Первые данные о распространенности в России хромосомно-интегрированного Human betaherpesvirus 6А/B, передаваемого по наследству


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2019.4.43-50

Домонова Э.A., Сильвейстрова О.Ю., Гоптарь И.А., Кулешов К.В., Никифорова А.В., Матосова С.В., Шипулина О.Ю.

1) ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; 2) ФГБУН «Научно-исследовательский институт медицины труда имени академика Н.Ф. Измерова», Москва, Россия
Цель исследования. Изучение распространенности в России наследуемого хромосомно-интегрированного вируса герпеса человека 6А/В (хиВГЧ-6А/В)
Методы. Обследовано 262 условно здоровых человека, проживающих в Москве и Московской области, а также 3 члена одной семьи для установления наследственной передачи вируса. Использованы диагностические и научно-поисковые методы: ПЦР в режиме реального времени, секвенирование по Сэнгеру, массовое параллельное секвенирование.
Результаты. В крови ДНК ВГЧ-6A/B обнаружена в 5,7% (15/262) случаев. Концентрация ДНК ВГЧ-6A/B составляла < 1,0 lg копий/105 клеток у 12 (4,6%) человек; 1,0–2,0 – у 2 (0,8%); > 5,0 – у 1 (0,4%). У 1 обследуемого хиВГЧ6-В-статус верифицирован ПЦР-анализом волосяных луковиц и ногтевых пластин. При расшифровке данного случая установлена наследственная передача в 3 поколениях: мать–дочь–внук. Проведенный филогеномный анализ показал, что выделенные российские клинические эндогенные изоляты сформировали уникальную монофилитическую ветвь в пределах клады, представленной преимущественно изолятами хиВГЧ-6В из Европы.
Заключение. Получены предварительные данные о частоте выявления в России хиВГЧ-6A/B, передаваемого по наследству. Распространенность наследуемого хиВГЧ-6B составила 0,4% (1/262; 95% ДИ 0–2,1). хиВГЧ-6B, передаваемый по наследству, обнаружен и лабораторно подтвержден в 3 поколениях. Эндогенный хиВГЧ-6А не выявлен. Для понимания генетического разнообразия и географической стратификации хиВГЧ-6A и -6B, передаваемых по наследству, в России необходимы дальнейшие широкомасштабные исследования.
Ключевые слова: Human betaherpesvirus 6А/В, вирус герпеса человека 6А/В, хромосомная интеграция, наследование, распространение

Литература


  1. Agut H., Bonnafous P., Gautheret-Dejean A. Update on infections with Human herpesviruses 6A, 6B and 7. Médecine et Maladies Infectieuses 2017; 47(2): 83–91. DOI: 10.1016/j.medmal.2016.09.004

  2. Arbuckle J.H., Medveczky M.M., Luka J., Hadley S.H., Luegmayr A., Ablashi D., Lund T.C., Tolar J., De Meirleir K., Montoya J.G., Komaroff A.L., Ambros P.F., Medveczky P.G. The latent human herpesvirus-6A genome specifically integrates in telomeres of human chromosomes in vivo and in vitro. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010; 107(12): 5563–8. DOI: 10.1073/pnas.0913586107

  3. Telford M., Navarro A., Santpere G. Whole genome diversity of inherited chromosomally integrated HHV-6 derived from healthy individuals of diverse geographic origin. Sci. Rep. 2018; 8(1): 3472. DOI: 10.1038/s41598-018-21645-x

  4. Nacheva E.P., Ward K.N., Brazma D., Virgili A., Howard J., Leong H.N., Clark D.A. Human herpesvirus 6 integrates within telomeric regions as evidenced by five different chromosomal sites. J. Med. Virol. 2008; 80(11): 1952–8. DOI: 10.1002/jmv.21299

  5. Gravel А., Hall C., Flamand L. Sequence analysis of transplacentally acquired human herpesvirus 6 DNA is consistent with transmission of a chromosomally integrated reactivated virus. J. Infect. Dis. 2013; 207(10): 1585–9. DOI: 10.1093/infdis/jit060

  6. Мелехина Е.В., Домонова Э.А., Гоптарь И.А., Шипулина О.Ю., Горелов А.В. Первый в России случай наследственной передачи хромосомно-интегрированного вируса герпеса человека 6В (Human betaherpesvirus 6В). Вопросы практической педиатрии 2019; 14(1): 33–40.Melekhina E.V., Domonova E.A., Goptar I.A., Shipulina O.Yu., Gorelov A.V.

