Генотип-ассоциированные изменения состава кишечной микробиоты у пациентов с хроническим гепатитом С: анализ с учетом половозрастных особенностей
Цель исследования. Сравнительный анализ состава кишечной микробиоты пациентов с хронической HCV-инфекцией, инфицированных вирусом генотипов 1 и 3, с учетом половозрастных особенностей. Материалы и методы. Проведено одноцентровое поперечное клиническое исследование, в которое включены 119 пациентов с хроническим гепатитом С. Определен состав микробного разнообразия кишечника методом метагеномного секвенирования 16S рРНК. Высокопроизводительное секвенирование проводили с помощью генетического анализатора MiSeq (Illumina, США) с использованием протокола, основанного на анализе вариабельных регионов гена 16S рРНК. Данные анализировали с использованием Kraken2. Результаты. У пациентов с генотипом 1 HCV отмечено увеличение численности таких таксонов, как Helicobacter (padj < 0,001), Shewanella (padj = 0,101), Terribacillus (padj < 0,001), Providencia (padj = 0,050), Coprobacter (padj < 0,001), Duodenibacillus (padj = 0,044), Paraclostridium (padj = 0,008), Monoglobus (padj < 0,001) и др. А у пациентов с генотипом 3 HCV – Yersinia (padj = 0,003), Citrobacter (padj = 0,010), Brevibacterium (padj = 0,001), Latilactobacillus (padj <0,001), Butyrivibrio (padj = 0,085), Bombilactobacillus (padj < 0,001) и др. Заключение. При инфицировании генотипом 1 HCV отмечено изменение метаболического баланса с увеличением численности условно-патогенных микроорганизмов, сульфатредуцирующих бактерий (Nitratidesulfovibrio (padj = 0,014) и бактерий, участвующих в метаболизме желчных кислот (Gordonibacter (padj = 0,112)). У пациентов с генотипом 3 наблюдается смешанная картина: увеличивается численность потенциальных патогенов и сохраняется представленность полезных бактерий.Стома И.О., Цейко З.А., Ковалев А.А., Воропаев Е.В., Осипкина О.В., Зятьков А.А., Шафорост А.С.
Ключевые слова
хронический гепатит С
кишечная микробиота
генотип HCV
микробиом
метагеномное секвенирование
Список литературы
1. Liu Z., Shi O., Zhang T., Li J., Xingdong C. Disease burden of viral hepatitis A, B, C and E: A systematic analysis. J. Viral Hepat. 2020; 27(12): 1284–1296. DOI: 10.1111/jvh.13371
2. Morozov V.A., Lagaye S. Hepatitis C virus: Morphogenesis, infection and therapy. World J. Hepatol. 2018; 10(2): 186–212. DOI: 10.4254/wjh.v10.i2.186
3. Zhang L., Zi L., Kuang T., Wang K., Qiu Z., Wu Z. et al. Investigating causal associations among gut microbiota, metabolites, and liver diseases: a Mendelian randomization study. Front. Endocrinol. (Lausanne) 2023; 14: 1159148. DOI: 10.3389/fendo.2023.1159148
4. Rodríguez J.M., Murphy K., Stanton C., Ross R.P., Kober O.I., Juge N. et al. The composition of the gut microbiota throughout life, with an emphasis on early life. Microb. Ecol. Health Dis. 2015; 26: 26050. DOI: 10.3402/mehd.v26.26050
5. Стома И.О., Цейко З.А., Воропаев Е.В., Осипкина О.В., Ковалев А.А., Зятьков А.А. и др. Изменения кишечной микробиоты на фоне хронической HCV-инфекции в зависимости от генотипа вируса. Проблемы здоровья и экологии 2025; 22(2): 147–160. (Stoma I.O., Tseiko Z.A., Voropaev E.V., Osipkina O.V., Kovalev A.A., Ziatskov A.A. et al. Changes in the intestinal microbiota with a background of chronic HCV infection,depending on the genotype of the virus. Health and Ecology Issue 2025; 22(2): 147–160. (In Russ.)). DOI 10.51523/2708-6011.2025-22-2-18
6. Papamichael K., Konstantopoulos P., Mantzaris G.J. Helicobacter pylori infection and inflammatory bowel disease: is there a link? World J. Gastroenterol. 2014; 20(21): 6374–6385. DOI: 10.3748/wjg.v20.i21.6374
7. Wie S.H. Clinical significance of Providencia bacteremia or bacteriuria. Korean J. Intern. Med. 2015; 30(2): 167–169. DOI: 10.3904/kjim.2015.30.2.167
8. Henry E.A, Devereux R., Maki J.S., Gilmour C.C., Woese C.R., Mandelco L. et al. Characterization of a new thermophilic sulfate-reducing bacterium Thermodesulfovibrio yellowstonii, gen. nov. and sp. nov.: its phylogenetic relationship to Thermodesulfobacterium commune and their origins deep within the bacterial domain. Arch. Microbiol. 1994; 161(1): 63–69.
