Using english-language public access internet resources for rapid monitoring of information about current outbreaks of infectious diseases


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2023.13.4.84-6

Petrov V.N.

State Scientific Center of Virology and Biotechnology «Vector», Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being, Koltsovo, Novosibirsk Region, Russia
Objective. Identification of possible approaches to using publicly available online tools to monitor information about significant infectious disease outbreaks to enable the compilation of daily fact sheets on disease incidence, response measures, and epidemiologically relevant research findings.
Materials and methods. Well-known information and analytical resources on the Internet used to monitor modern trends and scientific knowledge in the field of infectious diseases were analyzed for the completeness and frequency of updating information.
Results. Several dozen information resources have been identified that provide broad coverage of outbreak issues.
Conclusion. High-quality coverage of epidemiological phenomena is possible using a limited set of Internet resources of various types, configured depending on the timing and tasks at hand, and can be implemented with the involvement of minimal human resources with professional and linguistic competencies.

Своевременное получение информации: 1) о первых случаях неизвестного заболевания; 2) вспышках, вызванных уже известными патогенами, которые могут повлиять на локальную, региональную или глобальную санитарно-эпидемическую ситуацию; 3) новых эпидемиологических трендах является одним из ключевых условий успешного функционирования целого ряда институтов общественного здравоохранения.

Сведения об инфекционной заболеваемости важны для принятия разнообразных решений, связанных с обеспечением биологической безопасности. Это, в первую очередь, решения о мерах предотвращения и реагирования на биологические угрозы, реализуемые профильными ведомствами и органами власти, и проведения необходимых исследований для создания медицинских средств противодействия инфекции.

Вопросы эффективного использования общедоступной информации для купирования биологических рисков рассматриваются на самом высоком уровне, например, в рамках реализуемой под эгидой ВОЗ инициативы «Платформа оперативно-аналитической эпидемиологической информации из открытых источников» (EIOS) (https://www.who.int/initiatives/eios).

Ландшафт информационных ресурсов и способов получения информации об эпидемиологически актуальных событиях разнообразен и динамичен.

Так, в период пандемии, на фоне острой потребности в научных данных, большую роль сыграли препринты, на которые пришлась треть всех статей по COVID-19 в первые 4 мес. пандемии [1]. Многие из препринтов позднее были опубликованы в рецензируемых журналах. В частности, доля таких препринтов за 2020 г. на сервере «medRxiv» составила 51,2% [2].

В сети Интернет можно встретить уже сформированные перечни ресурсов для слежения за вспышками. Список таких ресурсов, связанных с «оперативно-аналитической эпидемиологической информацией», есть на сайте Европейского центра по контролю и профилактике заболеваний (https://www.ecdc.europa.eu/en/about-us/what-we-do/ecdc-activities-epidemic-intelligence-and-outbreak-response). Свой список интернет-источников по «новым инфекциям, имеющим международное санитарно-эпидемиологическое значение», предлагает Школа общественного здравоохранения и общественной медицины Вашингтонского университета (https://depts.washington.edu/eminf/2004/resources.htm). Глобальная сеть программ подготовки в области полевой эпидемиологии (TEPHINET) также обращает внимание посетителей сайта на ресурсы, сообщающие «новости и последние данные по вспышкам заболеваний и эпидемиям» (https://www.tephinet.org/news-media/outbreak-news), и даже предлагает пополнить его, отправив информацию на электронную почту.

Обзоры источников информации для решения конкретных задач можно встретить как в зарубежной литературе (например, связанные с неофициальными цифровыми ресурсами для эпиднадзора за инфекционными заболеваниями) [3], так и в отечественной (например, для обеспечения санитарной охраны территории Российской Федерации) [4].

Упоминаемые в настоящей работе источники не являются безальтернативными и не предлагаются автором в качестве абсолютно лучших в своем роде, а призваны, скорее, послужить ориентиром при планировании соответствующих мониторинговых работ.

В большинстве случаев для формирования «объемной» картины происходящих эпидемических событий недостаточно одних лишь «сухих» цифр заболеваемости. Во внимание необходимо принимать и научные исследования, и предпринимаемые странами ответные меры, и официальные руководящие документы, и мнения экспертов, и многие другие виды информации. В рамках настоящей работы мы исходим из того, что используемые источники данных должны удовлетворять все обозначенные информационные потребности.

