Organization and conduct of microbiological monitoring of pathogens of healthcare-associated infections in a medical organization


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/epidem.2025.15.4.115-121

Orlova O.A., Tutelyan A.V.

1) Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being, Moscow, Russia; 2) N.I. Pirogov National Medical and Surgical Center, Ministry of Healt of the Russia, Moscow, Russia; 3) Honorary Academician N.F. Gamaleya National Research Center for Epidemiology and Microbiology, Moscow, Russia
In the epidemiological surveillance system for healthcare-associated infections, microbiological monitoring is aimed at the timely detection of early signs of complications and the control of microorganisms circulating in hospitals with multi- and extreme resistance to antimicrobials.
Objective. Development of an algorithm for implementing a microbiological monitoring system in healthcare organizations.
Materials and methods. The methods used in several healthcare organizations in the Russian Federation were optimized in accordance with modern requirements.
Results. Organizing and implementing microbiological monitoring is a complex task that includes the selection and training of specialists, the inclusion of patients in high-risk departments, sanitary and bacteriological monitoring of the hospital environment, reporting and analysis of its results, and decision-making based on the results.
Conclusion. The methodology for implementing microbiological monitoring in the practical activities of a healthcare organization requires a clearly defined system with algorithmic implementation of all processes.

Literature


1. Гординская Н.А., Бруснигина Н.Ф., Алексеева А.Е., Борискина Е.В., Махова М.А., Шкуркина И.С. Микробиологический мониторинг в системе эпидемиологического надзора за инфекциями, вызванными Pseudomonas aeruginosa. Здоровье населения и среда обитания 2025; 33(1): 73–81. DOI:10.35627/2219-5238/2025-33-1-73-81


Gordinskaya N.A., Brusnigina N.F., Alekseeva A.E., Boriskina E.V., Makhova M.A., Shkurkina I.S. (Microbio­logical Monitoring within the System of Epidemiological Surveillance of Infections Caused by Pseudomonas aeruginosa). Public Health and Life Environment 2025; 33(1):73–81. (In Russ.). DOI:10.35627/2219-5238/2025-33-1-73-81


2. Зубрицкий В.Ф., Земляной А.Б., Михайлов Д.Ю., Фоминых Е.М., Матвеев Д.А., Селезнев В.В. и др. Обобщение результатов создания формуляров антимикробной терапии на основе микробиологического мониторинга. Вестник медицинского института непрерывного образования 2023; 3(2): 46–52. DOI: 10.36107/2782-1714_2023-3-2-46-52


Zubritsky V.F., Zemlyanoy A.B., Mikhailov D.Yu., Fominy'x E.M., Matveev D.A., Seleznev V.V. et al. (Summarizing the results of creating formularies of antimicrobial therapy based on microbiological monitoring). Bulletin of the Medical Institute of Continuing Education 2023; 3(2): 46–52. (In Russ.). DOI: 10.36107/2782-1714_2023-3-2-46-52


3. Якубцевич Р.Э., Лемеш А.В., Чернова H.Н., Балла А.А., Арутюнян Д.Э., Казукевич А.А. Анализ микробиологического мониторинга возбудителей нозокомиальных инфекций в отделениях интенсивной терапии хирургического и терапевтического профиля. Медицинский журнал 2022; (3): 137–142. DOI: 10.51922/1818-426X.2022.3.137


Yakubcevich R.E., Lemesh A.V., Chernova N.N., Balla A.A., Arutyunyan D.E., Kazukevich A.A. (Analysis of microbiological monitoringof excitation of hospital infections in the intensive care unit of surgical and therapeutic). Medical Journal 2022; (3): 137–142. (In Russ.). DOI: 10.51922/1818-426X.2022.3.137


4. Боброва О.П., Фетисов А.О., Зырянов С.К. Микробиологический мониторинг многопрофильной медицинской организации: основа стратегического планирования в рамках реализации эпидемиологической безопасности. Качественная клиническая практика 2023; (4): 86–95. DOI: 10.37489/2588-0519-2023-4-86-95


Bobrova O.P., Fetisov A.O., Zyryanov S.K. (Microbiological monitoring of a multidisciplinary medical organization: the basis of strategic planning in the framework of the implementation of epidemiological safety). Kachestvennaya Klinicheskaya Praktika = Good Clinical Practice 2023; (4): 86–95. (In Russ.). DOI:10.37489/2588-0519-2023-4-86-95


5. Иванов Ф.В., Гумилевский Б.Ю. Микробиологический мониторинг инфекции, связанной с оказанием медицинской помощи. Клиническая лабораторная диагностика 2023; 12(138): 1–8. DOI: 10.23670/IRJ. 2023. 138.210