9. Campbell C., McKenney P.T., Konstantinovsky D., Isaeva O.I., Schizas M., Verter J. et al. Bacterial metabolism of bile acids promotes generation of peripheral regulatory T-cells. Nature 2020; 581(7809): 475–479. DOI: 10.1038/s41586-020-2193-0.
10. Walter J. Ecological role of lactobacilli in the gastrointestinal tract: implications for fundamental and biomedical research. Appl. Environ. Microbiol. 2008; 74(16): 4985–4996. DOI: 10.1128/AEM.00753-081
11. Loomba R., Seguritan V., Li W., Long T., Klitgord N., Bhatt A. et al. Gut Microbiome-Based Metagenomic Signature for Non-invasive Detection of Advanced Fibrosis in Human Nonalcoholic Fatty Liver Disease. Cell Metab. 2017; 2;25(5): 1054–1062.e5. DOI: 10.1016/j.cmet.2017.04.001
12. Singh V., Lee G., Son H., Koh H., Kim E.S., Unno T. et al. Butyrate producers, «The Sentinel of Gut»: Their intestinal significance with and beyond butyrate, and prospective use as microbial therapeutics. Front. Microbiol. 2023; 13: 1103836. DOI: 10.3389/fmicb.2022.1103836
13. Schneider R., Munk M., Lebuhnv B. Importance of Defluviitalea raffinosedens for Hydrolytic Biomass Degradation in Co-Culture with Hungateiclostridium thermocellum. Microorganisms 2020; 8(6): 915. DOI: 10.3390/microorganisms8060915
14. Lee N.Y., Suk K.T., The Role of the Gut Microbiome in Liver Cirrhosis Treatment. Int. J. Mol. Sci. 2021; 22(1): 199. DOI: 10.3390/ijms22010199
Об авторах / Для корреспонденции
Стома Игорь Олегович – д.м.н., профессор, ректор, Гомельский государственный медицинский университет, Гомель, Республика Беларусь; gsmu@gsmu.by; https://orcid.org/0000-0003-0483-7329Цейко Зинаида Анатольевна – ассистент кафедры инфекционных болезней, Гомельский государственный медицинский университет, Гомель, Республика Беларусь; tzeiko.zinaida@yandex.by; https://orcid.org/0000-0002-0610-1422
Воропаев Евгений Викторович – к.м.н., доцент, проректор по научной работе, Гомельский государственный медицинский университет, Гомель, Республика Беларусь; voropaev.evgenii@gmail.com; https://orcid.org/0000-0002-9435-6109
Ковалев Алексей Алексеевич – старший преподаватель кафедры медицинской и биологической физики, Гомельский государственный медицинский университет, Гомель, Республика Беларусь; kovalev.data.analysis.gsmu@yandex.by; https://orcid.org/0000-0001-9148-487X
Осипкина Ольга Викторовна – заведующий научно-исследовательской лабораторией, Гомельский государственный медицинский университет, Гомель, Республика Беларусь; olga.osipkina@mail.ru; https://orcid.org/0000-0002-1931-4224
Зятьков Алексей Александрович – старший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории, Гомельский государственный медицинский университет, Гомель, Республика Беларусь; ziatskovaa@gmail.com; https://orcid.org/0000-0001-9542-3791
Шафорост Александр Сергеевич – старший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории, Гомельский государственный медицинский университет, Гомель, Республика Беларусь; asofocl@mail.ru; https://orcid.org/0000-0002-6725-5353
Также по теме
