Эпидемиология и Инфекционные Болезни » Анализ распространенности и генетического разнообразия респираторно-синцитиального вируса человека в период с 2021 по 2024 г.

Анализ распространенности и генетического разнообразия респираторно-синцитиального вируса человека в период с 2021 по 2024 г.

DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2025.15.1.90-97

Яцышина С.Б., Мамошина М.В., Елькина М.А., Стрельцова С.Ю., Буланенко В.П., Пика М.И., Акимкин В.Г.
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва

Цель исследования. Изучение распространенности и динамики циркуляции респираторно-синцитиального вируса (РСВ) в постпандемийные годы в России, а также оценка генетического разнообразия вируса на основе последовательности гена G согласно классификации, предложенной в 2024 г.
Материалы и методы. Проведен анализ суммарных данных выборочных лабораторных исследований в еженедельной динамике биоматериала 4 667 302 больных острой респираторной инфекцией из 89 регионов России. Дети до 6 лет составили 38,5% от общего числа обследованных. Дифференциацию РСВ-А и РСВ-В проводили с помощью разработанной методики амплификации гена G с детекцией в режиме реального времени. Кодирующая область гена G РСВ секвенирована методом Сэнгера для 32 образцов РНК вируса, обнаруженных в разные эпидемические сезоны у больных в г. Москве. Нуклеотидные последовательности депонированы в российскую базу VGARus (Virus Genome Aggregator of Russia) и международную базу данных GISAID. Филогенетический анализ выполняли с помощью программы MEGA7 по алгоритму TN93+G, бутстрэп 1000.
Результаты. Максимальная частота обнаружения РСВ во все сезоны регистрировалась у младенцев и, в совокупности, у детей младшего возраста, минимальная – у лиц в возрасте 16–25 и 26–64 года. За годы наблюдения РСВ обнаруживался круглогодично с периодами подъема и спада. У лиц старше 65 лет РСВ обнаруживался чаще, чем в группе лиц в возрасте 26–64 года. В сезоне 2021–2022 гг. четко выраженные пики отсутствовали, циркулировали РСВ-А клайдов A.D.3 и A.D.5.1. В постпандемийный сезон 2022–2023 гг., так же, как и в Европе, подъем заболеваемости РСВ-инфекцией отмечали в осенние месяцы. В это время произошла смена в циркуляции РСВ-А на РСВ-В (клайд В.D.Е.1). В сезоне 2023–2024 гг. отмечен сдвиг подъема заболеваемости на зимний период с резким скачком более чем в 2 раза на пике (9-я неделя 2024 г.), который был связан с появлением РСВ-А и, по-видимому, нового для России его генетического варианта A.D.5.2, с сохранением ранее циркулировавших антигенных вариантов подтипа А (А.D.1, А.D.3) и подтипа В (В.D.Е.1).
Заключение. Разработанный протокол дифференцировки подтипов РСВ (A и B) не требует трудоемких вирусологических исследований и может быть предложен для совершенствования эпидемиологического надзора за РСВ-инфекцией. За период наблюдения РСВ обнаруживался круглогодично, на этом фоне отмечены 2 резких пика подъема заболеваемости РСВ-инфекцией, которые были связаны с чередованием циркуляции РСВ-В и РСВ-А и появлением новых генетических вариантов, не являющихся эндемичными, а обнаруженных и в других странах мира. Подобно вирусам гриппа, эволюция РСВ представляет собой глобальный процесс распространения генетических вариантов по всему миру, поэтому для профилактики тяжелого течения инфекции в группах риска может применяться единая стратегия иммунизации.

Ключевые слова: ген G, генетическое разнообразие, филогенетический анализ, сезонность, респираторно-синцитиальный вирус, распространенность

Полный текст статьи доступен
в "Библиотеке Врача"

Литература

1. Bianchini S., Silvestri E., Argentiero A., Fainardi V., Pisi G., Esposito S. Role of Respiratory Syncytial Virus in Pediatric Pneumonia. Microorganisms 2020; 8(12): 2048–2061. DOI: 10.3390/microorganisms8122048

2. Tseng H.F., Sy L.S., Ackerson B., Solano Z., Slezak J., Luo Y. et al. Severe Morbidity and Short- and Mid- to Long-term Mortality in Older Adults Hospitalized with Respiratory Syncytial Virus Infection. J. Infect. Dis. 2020; 222(8): 1298–1310. DOI: 10.1093/infdis/jiaa361

3. Wang X., Li Y., Shi T., Bont L.J., Chu H.Y., Zar H.J. et al. Respiratory Virus Global Epidemiology Network; RESCEU investigators. Global disease burden of and risk factors for acute lower respiratory infections caused by respiratory syncytial virus in preterm infants and young children in 2019: a systematic review and meta-analysis of aggregated and individual participant data. Lancet 2024; 403(10433): 1241–1253. DOI: 10.1016/S0140-6736(24)00138-7

4. Hall C.B., Weinberg G.A., Blumkin A.K., Edwards K.M., Staat M.A., Schultz A.F. et al. Respiratory syncytial virus-associated hospitalizations among children less than 24 months of age. Pediatrics 2013; 132(2): e341–348. DOI: 10.1542/peds.2013-0303