Ivanov F.V., Gumilevskii B.Y. (Microbiological monitoring of healthcare-associated infections). Klinicheskaya Laboratornaya Diagnostika 2023; 12(138): 1–8. (In Russ.). DOI: 10.23670/IRJ.2023.138.210


6. Аубакирова А.Т., Абдилова Г.Б., Сатылганкызы Г., Катаева К.Т., Бекмухамедова А.Е. Микробиологический мониторинг внутрибольничной инфекции в хирургическом стационаре. Вестник КазНМУ 2021; (3): 235–239. DOI: 10.53065/kaznmu.2021.43.89.046


Aubakirova A.T., Abdilova G.B., Satylgankyzy G., Kataeva K.T., Bekmukhamedova A.E. (Microbiological monitoring of intrahospital infection in surgical hospital). Vestnik KazNMU. 2021; (3): 235–239. (In Russ.). DOI: 10.53065/kaznmu.2021.43.89.046


7. Кулагина Л.Ю., Валиуллина И.Р., Кадысева Э.Р., Шикалева А.А. Особенности антибиотикорезистентности по данным микробиологического мониторинга в многопрофильном стационаре. Практическая медицина 2021; 19(4): 79–83. DOI: 10.32000/2072-1757-2021-4-79-83


Kulagina L.Yu., Valiullina I.R., Kadyseva E.R., Shikaleva A.A. (Features of antibiotic resistance by the data of microbiological monitoring in a multi-profile hospital). Practical medicine 2021; 19(4): 79–83. (In Russ.). DOI: 10.32000/2072-1757-2021-4-79-83


8. Степанова Т.Ф., Катаева Л.В., Посоюзных О.В., Богун А.Г., Кисличкина А.А., Tran Thi Nhai. Структура ESKAPE-патогенов, изолированных от пациентов отделения реанимации и интенсивной терапии новорождённых Национального госпиталя педиатрии г. Ханой, Социалистическая Республика Вьетнам. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии 2023; 100(2): 168–177. DOI: 10.36233/0372-9311-329 EDN


Stepanova T.F., Kataeva L.V., Posoyuznykh O.V., Bogun A.G., Kislichkina A.A., Tran Thi Nhai. (The structure of ESKAPE pathogens isolated from patients of the neonatal intensive care unit at the National Hospital of Pediatrics in Hanoi, the Socialist Republic of Vietnam). Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology 2023; 100(2): 168–177. (In Russ.). DOI: 10.36233/0372-9311-329


9. Зинбай Ф.А., Нуралим М.Н., Дюсенгалиева С.Т. Роль микробиологического мониторинга в многопрофильном стационаре г. Алматы. Научный медицинский вестник Центрального Черноземья 2023; (9): 6–10. DOI: 10.18499/1990-472X-2023-1-91-6-10


Zinbai F.A., Nuralim M.N., Dyusengalieva S.T. (Role of microbiological monitoring in Almaty multidisciplinary hospital). Scientific Medical Bulletin of the Central Chernozem Region 2023; (9): 6–10. (In Russ.) DOI: 10.18499/1990-472X-2023-1-91-6-10


10. Tacconelli E., Cataldo M.A., Dancer S.J., Angelis G.D., Falcone M., Frank U. et al. ESCMID guidelines for the management of the infection control measures to reduce transmission of multidrug-resistant Gram-negative bacteria in hospitalized patients. Clin. Microbiol. Infect. 2014; 20(suppl 1): 1–55. DOI: 10.1111/1469-0691.12427


11. Gudiol C., Tubau F., Calatayud L., Garcia-Vidal C., Cisnal M., Sánchez-Ortega I. et al. Bacteraemia due to multidrug-resistant Gram-negative bacilli in cancer patients: risk factors, antibiotic therapy and outcomes. J. Antimicrob. Chemother. 2011; 66: 657– 663. DOI: 10.1093/jac/dkq494


12. McGinigle K.L., Gourlay M.L., Buchanan I.B. The use of active surveillance cultures in adult intensive care units to reduce methicillin-resistant Staphylococcus aureus–related morbidity, mortality, and costs: a systematic review. Clin. Infect. Dis. 2008; 46(11): 1717–1725. DOI: 10.1086/587901


13. Muto C.A., Jernigan J.A., Ostrowsky B.E., Richet H.M., Jarvis W.R., Boyce J.M. et al. SHEA guideline for preventing nosocomial transmission of multidrug-resistant strains of Staphylococcus aureus and enterococcus. Infect. Control. Hosp. Epidemiol. 2003; 24: 362–386. DOI: 10.1086/502213


14. Arnan M., Gudiol C., Calatayud L., Liñares J., Dominguez M.Á., Batlle M. et al. Risk factors for, and clinical relevance of, faecal extended-spectrum beta-lactamase producing Escherichia coli (ESBL-EC) carriage in neutropenic patients with haematological malignancies. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2011; 30: 355–360. DOI: 10.1007/s10096-010-1093-x