  7. Мелехина Е.В., Черкасова С.В., Домонова Э.А., Сильвейстрова О.Ю., Кулешов К.В., Гоптарь И.А., Шипулина О.Ю., Горелов А.В., Чугунова О.Л. Наследуемая хромосомная интеграция Human betaherpesvirus 6B у недоношенных новорожденных. Педиатрия 2019; 98(2): 28–34. Melekhina E.V., Cherkasova S.V., Domonova E.A., Silveystrova O.Yu., Kuleshov K.V., Goptar I.A., Shipulina O.Yu., Gorelov A.V., Chugunova O.L.

  8. Flamand L. Chromosomal integration by human herpesviruses 6A and 6B. Adv. Exp. Med. Biol. 2018; 1045: 209–26. DOI: 10.1007/978-981-10-7230-7_10

  9. Zhang E., Cotton V.E., Hidalgo–Bravo A., Huang Y., Bell A.J., Jarrett R.F., Wilkie G.S., Davison A.J., Nacheva E.P., Siebert R., Majid A., Kelpanides I., Jayne S., Dyer M.J., Royle N.J. HHV-8-unrelated primary effusion-like lymphoma associated with clonal loss of inherited chromosomally-integrated human herpesvirus-6A from the telomere of chromosome 19q. Sci. Rep. 2016; 6: 22730. DOI: 10.1038/srep22730

  10. Домонова Э.А., Сильвейстрова О.Ю., Гоптарь И.А., Кулешов К.В., Пасхина И.Н., Никифорова А.В., Шипулина О.Ю., Маркелов М.Л., Шипулин Г.А., Малеев В.В. Первый случай выявления и лабораторного подтверждения наследственной передачи хромосомно-интегрированного Human betaherpesvirus 6А в Российской Федерации. Инфекционные болезни 2019; 17(3): 4–15. DOI: 10.20953/1729-9225-2019-3-5-14Domonova EA, Silveystrova O.Yu., Goptar I.A., Kuleshov K.V., Paskhina I.N., Nikiforova A.V., Shipulina O.Yu., Markelov M.L., Shipulin G.A., Maleev V.V. The first case of detection and laboratory confirmation of the inherited chromosomally integrated Human betaherpesvirus 6A in Russia. Infectious diseases. 2019; 17(3): 4–15. (In Russ.). DOI: 10.20953/1729-9225-2019-3-5-14

  11. Luppi M., Marasca R., Barozzi P., Ferrari S., Ceccherini–Nelli L., Batoni G., Merelli E., Torelli G. Three cases of human herpesvirus–6 latent infection: integration of viral genome in peripheral blood mononuclear cell DNA. J. Med. Virol. 1993; 40(1): 44–52. DOI: 10.1002/jmv.1890400110

  12. Daibata M., Taguchi T., Taguchi H., Miyoshi I. Integration of human herpesvirus 6 in a Burkitt’s lymphoma cell line. Br. J. Haematol. 1998; 102(5):1307–13. DOI: 10.1046/j.1365-2141.1998.00903.x

  13. Morris C., Luppi M., McDonald M., Barozzi P., Torelli G. Fine mapping of an apparently targeted latent human herpesvirus type 6 integration site in chromosome band 17p13.3. J. Med. Virol. 1999; 58(1): 69–75. DOI: 10.1002/(sici)1096-9071(199905)58:1<69::aid-jmv11>3.0.co;2-3

  14. Pellett P.E., Ablashi D.V., Ambros P.F., Agut H., Caserta M.T., Descamps V., Flamand L., Gautheret–Dejean A., Hall C.B., Kamble R.T., Kuehl U., Lassner D., Lautenschlager I., Loomis K.S., Luppi M., Lusso P., Medveczky P.G., Montoya J.G., Mori Y., Ogata M., Pritchett J.C., Rogez S., Seto E., Ward K.N., Yoshikawa T., Razonable R.R. Chromosomally integrated human herpesvirus 6: questions and answers. Rev. Med. Virol. 2012; 22(3): 144–55. DOI: 10.1002/rmv.715

  15. Huang Y., Hidalgo–Bravo A., Zhang E., Cotton V.E., Mendez-Bermudez A., Wig G., Medina–Calzada Z., Neumann R., Jeffreys A.J., Winney B., Wilson J.F., Clark D.A., Dyer M.J., Royle N.J. Human telomeres that carry an integrated copy of human herpesvirus 6 are often short and unstable, facilitating release of the viral genome from the chromosome. Nucleic Acids Res. 2014; 42(1): 315–27. DOI: 10.1093/nar/gkt840

  16. Gravel A., Dubuc I., Morissette G., Sedlak R.H., Jerome K.R., Flamand L. Inherited chromosomally integrated human herpesvirus 6 as a predisposing risk factor for the development of angina pectoris. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2015; 112(26): 8058–63. DOI: 10.1073/pnas.1502741112

