, Россия; 2) Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования – филиал Российской медицинской академии непрерывного профессионального образования Минздрава России, Иркутск, Россия
Цель исследования. Определение распространенности передающейся лекарственной устойчивости (ЛУ) к препаратам антиретровирусной терапии (АРТ) среди недавно инфицированных ВИЧ пациентов, не имевших опыта получения АРТ, на территории Иркутской области.
Материалы и методы. В 2019 и 2023 г. проведены 2 пороговых исследования передающейся ЛУ ВИЧ в выборках пациентов Иркутского областного центра по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями. В обоих исследованиях использовали плазму крови от 50 ВИЧ-инфицированных лиц, не имевших опыта АРТ, с предположительной давностью заражения не более 1 года и уровнем CD4+-лимфоцитов > 500 клеток/мкл на момент исследования.
Результаты. Мутации передающейся ЛУ были выявлены в образцах от 3 пациентов в 2019 г. и от 6 – в 2023 г. (6% (90% ДИ 0,5–11,5%) и 12% (90% ДИ 4,4–19,6%) соответственно). В выборке 2019 г. у 2 (4%) пациентов обнаружены мутации ЛУ к ненуклеозидным ингибиторам обратной транскриптазы (ННИОТ) и у 1 (2%) – к ингибиторам протеазы (ИП). В 2023 г. были обнаружены следующие варианты ЛУ: 2 (4%) пациента с ЛУ к ИП, 2 (4%) – к ННИОТ, 1 (2%) – к НИОТ+ННИОТ и 1 (2%) – к ИП+ННИОТ. По данным филогенетического анализа в выборке 2019 г. 1 (2%) образец кластеризовался с субтипом В, 5 (10%) – с рекомбинантом CRF63 02_A6, остальные 44 (88%) образца типировались как А6. В 2023 г. выявлено следующее распределение: А6 – 90%, CRF63 02_A6 – 8%, В – 2%.
Заключение. Передающаяся ЛУ ВИЧ в Иркутской области на данный момент установилась на значении в 12%, что не превышает порог в 15%, после которого необходимо проводить тестирование каждого пациента перед назначением АРТ. Целесообразно провести повторное исследование на передающуюся ЛУ через 2 года для оценки динамики распространения устойчивых штаммов ВИЧ.
Ключевые слова: лекарственная устойчивость, мутация, ВИЧ
Полный текст статьи доступен
в "Библиотеке Врача"

Литература

1. Бобкова М.Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ. М.: Человек, 2014. 288 с.


Bobkova M.R.


2. Кравченко А.В., Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Беляева В.В. Резистентность ВИЧ к антиретровирусной терапии. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2023. 112 с. DOI: 10.33029/9704-7620-8-RAT-2023-1-112


Kravchenko A.V., Kirichenko A.A., Kireev D.E., Belуaeva V.V.


3. HIV-1 Drug Resistance in ARV-naive Populations. Compendium of published virus sequences from 95,024 persons, 442 studies according to region, year and subtype. https://hivdb.stanford.edu/_wrapper/surveillance/map/


4. Clutter D.S., Jordan M.R., Bertagnolio S., Shafer R.W. HIV-1 drug resistance and resistance testing. Infect. Genet. Evol. 2016; 46: 292–307. DOI: 10.1016/j.meegid.2016.08.031


5. Kirichenko A., Kireev D., Lapovok I., Shlykova A., Lopatukhin A., Pokrovskaya A. et al. HIV-1 Drug Resistance among Treatment-Naïve Patients in Russia: Analysis of the National Database, 2006–2022. Viruses 2023; 15: 991. DOI: 10.3390/v15040991


6. Bennett D.E., Camacho R.J., Otelea D., Kuritzkes D.R., Fleury H., Kiuchi M. et al. Drug resistance mutations for surveillance of transmitted HIV-1 drug-resistance: 2009 update. PLoS One 2009; 4(3): 4724. DOI: 10.1371/journal.pone.0004724


7. May M., Sterne J.A., Sabin C., Costagliola D., Justice A.C., Thiebaut R. et al. Prognosis of HIV-1-infected patients up to 5 years after initiation of HAART: collaborative analysis of prospective studies. AIDS 2007; 21(9): 1185–1197. DOI: 10.1097/QAD.0b013e328133f285


8. Sabin C.A., Smith C.J., Gumley H., Murphy G., Lampe F.C., Phillips A.N. et al. Late presenters in the era of highly active antiretroviral therapy: uptake of and responses to antiretroviral therapy. AIDS 2004; 18(16): 2145–2151. DOI: 10.1097/00002030-200411050-00006