Непрерывное слежение за информацией сложно представить без использования постоянно обновляемых источников, на роль которых подходят крупные СМИ, к примеру, Рейтер, его специальный раздел «Заголовки новостей о здоровье» (https://www.reuters.com/news/archive/healthNews), и поисковые сервисы, например «Yahoo», позволяющий отдельно следить за новостями в рубрике «Здоровье» (https://news.yahoo.com/health). Использование подобного рода источников в реальном времени позволяет не пропустить то или иное событие, которое ожидаемо будет интересно читателям, например, новые вспышки болезней, вызванных вирусами Эбола, Марбург или Нипах.

Зачастую именно СМИ первыми передают не всегда доступные в силу языковых и технических барьеров официальные цифры заболеваемости в странах и даже оперативно агрегируют их, примером чего могут служить в настоящее время архивные проекты «BNO News» по mpox (https://bnonews.com/monkeypox) и новому коронавирусу (https://bnonews.com/index.php/2020/04/the-latest-coronavirus-cases). Также хорошо известны институциональные проекты по трекингу заболеваемости, например, реализованные Институтом Джонса Хопкинса в отношении COVID-19 (https://coronavirus.jhu.edu/map.html) и консорциумом «Global.health» – по mpox (https://global.health/2022/06/09/tracking-the-2022-monkeypox-outbreak-with-epidemiological-data-in-real-time).

В том случае, если уровень подготовки получателей готовой информационно-аналитической продукции неоднороден или недостаточен для восприятия сугубо научного изложения, ключевым инструментом создания адаптированных сообщений могут стать именно СМИ в максимально широком смысле этого термина – в диапазоне от специализированных «STAT News» (https://www.statnews.com/) и «The Conversation» (https://theconversation.com/global) до менее узкопрофильных, но тяготеющих к развернутому изложению «Vox» (https://www.vox.com), «NPR» (https://www.npr.org/), «POLITICO» (https://www.politico.eu), «Project Syndicate» (https://www.project-syndicate.org), «Бюллетень ученых-атомщиков» (https://thebulletin.org), Блумберг (https://www.bloomberg.com/industries/health) и др.

Активный обмен ценными экспертными мнениями и научными данными происходит в социальных сетях, на форумах и в блогосфере, примером чего могут быть блоги Килиана Кроуфорда «H5N1» (https://crofsblogs.typepad.com/h5n1), директора Института «Скриппс Рисеч» Эрика Тополя (https://erictopol.substack.com), Майкла Костона «Avian Flu Diary» (https://afludiary.blogspot.com/) и форум «FluTrackers» (https://flutrackers.com).

Часто сами научные учреждения публикуют пресс-релизы, доступно рассказывая о полученных результатах исследований. Исключительно полезной в данном случае является платформа по распространению пресс-релизов «EurekAlert» (https://www.eurekalert.org), позволяющая «день в день» узнавать о выходе той или иной научной статьи.

Это особенно важно, поскольку при ежедневном непрерывном мониторинге индексы цитирования, например «Web of Science», ««Scopus» (на момент подготовки публикации ресурсы недоступны в Российской Федерации в рамках национальной подписки), «PubMed» (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov) и «Google Scholar» (https://scholar.google.com), в которые метаданные о публикациях попадают с неизбежной задержкой, становятся лишь вспомогательным инструментом, уступая поиску непосредственно на платформах издателей научной периодики. Оценивая возможные потери, круг используемых платформ можно ограничить несколькими крупнейшими издателями, например «Elsevier» (https://www.sciencedirect.com), «Springer Nature» (https://link.springer.com), «Wiley» (https://onlinelibrary.wiley.com), «Taylor & Francis» (https://www.tandfonline.com), «Oxford University Press» (https://academic.oup.com/) и т.п., дополнительно задействовав агрегаторы научных новостей, например «Medical News» (https://www.news-medical.net), и, учитывая современные тенденции, препринтные серверы, например «Research Square» (https://www.researchsquare.com), «medRxiv» (https://www.medrxiv.org) и «bioRxiv» (https://www.biorxiv.org).

Среди ресурсов, во многом специализирующихся на вспышках, следует выделить «Outbreak News Today» (https://outbreaknewstoday.com), Центр исследований и политики в области инфекционных заболеваний (https://www.cidrap.umn.edu) и доступный на уровне заголовков портал «Pandemic Preparedness» (https://pandemic.internationalsos.com) группы «International SOS».