5. Mazela J., Jackowska T., Czech M., Helwich E., Martyn O., Aleksiejuk P. et al. Epidemiology of Respiratory Syncytial Virus Hospitalizations in Poland: An Analysis from 2015 to 2023 Covering the Entire Polish Population of Children Aged under Five Years. Viruses 2024; 16(5): 704–712. DOI: 10.3390/v16050704

6. Rosas-Salazar C., Chirkova T., Gebretsadik T., Chappell J.D., Peebles R.S., Dupont W.D. et al. Respiratory syncytial virus infection during infancy and asthma during childhood in the USA (INSPIRE): a population-based, prospective birth cohort study. Lancet 2023; 401(10389): 1669–1680. DOI: 10.1016/S0140-6736(23)00811-5

7. Gatt D., Martin I., AlFouzan R., Moraes T.J. Prevention and Treatment Strategies for Respiratory Syncytial Virus (RSV). Pathogens 2023; 12(2): 154–170. DOI: 10.3390/pathogens12020154

8. Маслов Д.Е., Осипов И.Д., Васиховская В.А., Забелина Д.С., Мещеряков Н.И., Карташов М.Ю. и др. Респираторно-синцитиальный вирус: биология, генетическое разнообразие и перспективные средства борьбы. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология 2024; 42(1): 16–24. DOI: 10.17116/molgen20244201116

Maslov D.E., Osipov I.D., Vasikhovskaya V.A., Zabelina D.S., Meshcheryakov N.I., Kartashov M.Yu. et al.

DOI: 10.17116/molgen20244201116

9. Yu J.M., Fu Y.H., Peng X.L., Zheng Y.P., He J.S. Genetic diversity and molecular evolution of human respiratory syncytial virus A and B. Sci. Rep. 2021; 11(1): 12941–12951. DOI: 10.1038/s41598-021-92435-1

10. Ramaekers K., Rector A., Cuypers L., Lemey P., Keyaerts E., van Ranst M. Towards a unified classification for human respiratory syncytial virus genotypes. Virus Evol. 2020; 6(2): veaa052–veaa062. DOI: 10.1093/ve/veaa052

11. Goya S., Ruis C., Neher R.A., Meijer A., Aziz A., Hinrichs A.S. et al. Standardized Phylogenetic Classification of Human Respiratory Syncytial Virus below the Subgroup Level. Emerg. Infect. Dis. 2024; 30(8): 1631–1641. DOI: 10.3201/eid3008.240209

12. Li Y., Reeves R.M., Wang X., Bassat Q., Brooks W.A., Cohen C. et al. RSV Global Epidemiology Network; RESCEU investigators. Global patterns in monthly activity of influenza virus, respiratory syncytial virus, parainfluenza virus, and metapneumovirus: a systematic analysis. Lancet Glob. Health. 2019; 7(8): e1031–e1045. DOI: 10.1016/S2214-109X(19)30264-5

13. Kampmann B., Madhi S.A., Munjal I., Simões E.A.F., Pahud B.A., Llapur C. et al. Bivalent Prefusion F Vaccine in Pregnancy to Prevent RSV Illness in Infants. N. Engl. J. Med. 2023; 388(16): 1451–1464. DOI: 10.1056/NEJMoa2216480

Об авторах / Для корреспонденции

Яцышина Светлана Борисовна – к.б.н., заведующая лабораторией молекулярной диагностики и эпидемиологии инфекций дыхательных путей, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; svetlana.yatsyshina@pcr.ms; https://orcid.org/0000-0003-4737-941X
Мамошина Марина Васильевна – младший научный сотрудник лаборатории молекулярной диагностики и эпидемиологии инфекций дыхательных путей, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; mamoshina@cmd.su; https://orcid.org/0000-0002-1419-7807
Елькина Мария Александровна – научный сотрудник лаборатории молекулярной диагностики и эпидемиологии инфекций дыхательных путей, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; melkina@cmd.su; https://orcid.org/0000-0003-4769-6781
Стрельцова Светлана Юрьевна – лаборант-исследователь лаборатории молекулярной диагностики и эпидемиологии инфекций дыхательных путей, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; klementeva@cmd.su; https://orcid.org/0009-0005-5738-6332
Буланенко Виктория Петровна – научный сотрудник лаборатории биотехнологии и молекулярной биологии, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; bulanenko@cmd.su; https://orcid.org/0000-0001-7055-1762
Пика Мария Игоревна – младший научный сотрудник лаборатории биотехнологии и молекулярной биологии, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; m.zotova@cmd.su; https://orcid.org/0000-0002-3279-6811
Акимкин Василий Геннадьевич – академик РАН, д.м.н., профессор, директор, Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия; akimkin@cmd.su; https://orcid.org/0000-0003-4228-9044

Анализ распространенности и генетического разнообразия респираторно-синцитиального вируса человека в период с 2021 по 2024 г.

Литература

Об авторах / Для корреспонденции

Похожие статьи