9. Scherrer A.U., Boni J., Yerly S., Klimkait T., Aubert V., Furrer H. et al. Long-lasting protection of activity of nucleoside reverse transcriptase inhibitors and protease inhibitors (PIs) by boosted PI containing regimens. PLoS One 2012; 7(11): 50307. DOI: 10.1371/journal.pone.0050307


10. Lodi S., Günthard H.F., Gill J., Phillips A.N., Dunn D., Vu Q. et al. Effectiveness of Transmitted Drug Resistance Testing Before Initiation of Antiretroviral Therapy in HIV-Positive Individuals. J. Acquir. Immune. Defic. Syndr. 2019; 82(3): 314–320. DOI: 10.1097/QAI.0000000000002135


11. World Health Organization (WHO). Updated recommendations on first-line and second-line antiretroviral regimens and post-exposure prophylaxis and recommendations on early infant diagnosis of HIV Interim guidance. 2018. WHO-update-of-recommendations-on-first-and-second-line-ARV-regimens pdf


12. Günthard H.F., Calvez V., Paredes R., Pillay D., Shafer R.W., Wensing A.M. et al. Human Immunodeficiency Virus Drug Resistance: 2018 Recommendations of the International Antiviral Society-USA Panel. Clin. Infect. Dis. 2019; 68(2): 177–187. DOI: 10.1093/cid/ciy463


13. Scherrer A.U., Yang W.L., Kouyos R.D., Böni J., Yerly S., Klimkait T. et al. Swiss HIV Cohort Study. Successful Prevention of Transmission of Integrase Resistance in the Swiss HIV Cohort Study. J. Infect. Dis. 2016; 214(3): 399–402. DOI: 10.1093/infdis/jiw165


14. Scherrer A.U., von Wyl V., Yang W.L., Kouyos R.D., Böni J., Yerly S. et al. Emergence of Acquired HIV-1 Drug Resistance Almost Stopped in Switzerland: A 15-Year Prospective Cohort Analysis. Clin. Infect. Dis. 2016; 62(10): 1310–1317. DOI: 10.1093/cid/ciw128


15. Günthard H.F., Saag M.S., Benson C.A., del Rio C., Eron J.J., Gallant J.E. et al. Antiretroviral Drugs for Treatment and Prevention of HIV Infection in Adults: 2016 Recommendations of the International Antiviral Society-USA Panel. JAMA 2016; 316(2): 191–210. DOI: 10.1001/jama.2016.8900


16. HIV drug resistance strategy, 2021 update. World Health Organization, 2021. https://www.who.int/publications/i/item/9789240030565


17. Guidelines on the public health response to pretreatment HIV drug resistance: July 2017. World Health Organization, 2017. https://www.who.int/publications/i/item/9789241550055


18. ВИЧ-инфекция у взрослых. Клинические рекомендации КР 79. М.: Национальная ассоциация специалистов по профилактике, диагностике и лечению ВИЧ-инфекции. Национальная вирусологическая ассоциация, 2020. 87 с. https://arvt.ru/sites/default/files/rf-2017-protokol-vich-vzroslie.pdf


[HIV infection in adults. Clinical guidelines KR 79]. Moscow, 2020. 87 p. (In Russ). https://arvt.ru/sites/default/files/rf-2017-protokol-vich-vzroslie.pdf


19. Покровский В.В., Юрин О.Г., Кравченко А.В., Беляева В.В., Буравцова Е.В., Деулина М.О. и др. Рекомендации по лечению ВИЧ-инфекции и связанных с ней заболеваний, химиопрофилактике заражения ВИЧ. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2021; 11(4, приложение): 92 с.


Pokrovskу V.V., Yurin O.G., Kravchenko A.V., Belyayeva V.V.. Buravtsova E.V., Deulina M.O. et al.


20. Guidelines for the Clinical Management and Treatment of HIV Infected Adults in Europe (Version 11.0; November 2021). Eur. AIDS Clin. Soc. http://www.eacsociety.org


21. Надзор за распространением штаммов ВИЧ, резистентных к антиретровирусным препаратам: Методические рекомендации МР 3.1.5.0075/1-13. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2014. 58 с.


[Surveillance of the spread of HIV strains resistant to antiretroviral drugs: Methodological recommendations MR 3.1.5.0075/1-13]. Moscow, 2014. 58 p. (In Russ.).