В случаях, когда необходимы широкий охват нозологических форм, а также информация по определенным регионам, незаменимыми могут стать обеспечивающие географическую визуализацию агрегаторы «HealthMap» (https://www.healthmap.org) и «EPIWATCH» (https://www.epiwatch.org).

В формате периодических политематических сводок последних новостей информацию выпускает Школа политики и управления им. Шара при Университете Джорджа Мейсона (https://pandorareport.org/category/pandora-report), Центр медико-санитарной безопасности Университета Джонса Хопкинса (https://www.centerforhealthsecurity.org) и портал «Глобальная биозащита» (https://globalbiodefense.com).

Сложно представить полноценную аналитическую работу без использования публикаций международных организаций, включая ВОЗ с ее региональными бюро (https://www.who.int/home), Европейский Центр по контролю и профилактике заболеваний (https://www.ecdc.europa.eu/en), Гави, альянс по вакцинам (https://www.gavi.org), Коалицию по инновациям в области обеспечения готовности к эпидемиям (https://cepi.net) и ряд других.

При ежедневном адресном мониторинге новостей о конкретном патогене удобным может оказаться анализ поисковых результатов в Google за последние 24 ч или час. Применимость этого подхода ограничена запросами, количество публикуемых материалов по которым не слишком велико. В противном случае доля дублирующихся по содержанию и нерелевантных материалов существенно осложнит навигацию в сотнях заголовков.

Google может стать не только ценным дополнением и своего рода «проверочным этапом» после «виртуального обхода» перечня отобранных ресурсов, но и позволит пополнять этот перечень за счет своевременного выявления новых ресурсов, включивших в свою повестку представляющую интерес тематику, например, путем создания специальных разделов, как это, в частности, произошло в период пандемии COVID-19 с сайтом Си-Эн-Эн, на котором была сформирована страница «Коронавирус: последние новости о глобальной пандемии COVID-19» (https://edition.cnn.com/specials/world/coronavirus-outbreak-intl-hnk).

Зачастую одни и те же источники закрывают целую группу информационных потребностей, за счет чего их число может без потерь информации свестись к нескольким десяткам. Работа с таким ограниченным набором интернет-сайтов создает предпосылки для реализуемой в условиях высокой информированности качественной информационно-аналитической работы с привлечением относительно небольшого штата специалистов, обладающих необходимой языковой и профессиональной подготовкой.


Literature


1. Watson C. Rise of the preprint: how rapid data sharing during COVID-19 has changed science forever. Nat. Med. 2022; 28(1): 2–5. DOI: 10.1038/s41591-021-01654-6


2. Llor C., Moragas A., Maier M. Evaluation of Publication of COVID-19-Related Articles Initially Presented as Preprints. JAMA Netw Open. 2022; 5(12): e2245745. DOI: 10.1001/jamanetworkopen.2022.45745


3. Magid A., Gesser-Edelsburg A., Green M.S. The Role of Informal Digital Surveillance Systems Before, During and After Infectious Disease Outbreaks: A Critical Analysis. In: Radosavljevic, V., Banjari, I., Belojevic, G., eds. Defence Against Bioterrorism. NATO Science for Peace and Security Series A: Chemistry and Biology. Dordrecht: Springer, 2018: 189–201. DOI: 10.1007/978-94-024-1263-5_14


4. Шиянова А.Е., Дмитриева Л.Н., Карнаухов И.Г. Источники информации о заболеваемости в мире инфекционными болезнями, значимыми для санитарной охраны территории Российской Федерации. Обзор интернет-ресурсов. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы 2016; (6): 62–6.


Shiyanova A.E., Dmitrieva L.N., Karnaukhov I.G. (Sources of Information on the Global Incidence of Infectious Diseases Important for the Sanitary Protection of the Territory of the Russian Federation: a Review of Internet Resources). Epidemiоlоgy and infectious diseases. Сurrent items 2016; (6): 62–6. (In Russ.).


About the Autors


Vladimir N. Petrov, Assistant to the General Director for Information and Analytical Work, State Scientific Center of Virology and Biotechnology «Vector», Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being, Koltsovо, Novosibirsk Region, Russia; vnpetrov@vector.nsc.ru; https://orcid.org/0000-0002-3270-8412


Similar Articles


Бионика Медиа