15. Стрелкова Д.А., Рачина С.А., Кулешов В.Г., Бурмистрова Е.Н., Сычев И.Н., Ананичева Н.А. и др. Микробиологический мониторинг пациентов с COVID-19 в ОРИТ: проспективное наблюдательное исследование. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия 2022; 24(3): 274–282. DOI: 10.36488/cmac.2022.3.274282


Strelkova D.A., Rachina S.A., Kuleshov V.G., Burmistrova E.N., Sychev I.N., Ananicheva N.A. et al. (Microbiological monitoring of COVID-19 patients in the ICU: a prospective observational study). Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy 2022; 24(3): 274–282. (In Russ.). DOI: 10.36488/cmac.2022.3.274282


16. Орлова О.А., Гусаров В.Г., Камышова Д.А., Петрова Л.В., Семененко Т.А. Микробиологический мониторинг пациентов в инфекционном отделении реанимации. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2025; 15(1): 67–73. DOI:10.18565/epidem.2025.15.1.67-73


Orlova O.A., Gusarov V.G., Kamyshova D.A., Petrova L.V., Semenenko T.A. (Microbiological monitoring of patients in the infectious intensive care unit). Epidemiology and Infectious Diseases. Current items 2025; 15(1): 67–73. (In Russ.). DOI:10.18565/epidem.2025.15.1.67-73


17. Артебякин С.В., Свистунов С.А., Кузин А.А., Свистунова И.А. Опыт применения микробиологических методов исследования при инфекционных осложнениях тяжёлых травм. Проблемы медицинской микологии 2022; 2(24): 43.


Artebyakin S.V., Svistunov S.A., Kuzin A.A., Svistunova I.A. (Microbiological monitoring of infectious complications of wounds and injuries). Problems in medical mycology 2022; 2(24): 43. (In Russ.).


18. Захватова А.С., Дарьина М.Г., Светличная Ю.С., Зуева Л.П., Асланов Б.И., Червякова М.А. Микробио­логический мониторинг антимикробной резистентности потенциальных возбудителей инфекций кровотока. Инфекция и иммунитет 2022; 1(12): 185–192. DOI: 10.15789/2220-7619-ARM-1552


Zakhvatova A.S., Daryina M.G., Svetlichnaya Y.S., Zueva L.P., Aslanov B.I., Chervyakova M.A. (Antimicrobial resistance monitoring of potential pathogens causing bloodstream infections). Infection and Immunity 2022; 1(12): 185–192. (In Russ.) DOI: 10.15789/2220-7619-ARM-1552


19. Бонда Н.А., Карпова Е.В., Тапальский Д.В., Стома И.О. Система микробиологического мониторинга для оценки антибиотикорезистентности возбудителей инфекций кровотока и ее генетических детерминант. Клиническая инфектология и паразитология 2023; 1(12): 6–16. DOI: 10.34883/PI.2023.12.1.021


Bonda N.A., Karpova E.V., Tapalski D.V., Stoma I.O. (Microbiological Monitoring System for Assessing the Antibiotic Resistance of Pathogens of Bloodstream Infections and its Genetic Determinants). Clinical Infectology and Parasitology 2023; 1(12): 6–16. (In Russ.). DOI: 10.34883/PI.2023.12.1.021


20. Орлова О.А., Юмцунова Н.А., Никитина Г.Ю., Семененко Т.А. Результаты проспективного эпидемиологического наблюдения за реципиентами костного мозга. Эпидемиол. инфекц. болезни. Актуал. вопр. 2022; 12(4): 45–51. DOI: 10.18565/epidem.2022.12.4.45-51


Orlova O.A., Yumtsunova N.A, Nikitina G.Yu., T.A. Semenenko T.A. (Results of prospective epidemiological surveillance of bone marrow recipients). Epidemiology and Infectious Diseases. Current items 2022; 12(4): 45–51. (In Russ.). DOI: 10.18565/epidem.2022.12.4.45-51


About the Autors


Oksana A. Orlova, MD, Leading Researcher, Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being; Epidemiologist,, Head, Department of Epidemiology, N.I. Pirogov National Medical and Surgical Center, Ministry of Health of the Russia Moscow; Senior Researcher, N.F .Gamaleya National Research Centre for Epidemiology and Microbiology, Ministry of Health of the Russia, Moscow, Russia; oksana_orlova@bk.ru; https://orcid.org/0000-0002-6701-1252
Professor Aleksey V. Tutelyan, Аcademician of the Russian Academy of Sciences, MD, Head, Laboratory of Healthcare-Associated Infections, Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being, Moscow, Russia; bio-tav@yandex.ru; http://orcid.org/0000-0002-2706-6689


Similar Articles


Бионика Медиа