22. Tamura K., Nei M. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution. 1993; (10): 512 –526.


23. Tamura K., Stecher G., Kumar S. MEGA 11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11. Molecular Biology and Evolution 2021. DOI:10.1093/molbev/msab120


24. Paredes R., Tzou P.L., van Zyl G., Barrow G., Camacho R., Carmona S. et al. Collaborative update of a rule-based expert system for HIV-1 genotypic resistance test interpretation. PLoS One 2017; 12(7): 0181357. DOI: 10.1371/journal.pone.0181357


25. Rhee S.Y., Taylor J., Fessel W.J., Kaufman D., Towner W., Troia P. et al. HIV-1 protease mutations and protease inhibitor cross-resistance. Antimicrob Agents Chemother. 2010; 54(10): 4253–4261. DOI: 10.1128/AAC.00574-10


26. Lanier E.R., Ait-Khaled M., Scott J., Stone C., Melby T., Sturge G. et al. Antiviral efficacy of abacavir in antiretroviral therapy-experienced adults harbouring HIV-1 with specific patterns of resistance to nucleoside reverse transcriptase inhibitors. Antivir. Ther. 2004; 9(1): 37–45. DOI: 10.1177/135965350400900102


27. Azijn H., Tirry I., Vingerhoets J., de Béthune M.P., Kraus G., Boven K. et al. TMC278, a next-generation nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor (NNRTI), active against wild-type and NNRTI-resistant HIV-1. Antimicrob. Agents. Chemother. 2010; 54(2): 718–727. DOI: 10.1128/AAC.00986-09


28. Rhee S.Y., Liu T., Ravela J., Gonzales M.J., Shafer R.W. Distribution of human immunodeficiency virus type 1 protease and reverse transcriptase mutation patterns in 4,183 persons undergoing genotypic resistance testing. Antimicrob. Agents Chemother. 2004; 48(8): 3122–3126. DOI: 10.1128/AAC.48.8.3122-3126.2004


29. Reuman E.C., Rhee S.Y., Holmes S.P., Shafer R.W. Constrained patterns of covariation and clustering of HIV-1 non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor resistance mutations. J. Antimicrob. Chemother. 2010; 65(7): 1477– 1485. DOI: 10.1093/jac/dkq140


30. Maldonado J.O., Mansky L.M. The HIV-1 Reverse Transcriptase A62V Mutation Influences Replication Fidelity and Viral Fitness in the Context of Multi-Drug-Resistant Mutations. Viruses 2018; 10(7): 376. DOI: 10.3390/v10070376


Об авторах / Для корреспонденции

Ревизор Александр Олегович – биолог клинико-диагностическая лаборатория № 3, Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями, Иркутск, Россия; rao@aids38.ru; https://orcid.org/0000-0002-6876-124X
Плотникова Юлия Кимовна – к.м.н., главный врач, Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями; доцент, Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования – филиал Российской медицинской академии непрерывного профессионального образования Минздрава России, Иркутск, Россия; plot18@yandex.ru; https://orcid.org/0000-0003-2912-9118
Пономарева Ольга Александровна – врач, заведующая клинико-диагностической лабораторией № 3, Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями, Иркутск, Россия; poa@aids38.ru; https://orcid.org/0000-0001-9154-211X
Шулунов Алексей Александрович – врач клинико-диагностической лаборатории № 3, Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями, Иркутск, Россия; Shulunov18@gmail.com; https://orcid.org/0009-0008-5034-3390
Черкасов Николай Николаевич – биолог клинико-диагностической лаборатории №3, Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями, Иркутск, Россия; mto_cherkasov_nn@mail.ru; https://orcid.org/0009-0006-1343-7051
Вершинин Петр Евгеньевич – биолог клинико-диагностической лаборатории № 3, Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями, Иркутск, Россия; petr0trep@gmail.com; https://orcid.org/0009-0008-4605-9450
Наумова Елена Степановна – врач клинико-диагностической лаборатории № 3, Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями. Иркутск, Россия; Naumova_e_s26@mail.ru; https://orcid.org/0009-0005-2724-6718
Кузнецова Екатерина Аркадьевна – врач клинико-диагностической лаборатории № 3, Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями, Иркутск, Россия; Atomarnaya@mail.ru; https://orcid.org/0009-0006-6967-6342
Танхаева Алена Ивановна – биолог клинико-диагностической лаборатории № 3, Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями, Иркутск, Россия; alena.pilueva@mail.ru; https://orcid.org/0009-0009-9753-7042
Полякова Полина Алексеевна – биолог клинико-диагностической лаборатории № 3, Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями, Иркутск, Россия; poly.poliackova28@yandex.ru; https://orcid.org/0009-0004-4880-6828


Похожие статьи

К содержанию номера

Бионика Медиа