  17. Clark D.A. Clinical and laboratory features of human herpesvirus 6 chromosomal integration. Clin. Microbiol. Infect. 2016; 22(4): 333–9. DOI: 10.1016/j.cmi.2015.12.022

  18. Leong H.N., Tuke P.W., Tedder R.S., Khanom A.B., Eglin R.P., Atkinson C.E. Atkinson C.E., Ward K.N., Griffiths P.D., Clark D.A. The prevalence of chromosomally integrated human herpesvirus 6 genomes in the blood of UK blood donors. J. Med. Virol. 2007; 79: 45–51. DOI: 10.1002/jmv.20760

  19. Hubacek P., Muzikova K., Hrdlickova A., Cinek O., Hyncicova K., Hrstkova H., Sedlacek P., Stary J. Prevalence of HHV-6 integrated chromosomally among children treated for acute lymphoblastic or myeloid leukemia in the Czech Republic. J. Med. Virol. 2009; 81(2): 258–63. DOI: 10.1002/jmv.21371

  20. Hubacek P., Hrdlickova A., Spacek M., Zajac M., Muzikova K., Sedlacek P, Cetkovsky P. Prevalence of chromosomally integrated HHV-6 in patients with malignant disease and healthy donors in the Czech Republic. Folia Microbiologica 2013; 58(1), 87–90. DOI: 10.1007/s12223-012-0180-z

  21. Miura H., Kawamura Y., Hattori F., Kozawa K., Ihira M., Ohye T., Kurahashi H., Yoshikawa T. Chromosomally integrated human herpesvirus 6 in the Japanese population. J. Med. Virol. 2018; 90(10): 1636–42. DOI: 10.1002/jmv.25244

  22. Tanaka-Taya K., Sashihara J., Kurahashi H., Amo K., Miyagawa H., Kondo K., Okada S., Yamanishi K. Human herpesvirus 6 (HHV-6) is transmitted from parent to child in an integrated form and characterization of cases with chromosomally integrated HHV-6 DNA. J. Med. Virol. 2004; 73(3): 465–73. DOI: 10.1002/jmv.20113

  23. Hill J.A., HallSedlak R., Magaret A., Huang M.L., Zerr D.M., Jerome K.R., Boeckh M. Efficient identification of inherited chromosomally integrated human herpesvirus 6 using specimen pooling. J. Clin. Virol. 2016; 77: 71–6. DOI: 10.1016/j.jcv.2016.02.016

  24. Zhang E., Bell A.J., Wilkie G.S., Suárez N.M., Batini C., Veal C.D., Armendáriz–Castillo I., Neumann R., Cotton V.E., Huang Y., Porteous D.J., Jarrett R.F., Davison A.J., Royle N.J. Inherited chromosomally integrated human herpesvirus 6 genomes are ancient, intact, and potentially able to reactivate from telomeres. J. Virol.; 2017; 91(22): 1137–17. DOI: 10.1128/JVI.01137-17


Об авторах / Для корреспонденции


Домонова Эльвира Алексеевна – к.б.н., старший научный сотрудник отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; e-mail: elvira.domonova @pcr.ms; ORCID: http://orcid.org/0000-0001-8262-3938
Сильвейстрова Ольга Юрьевна – младший научный сотрудник отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; e-mail: olga.silveystrova@pcr.ms; ORCID: https://orcid.org/0000-0001-8412-9765
Гоптарь Ирина Александровна – к.х.н., старший научный сотрудник лаборатории постгеномных технологий ФГБУН «Научно-исследовательский институт медицины труда имени академика Н.Ф. Измерова», Москва, Россия; e-mail: probirka@list.ru; ORCID: https://orcid.org/0000-0002-7445-8044
Кулешов Константин Валерьевич – к.б.н., старший научный сотрудник отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; e-mail: konstantinkul@gmail.com; ORCID: http://orcid.org/0000-0002-5238-7900
Никифорова Анастасия Владимировна – младший научный сотрудник лаборатории постгеномных технологий ФГБУН «Научно-исследовательский институт медицины труда имени академика Н.Ф. Измерова», Москва, Россия; e-mail: utkina. anastasia@gmail.com; ORCID: http://orcid.org/0000-0001-6279-2101
Матосова Светлана Владимировна, младший научный сотрудник отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; e-mail: svetlana.matosova@cmd.su; ORCID: http://orcid.org/0000-0001-5158-1755
Шипулина Ольга Юрьевна – к.м.н., руководитель подразделения молекулярных методов диагностики отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия; e-mail: olga.shipulinа@pcr.ms; ORCID: https://orcid.org/0000-0003-4679-6772


Бионика Медиа